guaA allele sequence: id-228

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493
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reverse
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no
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Illumina
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Sequence

CATTGCTGTT GAGGAGGGCA CCATTGACGC CGAGCGCGCC NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN GGCACCCCGA AGTGCACCAC ACGGAGTCCG GACAGACGGT GCTCGAGCAC TTCCTTTTCG ACATTGCCGG ATGCCGTCCT GACTGGAATG CTAGCTCGAT CGTCGGCGAC CAGATCGCGC AGATTCGTGG TCAGGTTGGT GACCGGCGCG TCATCTGCGG ACTGTCGGGC GGCGTCGATT CTGCTGTTGC TGCGGCTTTG GTGCAGCGCG CTGTGGGCGA CCAGCTCACC TGCGTTTTCG TCGATCACGG ACTGCTGCGT CAAGGGGAGG CTGAGCAAGT CAAGAATGAC TTCGTCGCCG CCACGGGCGC TGATTTGGTG GTGGCTGATG AGTCGCAGCG CTTCCTGGAT GCCCTCGCCG GGGTCACCGA TCCTGAGACC AAGCGCAAGA TCATTGGACG CGAGTTCATT CGGACCTTTG AGGATGTTGC CAAGCGTCTC AACGCTGACC AGCCGATCGA CTTCTTGGTG CAGGGAACTT TGTATCCCGA CGTCGTCGAG TCTGGTGGCG GCGAGGGCGC TGCCAATATC AAGAGCCACC ATAATGTTGG TGG

Translation


          H  C  C  *  G  G  H  H  *  R  R  A  R  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X   F1
           I  A  V  E  E  G  T  I  D  A  E  R  A  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X     F2
            L  L  L  R  R  A  P  L  T  P  S  A  P  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X    F3
        1 CATTGCTGTTGAGGAGGGCACCATTGACGCCGAGCGCGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  A  P  R  S  A  P  H  G  V  R  T  D  G  A  R  A  L  P  F  R    F1
          X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  H  P  E  V  H  H  T  E  S  G  Q  T  V  L  E  H  F  L  F  D   F2
           X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  G  T  P  K  C  T  T  R  S  P  D  R  R  C  S  S  T  S  F  S     F3
      101 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCACCCCGAAGTGCACCACACGGAGTCCGGACAGACGGTGCTCGAGCACTTCCTTTTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           H  C  R  M  P  S  *  L  E  C  *  L  D  R  R  R  P  D  R  A  D  S  W  S  G  W  *  P  A  R  H  L  R     F1
            I  A  G  C  R  P  D  W  N  A  S  S  I  V  G  D  Q  I  A  Q  I  R  G  Q  V  G  D  R  R  V  I  C  G    F2
          T  L  P  D  A  V  L  T  G  M  L  A  R  S  S  A  T  R  S  R  R  F  V  V  R  L  V  T  G  A  S  S  A  D   F3
      201 ACATTGCCGGATGCCGTCCTGACTGGAATGCTAGCTCGATCGTCGGCGACCAGATCGCGCAGATTCGTGGTCAGGTTGGTGACCGGCGCGTCATCTGCGG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          T  V  G  R  R  R  F  C  C  C  C  G  F  G  A  A  R  C  G  R  P  A  H  L  R  F  R  R  S  R  T  A  A  S   F1
           L  S  G  G  V  D  S  A  V  A  A  A  L  V  Q  R  A  V  G  D  Q  L  T  C  V  F  V  D  H  G  L  L  R     F2
            C  R  A  A  S  I  L  L  L  L  R  L  W  C  S  A  L  W  A  T  S  S  P  A  F  S  S  I  T  D  C  C  V    F3
      301 ACTGTCGGGCGGCGTCGATTCTGCTGTTGCTGCGGCTTTGGTGCAGCGCGCTGTGGGCGACCAGCTCACCTGCGTTTTCGTCGATCACGGACTGCTGCGT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  G  G  *  A  S  Q  E  *  L  R  R  R  H  G  R  *  F  G  G  G  *  *  V  A  A  L  P  G  C  P  R  R    F1
          Q  G  E  A  E  Q  V  K  N  D  F  V  A  A  T  G  A  D  L  V  V  A  D  E  S  Q  R  F  L  D  A  L  A  G   F2
           K  G  R  L  S  K  S  R  M  T  S  S  P  P  R  A  L  I  W  W  W  L  M  S  R  S  A  S  W  M  P  S  P     F3
      401 CAAGGGGAGGCTGAGCAAGTCAAGAATGACTTCGTCGCCGCCACGGGCGCTGATTTGGTGGTGGCTGATGAGTCGCAGCGCTTCCTGGATGCCCTCGCCG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  H  R  S  *  D  Q  A  Q  D  H  W  T  R  V  H  S  D  L  *  G  C  C  Q  A  S  Q  R  *  P  A  D  R     F1
            V  T  D  P  E  T  K  R  K  I  I  G  R  E  F  I  R  T  F  E  D  V  A  K  R  L  N  A  D  Q  P  I  D    F2
          G  S  P  I  L  R  P  S  A  R  S  L  D  A  S  S  F  G  P  L  R  M  L  P  S  V  S  T  L  T  S  R  S  T   F3
      501 GGGTCACCGATCCTGAGACCAAGCGCAAGATCATTGGACGCGAGTTCATTCGGACCTTTGAGGATGTTGCCAAGCGTCTCAACGCTGACCAGCCGATCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  L  G  A  G  N  F  V  S  R  R  R  R  V  W  W  R  R  G  R  C  Q  Y  Q  E  P  P  *  C  W  W            F1
           F  L  V  Q  G  T  L  Y  P  D  V  V  E  S  G  G  G  E  G  A  A  N  I  K  S  H  H  N  V  G  G           F2
            S  W  C  R  E  L  C  I  P  T  S  S  S  L  V  A  A  R  A  L  P  I  S  R  A  T  I  M  L  V  X          F3
      601 CTTCTTGGTGCAGGGAACTTTGTATCCCGACGTCGTCGAGTCTGGTGGCGGCGAGGGCGCTGCCAATATCAAGAGCCACCATAATGTTGGTGG 693
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|---

