gmk allele sequence: id-228
Contig position
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- no
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- Illumina
Sequence
AAACGATGGC ATTGATGCGG GTCGCCAGTC GGAATACCCG CTTGGCCTCC GAATCGTCAC GAGGCAGCAC GATGGCCNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNCAG TTCGACAAGC TCGTTGACGG CGAGGGTCTC CTTGAGTGGG CAACCGTCCA TAACAGCCAC CGGTACGGCA CACCGCGCGG TCCTGTTGAA CGGGCAGTTG CTGACAATCG CACGGTCGTG CTGGAAATCG ATCTGCAGGG AGCTCGCCAA GTTCGCGAAA CCTATCCTCA GGCGACCCAG ATCTTCCTCG CGCCACCCTC ATGGGAGGAG CTAGTCCACC GTCTGATCGG TCGCGGCACG GAAACACCAG AGCAACAGAA GCAGCGTCTG GAGACTGCAA AGGTTGAGCT GGCCAACGCG GATGAATTTG ACGCCGTTGT CGTCAACGAC ACCGTAGATC ACGCAGTTGC GCATCTGGTA GAATTACTAA GTCTGTGACC ATATCTGGAG GACATTCCTT GACTGAGACC ACCCCTGAAG
Translation
K R W H * C G S P V G I P A W P P N R H E A A R W P X X X X X X X X F1
N D G I D A G R Q S E Y P L G L R I V T R Q H D G X X X X X X X X F2
T M A L M R V A S R N T R L A S E S S R G S T M A X X X X X X X X F3
1 AAACGATGGCATTGATGCGGGTCGCCAGTCGGAATACCCGCTTGGCCTCCGAATCGTCACGAGGCAGCACGATGGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 100
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X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X Q F D K L V D G F1
X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X S S T S S L T A F2
X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X V R Q A R * R F3
101 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGTTCGACAAGCTCGTTGACGG 200
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E G L L E W A T V H N S H R Y G T P R G P V E R A V A D N R T V V F1
R V S L S G Q P S I T A T G T A H R A V L L N G Q L L T I A R S C F2
R G S P * V G N R P * Q P P V R H T A R S C * T G S C * Q S H G R A F3
201 CGAGGGTCTCCTTGAGTGGGCAACCGTCCATAACAGCCACCGGTACGGCACACCGCGCGGTCCTGTTGAACGGGCAGTTGCTGACAATCGCACGGTCGTG 300
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L E I D L Q G A R Q V R E T Y P Q A T Q I F L A P P S W E E L V H R F1
W K S I C R E L A K F A K P I L R R P R S S S R H P H G R S * S T F2
G N R S A G S S P S S R N L S S G D P D L P R A T L M G G A S P P F3
301 CTGGAAATCGATCTGCAGGGAGCTCGCCAAGTTCGCGAAACCTATCCTCAGGCGACCCAGATCTTCCTCGCGCCACCCTCATGGGAGGAGCTAGTCCACC 400
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L I G R G T E T P E Q Q K Q R L E T A K V E L A N A D E F D A V V F1
V * S V A A R K H Q S N R S S V W R L Q R L S W P T R M N L T P L S F2
S D R S R H G N T R A T E A A S G D C K G * A G Q R G * I * R R C F3
401 GTCTGATCGGTCGCGGCACGGAAACACCAGAGCAACAGAAGCAGCGTCTGGAGACTGCAAAGGTTGAGCTGGCCAACGCGGATGAATTTGACGCCGTTGT 500
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V N D T V D H A V A H L V E L L S L * P Y L E D I P * L R P P L K F1
S T T P * I T Q L R I W * N Y * V C D H I W R T F L D * D H P * X F2
R Q R H R R S R S C A S G R I T K S V T I S G G H S L T E T T P E X F3
501 CGTCAACGACACCGTAGATCACGCAGTTGCGCATCTGGTAGAATTACTAAGTCTGTGACCATATCTGGAGGACATTCCTTGACTGAGACCACCCCTGAAG 600
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