|
PCR |
Name |
sequence (5’-3’) |
Anneal |
size (bp) |
MLST |
|---|---|---|---|---|---|
|
dnaA |
EAE-dnaA-F 1 |
CGTAAGCCAAATGCTAAAGTG |
56°C |
694 |
442 |
|
EAE-dnaA-R1 |
GGCAGGCTGTGGTTGGTC |
||||
|
fusA |
EAE-fusA-F 1 |
GTTCTTGATGGTGCGGTAATG |
56°C |
915 |
646 |
|
EAE-fusA-R1 |
CATACGCTCCAGAATGATCG |
||||
|
gyrB |
EAE-gyrB-F 1 |
GCGACGGCAAAGAAGACC |
56°C |
699 |
434 |
|
EAE-gyrB-R1 |
CCTGGTTCTTACGGTTACG |
||||
|
leuS |
EAE-leuS-F 1 |
CAATTCCAATGGTGACCCTG |
58°C |
882 |
578 |
|
EAE-leuS-R1 |
CGGTATTGAAGGTCTGACG |
||||
|
pyrG |
EAE-pyrG-F2 |
CGTGACCGTCAACATCAAGC |
60°C |
488 |
263 |
|
EAE-pyrG-R2 |
CTTCAATCGGTTTCAACAACA |
||||
|
rplB |
EAE-rplB-F 1 |
ATGGCAGTTGTTAAATGTAAAC |
58°C |
791 |
607 |
|
EAE-rplB-R1 |
TCAGTACGCTTGTTGCTGC |
||||
|
rpoB |
EAE-rpoB-F 1 |
GCTACCGTCTGGGCGAAC |
58°C |
805 |
545 |
|
EAE-rpoB-R1 |
TCGTTGGTGAAGAGCGTTTC |