Contig position

sequence bin id
2673
contig length
3004832
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451071
end
451563
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493
orientation
reverse
complete
no
method
Illumina
Options

Sequence

TCCTTTTCGA CATTGCCGGA TGCCGTCCTG ACTGGAATGC NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN GGCACCCCGA AGTGCACCAC ACGGAGTCCG GACAGACGGT GCTCGAGCAC TTCCTTTTCG ACATTGCCGG ATGCCGTCCT GACTGGAATG CCAGCTCGAT CGTCGGCGAC CAGATCGCGC AGATTCGTGG CCAGGTTGGT GACCGGCGTG TCATCTGCGG ACTGTCGGGT GGCGTCGATT CCGCTGTCGC CGCGGCTTTG GTGCAGCGTG CTGTGGGCGA CCAGCTCACC TGTGTTTTCG TCGATCACGG ACTGCTGCGT CAAGGGGAGG CCGAGCAAGT CAAGAACGAC TTCGTCGCCG CCACGGGCGC AGATTTGGTG GTGGCTGATG AGTCCCAGCG TTTCCTGGAT GCCCTTGCCG GGGTCACCGA TCCTGAGACC AAGCGCAAGA TCATTGGACG CGAGTTCATT CGGACCTTTG AGGACGTTGC CAAGCGTCTC AATGCTGACC AGCCGATCGA CTTCTTGGTG CAGGGAACTT TATATCCCGA TGTCGTCGAG TCTGGTGGCG GTGAGGGCGC TGCCAATATC AAGAGTCACC ATAATGTTGG TGG

