sodA allele sequence: id-223
Contig position
- sequence bin id
- 1512
- contig length
- 3074
- start
- 563
- end
- 1012
- length
- 450
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
ACAGGAGGAA GAATGGCTGT TTACACCCTT CCCGATCTCG ACTACGACTA CGGCGCACTG GAGCCCCACA TCTCGGGCAA GATCATGGAA CTGCACCATG ACAAGCACCA CAACACCTAC GTTCAGGGTG CCAACACCGC CCTGGAGAAG CTGGCCGAGG CCCGCGAGAA GGGCGACTTC GGAACCATCA ACAAACTCGA GAAGGACCTG GCCTTTAACC TCGGCGGCCA CATCAACCAC TCCGTGTTCT GGAAGAACAT GTCCCCTCAT GGGGGCGGTC GTCCGGAGGG CAACGAACTC GCCGCTGCGA TTGACGAGTT CTTCGGTTCC TTTGACAGCT TCAAAAAGCA GTTTGAGGAA ACCGCTAAGG GCGTTCAAGG CTCCGGTTGG GGCATGCTCG TGTGGGACGT GATGGGTCAG CGCCTCAACA CCATGCAGCT GTTTGACCAC CAGGGCAATC TGCCGTCAAC CCAGATCCCG GTCGTCCAGC TCGACATGTG GGAACACGCT TATTACCTGC AGTACCAGAA CGTCAAGGCC GACTACGTTA CCGCCTGGTG GAACGTCGTT AGCTGGACCG ACGCCGAGCA GCGGTTCGTC AAGGCCCGTT CGATCACCGG TTTGTTCTGA TCCGTAGGCC CTGACGATCC
Translation
T G G R M A V Y T L P D L D Y D Y G A L E P H I S G K I M E L H H D F1
Q E E E W L F T P F P I S T T T T A H W S P T S R A R S W N C T M F2
R R K N G C L H P S R S R L R L R R T G A P H L G Q D H G T A P * F3
1 ACAGGAGGAAGAATGGCTGTTTACACCCTTCCCGATCTCGACTACGACTACGGCGCACTGGAGCCCCACATCTCGGGCAAGATCATGGAACTGCACCATG 100
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K H H N T Y V Q G A N T A L E K L A E A R E K G D F G T I N K L E F1
T S T T T P T F R V P T P P W R S W P R P A R R A T S E P S T N S R F2
Q A P Q H L R S G C Q H R P G E A G R G P R E G R L R N H Q Q T R F3
101 ACAAGCACCACAACACCTACGTTCAGGGTGCCAACACCGCCCTGGAGAAGCTGGCCGAGGCCCGCGAGAAGGGCGACTTCGGAACCATCAACAAACTCGA 200
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K D L A F N L G G H I N H S V F W K N M S P H G G G R P E G N E L F1
R T W P L T S A A T S T T P C S G R T C P L M G A V V R R A T N S F2
E G P G L * P R R P H Q P L R V L E E H V P S W G R S S G G Q R T R F3
201 GAAGGACCTGGCCTTTAACCTCGGCGGCCACATCAACCACTCCGTGTTCTGGAAGAACATGTCCCCTCATGGGGGCGGTCGTCCGGAGGGCAACGAACTC 300
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A A A I D E F F G S F D S F K K Q F E E T A K G V Q G S G W G M L V F1
P L R L T S S S V P L T A S K S S L R K P L R A F K A P V G A C S F2
R C D * R V L R F L * Q L Q K A V * G N R * G R S R L R L G H A R F3
301 GCCGCTGCGATTGACGAGTTCTTCGGTTCCTTTGACAGCTTCAAAAAGCAGTTTGAGGAAACCGCTAAGGGCGTTCAAGGCTCCGGTTGGGGCATGCTCG 400
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W D V M G Q R L N T M Q L F D H Q G N L P S T Q I P V V Q L D M W F1
C G T * W V S A S T P C S C L T T R A I C R Q P R S R S S S S T C G F2
V G R D G S A P Q H H A A V * P P G Q S A V N P D P G R P A R H V F3
401 TGTGGGACGTGATGGGTCAGCGCCTCAACACCATGCAGCTGTTTGACCACCAGGGCAATCTGCCGTCAACCCAGATCCCGGTCGTCCAGCTCGACATGTG 500
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E H A Y Y L Q Y Q N V K A D Y V T A W W N V V S W T D A E Q R F V F1
N T L I T C S T R T S R P T T L P P G G T S L A G P T P S S G S S F2
G T R L L P A V P E R Q G R L R Y R L V E R R * L D R R R A A V R Q F3
501 GGAACACGCTTATTACCTGCAGTACCAGAACGTCAAGGCCGACTACGTTACCGCCTGGTGGAACGTCGTTAGCTGGACCGACGCCGAGCAGCGGTTCGTC 600
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K A R S I T G L F * S V G P D D P F1
R P V R S P V C S D P * A L T I X F2
G P F D H R F V L I R R P * R S F3
601 AAGGCCCGTTCGATCACCGGTTTGTTCTGATCCGTAGGCCCTGACGATCC 650
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