tly allele sequence: id-223
Contig position
- sequence bin id
- 1424
- contig length
- 64687
- start
- 4828
- end
- 5604
- length
- 777
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGTCGTCCCG CGTGGCATGG GTGACGACGA CAACGTATCT CGAAGGGCTC GTGTCGTTCA CAAGACCACA GTAGCGGCCC ATGATATGCC CGGACGTCTG TCACCGACCC GTACGTTCCA GCAAGACGAA GTGCTCAACG TTTCCATCCT GCCCGGGCAA CGGGCTATCG CACTCGTCAC GCATACGCCA ACCCAGATCT ACCGCTGCTG CCATGACACC CGCGATGGCC TGCAAGCGCA GGGCCGGGTC CGTGACAACG CCATGGGCTC CCAAAGCCTT GCGACCAACC TCAAATTGAG GCTTCACCAG CAGCAGCATG AGGCCGTCTG GGCTGACAAC AGCTGACATG GGTTCAAGGA TCATCGTCAA GGAGATAAAA GAGACATCTC CGACCACGAG GTCCACCGGC TCAACAACGC CGTCAACCGC CAGGTCTGCA GGCTGAAGAT CACGCAAGTT CAAGCCTTCA TGAACAATGA CACGGGGATC ATTCCGCAGC ACCGGAGACA TCTGGTCGTG ACCAACATCG ACGGCATGCA CAAGTTTGGC TCCCCGTGAC AGCACAACTT GGGTGAACCC GCCGGTGGAC GCACCAGCAT CAAGCACTCT TGACGGCACT TGGACGCCAA GGATATCCAA GGCACCTAGA AGTTTGTGTG CTCCGCGAGA CACCCACACC TCTTCGTCGG CGACCAGCAC GTCGGCGGTA CTCACTTTCA TCGCCGGTTT AGTAACGACG ACTCTATTGA CCGTCACTCT GCCTTCCCGC ACTAGGCGTG TGGCAAGAGT GCGGGAACGT GCCAGTCCGG CTTCAACAAG GGCCTGGTCA AGTCTCACAG GGACAGACTG CCACCTCCGA GACCTTGGTG CATCCATCGG CGGCAGCCTC ATCCGTCGGC GTAGCAGGTC TTCTGCCACG CAGTGTCCAC AGCGTTAATC GTCGCATTGC ACTCACGTCC TGCCTGCATC TGGTGTT
Translation
Internal stop codons at positions: 344, 557, 611, 647, 773 (numbering includes upstream flanking sequence).
R R P A W H G * R R Q R I S K G S C R S Q D H S S G P * Y A R T S V F1
V V P R G M G D D D N V S R R A R V V H K T T V A A H D M P G R L F2
S S R V A W V T T T T Y L E G L V S F T R P Q * R P M I C P D V C F3
1 CGTCGTCCCGCGTGGCATGGGTGACGACGACAACGTATCTCGAAGGGCTCGTGTCGTTCACAAGACCACAGTAGCGGCCCATGATATGCCCGGACGTCTG 100
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T D P Y V P A R R S A Q R F H P A R A T G Y R T R H A Y A N P D L F1
S P T R T F Q Q D E V L N V S I L P G Q R A I A L V T H T P T Q I Y F2
H R P V R S S K T K C S T F P S C P G N G L S H S S R I R Q P R S F3
101 TCACCGACCCGTACGTTCCAGCAAGACGAAGTGCTCAACGTTTCCATCCTGCCCGGGCAACGGGCTATCGCACTCGTCACGCATACGCCAACCCAGATCT 200
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P L L P * H P R W P A S A G P G P * Q R H G L P K P C D Q P Q I E F1
R C C H D T R D G L Q A Q G R V R D N A M G S Q S L A T N L K L R F2
T A A A M T P A M A C K R R A G S V T T P W A P K A L R P T S N * G F3
201 ACCGCTGCTGCCATGACACCCGCGATGGCCTGCAAGCGCAGGGCCGGGTCCGTGACAACGCCATGGGCTCCCAAAGCCTTGCGACCAACCTCAAATTGAG 300
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A S P A A A * G R L G * Q Q L T W V Q G S S S R R * K R H L R P R G F1
L H Q Q Q H E A V W A D N S * H G F K D H R Q G D K R D I S D H E F2
F T S S S M R P S G L T T A D M G S R I I V K E I K E T S P T T R F3
301 GCTTCACCAGCAGCAGCATGAGGCCGTCTGGGCTGACAACAGCTGACATGGGTTCAAGGATCATCGTCAAGGAGATAAAAGAGACATCTCCGACCACGAG 400
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P P A Q Q R R Q P P G L Q A E D H A S S S L H E Q * H G D H S A A F1
V H R L N N A V N R Q V C R L K I T Q V Q A F M N N D T G I I P Q H F2
S T G S T T P S T A R S A G * R S R K F K P S * T M T R G S F R S F3
401 GTCCACCGGCTCAACAACGCCGTCAACCGCCAGGTCTGCAGGCTGAAGATCACGCAAGTTCAAGCCTTCATGAACAATGACACGGGGATCATTCCGCAGC 500
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P E T S G R D Q H R R H A Q V W L P V T A Q L G * T R R W T H Q H F1
R R H L V V T N I D G M H K F G S P * Q H N L G E P A G G R T S I F2
T G D I W S * P T S T A C T S L A P R D S T T W V N P P V D A P A S F3
501 ACCGGAGACATCTGGTCGTGACCAACATCGACGGCATGCACAAGTTTGGCTCCCCGTGACAGCACAACTTGGGTGAACCCGCCGGTGGACGCACCAGCAT 600
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Q A L L T A L G R Q G Y P R H L E V C V L R E T P T P L R R R P A R F1
K H S * R H L D A K D I Q G T * K F V C S A R H P H L F V G D Q H F2
S T L D G T W T P R I S K A P R S L C A P R D T H T S S S A T S T F3
601 CAAGCACTCTTGACGGCACTTGGACGCCAAGGATATCCAAGGCACCTAGAAGTTTGTGTGCTCCGCGAGACACCCACACCTCTTCGTCGGCGACCAGCAC 700
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R R Y S L S S P V * * R R L Y * P S L C L P A L G V W Q E C G N V F1
V G G T H F H R R F S N D D S I D R H S A F P H * A C G K S A G T C F2
S A V L T F I A G L V T T T L L T V T L P S R T R R V A R V R E R F3
701 GTCGGCGGTACTCACTTTCATCGCCGGTTTAGTAACGACGACTCTATTGACCGTCACTCTGCCTTCCCGCACTAGGCGTGTGGCAAGAGTGCGGGAACGT 800
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P V R L Q Q G P G Q V S Q G Q T A T S E T L V H P S A A A S S V G F1
Q S G F N K G L V K S H R D R L P P P R P W C I H R R Q P H P S A F2
A S P A S T R A W S S L T G T D C H L R D L G A S I G G S L I R R R F3
801 GCCAGTCCGGCTTCAACAAGGGCCTGGTCAAGTCTCACAGGGACAGACTGCCACCTCCGAGACCTTGGTGCATCCATCGGCGGCAGCCTCATCCGTCGGC 900
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V A G L L P R S V H S V N R R I A L T S C L H L V X F1
* Q V F C H A V S T A L I V A L H S R P A C I W C X F2
S R S S A T Q C P Q R * S S H C T H V L P A S G V F3
901 GTAGCAGGTCTTCTGCCACGCAGTGTCCACAGCGTTAATCGTCGCATTGCACTCACGTCCTGCCTGCATCTGGTGTT 977
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