sodA allele sequence: id-228
Contig position
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- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
ACAGGAGGAA GAATGGCTGT TTACACCCTT CCCGATCTCG ACTACGACTA CGGCGCACTG GAGCCCCACA TCTCGGGCAA GATCATGGAA CTGCACCATG ACAAGCACCA CAACACCTAC GTTCAGGGTG CCAACACCGC CCTGGAGAAG CTGGCCGAGG CCCGCGAGAA GGGCGACTTC GGAACCATCA ACAAACTCGA GAAGGACCTG GCCTTTAACC TCGGCGGCCA CATCAACCAC TCCGTGTTCT GGAAGAACAT GTCCCCTCAT GGGGGCGGTC GTCCGGAGGG CAACGAACTC GCCGCTGCGA TTGACGAGTT CTTCGGTTCC TTTGACAGCT TCAAAAAGCA GTTTGAGGAA ACCGCTAAGG GCGTTCAAGG CTCCGGTTGG GGCATGCTCG TGTGGGACGT GATGGGTCAG CGCCTCAACA CCATGCAGCT GTTTGACCAC CAGGGCAATC TGCCGTCAAC CCAGATCCCG ATCGTCCAGC TCGACATGTG GGAACACGCC TATTACCTGC AGTACCAGAA CGTCAAGGCC GACTACGTCA CTGCCTGGTG GAACGTCGTC AACTGGACCG ACGCCGAGCA GCGGTTCGTC AAGGCCCGTT CGATCACCGG TTTGTTCTGA TCCGTAGGCC CTGAAGATCC
Translation
T G G R M A V Y T L P D L D Y D Y G A L E P H I S G K I M E L H H D F1
Q E E E W L F T P F P I S T T T T A H W S P T S R A R S W N C T M F2
R R K N G C L H P S R S R L R L R R T G A P H L G Q D H G T A P * F3
1 ACAGGAGGAAGAATGGCTGTTTACACCCTTCCCGATCTCGACTACGACTACGGCGCACTGGAGCCCCACATCTCGGGCAAGATCATGGAACTGCACCATG 100
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K H H N T Y V Q G A N T A L E K L A E A R E K G D F G T I N K L E F1
T S T T T P T F R V P T P P W R S W P R P A R R A T S E P S T N S R F2
Q A P Q H L R S G C Q H R P G E A G R G P R E G R L R N H Q Q T R F3
101 ACAAGCACCACAACACCTACGTTCAGGGTGCCAACACCGCCCTGGAGAAGCTGGCCGAGGCCCGCGAGAAGGGCGACTTCGGAACCATCAACAAACTCGA 200
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K D L A F N L G G H I N H S V F W K N M S P H G G G R P E G N E L F1
R T W P L T S A A T S T T P C S G R T C P L M G A V V R R A T N S F2
E G P G L * P R R P H Q P L R V L E E H V P S W G R S S G G Q R T R F3
201 GAAGGACCTGGCCTTTAACCTCGGCGGCCACATCAACCACTCCGTGTTCTGGAAGAACATGTCCCCTCATGGGGGCGGTCGTCCGGAGGGCAACGAACTC 300
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A A A I D E F F G S F D S F K K Q F E E T A K G V Q G S G W G M L V F1
P L R L T S S S V P L T A S K S S L R K P L R A F K A P V G A C S F2
R C D * R V L R F L * Q L Q K A V * G N R * G R S R L R L G H A R F3
301 GCCGCTGCGATTGACGAGTTCTTCGGTTCCTTTGACAGCTTCAAAAAGCAGTTTGAGGAAACCGCTAAGGGCGTTCAAGGCTCCGGTTGGGGCATGCTCG 400
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W D V M G Q R L N T M Q L F D H Q G N L P S T Q I P I V Q L D M W F1
C G T * W V S A S T P C S C L T T R A I C R Q P R S R S S S S T C G F2
V G R D G S A P Q H H A A V * P P G Q S A V N P D P D R P A R H V F3
401 TGTGGGACGTGATGGGTCAGCGCCTCAACACCATGCAGCTGTTTGACCACCAGGGCAATCTGCCGTCAACCCAGATCCCGATCGTCCAGCTCGACATGTG 500
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E H A Y Y L Q Y Q N V K A D Y V T A W W N V V N W T D A E Q R F V F1
N T P I T C S T R T S R P T T S L P G G T S S T G P T P S S G S S F2
G T R L L P A V P E R Q G R L R H C L V E R R Q L D R R R A A V R Q F3
501 GGAACACGCCTATTACCTGCAGTACCAGAACGTCAAGGCCGACTACGTCACTGCCTGGTGGAACGTCGTCAACTGGACCGACGCCGAGCAGCGGTTCGTC 600
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K A R S I T G L F * S V G P E D P F1
R P V R S P V C S D P * A L K I X F2
G P F D H R F V L I R R P * R S F3
601 AAGGCCCGTTCGATCACCGGTTTGTTCTGATCCGTAGGCCCTGAAGATCC 650
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