Translation


          S  F  S  T  L  P  D  A  V  L  T  G  M  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X   F1
           P  F  R  H  C  R  M  P  S  *  L  E  C  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X     F2
            L  F  D  I  A  G  C  R  P  D  W  N  A  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X    F3
        1 TCCTTTTCGACATTGCCGGATGCCGTCCTGACTGGAATGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  A  P  R  S  A  P  H  G  V  R  T  D  G  A  R  A  L  P  F  R    F1
          X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  H  P  E  V  H  H  T  E  S  G  Q  T  V  L  E  H  F  L  F  D   F2
           X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  X  G  T  P  K  C  T  T  R  S  P  D  R  R  C  S  S  T  S  F  S     F3
      101 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCACCCCGAAGTGCACCACACGGAGTCCGGACAGACGGTGCTCGAGCACTTCCTTTTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           H  C  R  M  P  S  *  L  E  C  Q  L  D  R  R  R  P  D  R  A  D  S  W  P  G  W  *  P  A  C  H  L  R     F1
            I  A  G  C  R  P  D  W  N  A  S  S  I  V  G  D  Q  I  A  Q  I  R  G  Q  V  G  D  R  R  V  I  C  G    F2
          T  L  P  D  A  V  L  T  G  M  P  A  R  S  S  A  T  R  S  R  R  F  V  A  R  L  V  T  G  V  S  S  A  D   F3
      201 ACATTGCCGGATGCCGTCCTGACTGGAATGCCAGCTCGATCGTCGGCGACCAGATCGCGCAGATTCGTGGCCAGGTTGGTGACCGGCGTGTCATCTGCGG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          T  V  G  W  R  R  F  R  C  R  R  G  F  G  A  A  C  C  G  R  P  A  H  L  C  F  R  R  S  R  T  A  A  S   F1
           L  S  G  G  V  D  S  A  V  A  A  A  L  V  Q  R  A  V  G  D  Q  L  T  C  V  F  V  D  H  G  L  L  R     F2
            C  R  V  A  S  I  P  L  S  P  R  L  W  C  S  V  L  W  A  T  S  S  P  V  F  S  S  I  T  D  C  C  V    F3
      301 ACTGTCGGGTGGCGTCGATTCCGCTGTCGCCGCGGCTTTGGTGCAGCGTGCTGTGGGCGACCAGCTCACCTGTGTTTTCGTCGATCACGGACTGCTGCGT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  G  G  R  A  S  Q  E  R  L  R  R  R  H  G  R  R  F  G  G  G  *  *  V  P  A  F  P  G  C  P  C  R    F1
          Q  G  E  A  E  Q  V  K  N  D  F  V  A  A  T  G  A  D  L  V  V  A  D  E  S  Q  R  F  L  D  A  L  A  G   F2
           K  G  R  P  S  K  S  R  T  T  S  S  P  P  R  A  Q  I  W  W  W  L  M  S  P  S  V  S  W  M  P  L  P     F3
      401 CAAGGGGAGGCCGAGCAAGTCAAGAACGACTTCGTCGCCGCCACGGGCGCAGATTTGGTGGTGGCTGATGAGTCCCAGCGTTTCCTGGATGCCCTTGCCG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  H  R  S  *  D  Q  A  Q  D  H  W  T  R  V  H  S  D  L  *  G  R  C  Q  A  S  Q  C  *  P  A  D  R     F1
            V  T  D  P  E  T  K  R  K  I  I  G  R  E  F  I  R  T  F  E  D  V  A  K  R  L  N  A  D  Q  P  I  D    F2
          G  S  P  I  L  R  P  S  A  R  S  L  D  A  S  S  F  G  P  L  R  T  L  P  S  V  S  M  L  T  S  R  S  T   F3
      501 GGGTCACCGATCCTGAGACCAAGCGCAAGATCATTGGACGCGAGTTCATTCGGACCTTTGAGGACGTTGCCAAGCGTCTCAATGCTGACCAGCCGATCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  L  G  A  G  N  F  I  S  R  C  R  R  V  W  W  R  *  G  R  C  Q  Y  Q  E  S  P  *  C  W  W            F1
           F  L  V  Q  G  T  L  Y  P  D  V  V  E  S  G  G  G  E  G  A  A  N  I  K  S  H  H  N  V  G  G           F2
            S  W  C  R  E  L  Y  I  P  M  S  S  S  L  V  A  V  R  A  L  P  I  S  R  V  T  I  M  L  V  X          F3
      601 CTTCTTGGTGCAGGGAACTTTATATCCCGATGTCGTCGAGTCTGGTGGCGGTGAGGGCGCTGCCAATATCAAGAGTCACCATAATGTTGGTGG 693
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|---