lepA allele sequence: id-228
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGGCGCAGCA CACGAGGTGC TTGAGATTGG CGTCATATCC CCAGAAATGG TGCCGGCTCA GGGGCTGTCG GTGGGGGAGG TCGGGTACCT CATCACCGGC GTCAAGGATG TCCGTCAATC CCGAGTCGGC GACACTGTCA CCAATGCCTC CAAGCCCTCT GAGAAAGATC TTGGCGGCTA TCAGCACCCC AAACCAATGG TGTATTCGGG ACTCTTCCCG ATTGATGCCA AGGATTTCCC TGACTTGCGT GATGCTCTCG ACAAGTTGCA GCTCAACGAC GCTGCCCTGG TCTACGAGCC TGAAACCTCG ACGGCCCTGG GCTTTGGCTT TCGGGTCGGG TTCCTCGGGC TGCTGCACAT GGAGATCGTG CGCGAGCGTC TAGAGCGCGA GTTCGACCTT GACCTCATCT CCACAGCTCC CTCAGTGGTT CACCACGTCC TCATGGAAGA CGGATCGACT GTCGCCGTGA CAAACCCGTC GGAGTACCCG ACTAGCGGGC GGATCGCTGA GGTGCGTGAA CCCATCGTTG ACGCCACCAT TCTCAGTCCT GCCGAGTACA TCGGCACCAT CCTTGAGTTG TGTCAGCAGC GTCGTGGTGT TCAGCAAGGC TTGGATTATT TGTCGTCTGA TCGAGTGGAA ATCCGGTACC GT
Translation
R R S T R G A * D W R H I P R N G A G S G A V G G G G R V P H H R R F1
G A A H E V L E I G V I S P E M V P A Q G L S V G E V G Y L I T G F2
A Q H T R C L R L A S Y P Q K W C R L R G C R W G R S G T S S P A F3
1 CGGCGCAGCACACGAGGTGCTTGAGATTGGCGTCATATCCCCAGAAATGGTGCCGGCTCAGGGGCTGTCGGTGGGGGAGGTCGGGTACCTCATCACCGGC 100
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Q G C P S I P S R R H C H Q C L Q A L * E R S W R L S A P Q T N G F1
V K D V R Q S R V G D T V T N A S K P S E K D L G G Y Q H P K P M V F2
S R M S V N P E S A T L S P M P P S P L R K I L A A I S T P N Q W F3
101 GTCAAGGATGTCCGTCAATCCCGAGTCGGCGACACTGTCACCAATGCCTCCAAGCCCTCTGAGAAAGATCTTGGCGGCTATCAGCACCCCAAACCAATGG 200
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V F G T L P D * C Q G F P * L A * C S R Q V A A Q R R C P G L R A F1
Y S G L F P I D A K D F P D L R D A L D K L Q L N D A A L V Y E P F2
C I R D S S R L M P R I S L T C V M L S T S C S S T T L P W S T S L F3
201 TGTATTCGGGACTCTTCCCGATTGATGCCAAGGATTTCCCTGACTTGCGTGATGCTCTCGACAAGTTGCAGCTCAACGACGCTGCCCTGGTCTACGAGCC 300
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* N L D G P G L W L S G R V P R A A A H G D R A R A S R A R V R P * F1
E T S T A L G F G F R V G F L G L L H M E I V R E R L E R E F D L F2
K P R R P W A L A F G S G S S G C C T W R S C A S V * S A S S T L F3
301 TGAAACCTCGACGGCCCTGGGCTTTGGCTTTCGGGTCGGGTTCCTCGGGCTGCTGCACATGGAGATCGTGCGCGAGCGTCTAGAGCGCGAGTTCGACCTT 400
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P H L H S S L S G S P R P H G R R I D C R R D K P V G V P D * R A F1
D L I S T A P S V V H H V L M E D G S T V A V T N P S E Y P T S G R F2
T S S P Q L P Q W F T T S S W K T D R L S P * Q T R R S T R L A G F3
401 GACCTCATCTCCACAGCTCCCTCAGTGGTTCACCACGTCCTCATGGAAGACGGATCGACTGTCGCCGTGACAAACCCGTCGGAGTACCCGACTAGCGGGC 500
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D R * G A * T H R * R H H S Q S C R V H R H H P * V V S A A S W C F1
I A E V R E P I V D A T I L S P A E Y I G T I L E L C Q Q R R G V F2
G S L R C V N P S L T P P F S V L P S T S A P S L S C V S S V V V F F3
501 GGATCGCTGAGGTGCGTGAACCCATCGTTGACGCCACCATTCTCAGTCCTGCCGAGTACATCGGCACCATCCTTGAGTTGTGTCAGCAGCGTCGTGGTGT 600
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S A R L G L F V V * S S G N P V P X F1
Q Q G L D Y L S S D R V E I R Y R F2
S K A W I I C R L I E W K S G T V F3
601 TCAGCAAGGCTTGGATTATTTGTCGTCTGATCGAGTGGAAATCCGGTACCGT 652
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