guaA allele sequence: id-223

Contig position

sequence bin id
1282
contig length
84235
start
47856
end
48348
length
493
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TCCCCACACC ATCAGCGTGT GGATGAGTCA CGGCGATTCC GTCTCCCGTG CCCCGGAGGG ATTTTCGACG TTGGCCCGCA CTGCGGGTGC TCCGGTGGCG GCGTTTGAAG ACGTTGAGCG CAGACTCGTT GGCGTGCAGT GGCACCCCGA AGTGCACCAC ACGGAGTCCG GACAGACGGT GCTCGAGCAC TTCCTTTTCG ACATTGCCGG ATGCCGTCCT GACTGGAATG CCAGCTCGAT CGTCGGCGAC CAGATCGCGC AGATTCGTGG CCAGGTTGGT GACCGGCGTG TCATCTGCGG ACTGTCGGGT GGCGTCGATT CCGCTGTCGC CGCGGCTTTG GTGCAGCGTG CTGTGGGCGA CCAGCTCACC TGTGTTTTCG TCGATCACGG ACTGCTGCGT CAAGGGGAGG CCGAGCAAGT CAAGAACGAC TTCGTCGCCG CCACGGGCGC AGATTTGGTG GTGGCTGATG AGTCCCAGCG TTTCGTGGAT GCCCTTGCCG GGGTCACCGA TCCTGAGACC AAGCGCAAGA TCATTGGACG CGAGTTCATT CGGACCTTTG AGGACGTTGC CAAGCGTCTC AATGCTGACC AGCCGATCGA CTTCTTGGTG CAGGGAACTT TATATCCCGA TGTCGTCGAG TCTGGTGGCG GTGAGGGCGC TGCCAATATC AAGAGTCACC ATAATGTTGG TGG

Translation


          S  P  H  H  Q  R  V  D  E  S  R  R  F  R  L  P  C  P  G  G  I  F  D  V  G  P  H  C  G  C  S  G  G  G   F1
           P  H  T  I  S  V  W  M  S  H  G  D  S  V  S  R  A  P  E  G  F  S  T  L  A  R  T  A  G  A  P  V  A     F2
            P  T  P  S  A  C  G  *  V  T  A  I  P  S  P  V  P  R  R  D  F  R  R  W  P  A  L  R  V  L  R  W  R    F3
        1 TCCCCACACCATCAGCGTGTGGATGAGTCACGGCGATTCCGTCTCCCGTGCCCCGGAGGGATTTTCGACGTTGGCCCGCACTGCGGGTGCTCCGGTGGCG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  *  R  R  *  A  Q  T  R  W  R  A  V  A  P  R  S  A  P  H  G  V  R  T  D  G  A  R  A  L  P  F  R    F1
          A  F  E  D  V  E  R  R  L  V  G  V  Q  W  H  P  E  V  H  H  T  E  S  G  Q  T  V  L  E  H  F  L  F  D   F2
           R  L  K  T  L  S  A  D  S  L  A  C  S  G  T  P  K  C  T  T  R  S  P  D  R  R  C  S  S  T  S  F  S     F3
      101 GCGTTTGAAGACGTTGAGCGCAGACTCGTTGGCGTGCAGTGGCACCCCGAAGTGCACCACACGGAGTCCGGACAGACGGTGCTCGAGCACTTCCTTTTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           H  C  R  M  P  S  *  L  E  C  Q  L  D  R  R  R  P  D  R  A  D  S  W  P  G  W  *  P  A  C  H  L  R     F1
            I  A  G  C  R  P  D  W  N  A  S  S  I  V  G  D  Q  I  A  Q  I  R  G  Q  V  G  D  R  R  V  I  C  G    F2
          T  L  P  D  A  V  L  T  G  M  P  A  R  S  S  A  T  R  S  R  R  F  V  A  R  L  V  T  G  V  S  S  A  D   F3
      201 ACATTGCCGGATGCCGTCCTGACTGGAATGCCAGCTCGATCGTCGGCGACCAGATCGCGCAGATTCGTGGCCAGGTTGGTGACCGGCGTGTCATCTGCGG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          T  V  G  W  R  R  F  R  C  R  R  G  F  G  A  A  C  C  G  R  P  A  H  L  C  F  R  R  S  R  T  A  A  S   F1
           L  S  G  G  V  D  S  A  V  A  A  A  L  V  Q  R  A  V  G  D  Q  L  T  C  V  F  V  D  H  G  L  L  R     F2
            C  R  V  A  S  I  P  L  S  P  R  L  W  C  S  V  L  W  A  T  S  S  P  V  F  S  S  I  T  D  C  C  V    F3
      301 ACTGTCGGGTGGCGTCGATTCCGCTGTCGCCGCGGCTTTGGTGCAGCGTGCTGTGGGCGACCAGCTCACCTGTGTTTTCGTCGATCACGGACTGCTGCGT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  G  G  R  A  S  Q  E  R  L  R  R  R  H  G  R  R  F  G  G  G  *  *  V  P  A  F  R  G  C  P  C  R    F1
          Q  G  E  A  E  Q  V  K  N  D  F  V  A  A  T  G  A  D  L  V  V  A  D  E  S  Q  R  F  V  D  A  L  A  G   F2
           K  G  R  P  S  K  S  R  T  T  S  S  P  P  R  A  Q  I  W  W  W  L  M  S  P  S  V  S  W  M  P  L  P     F3
      401 CAAGGGGAGGCCGAGCAAGTCAAGAACGACTTCGTCGCCGCCACGGGCGCAGATTTGGTGGTGGCTGATGAGTCCCAGCGTTTCGTGGATGCCCTTGCCG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  H  R  S  *  D  Q  A  Q  D  H  W  T  R  V  H  S  D  L  *  G  R  C  Q  A  S  Q  C  *  P  A  D  R     F1
            V  T  D  P  E  T  K  R  K  I  I  G  R  E  F  I  R  T  F  E  D  V  A  K  R  L  N  A  D  Q  P  I  D    F2
          G  S  P  I  L  R  P  S  A  R  S  L  D  A  S  S  F  G  P  L  R  T  L  P  S  V  S  M  L  T  S  R  S  T   F3
      501 GGGTCACCGATCCTGAGACCAAGCGCAAGATCATTGGACGCGAGTTCATTCGGACCTTTGAGGACGTTGCCAAGCGTCTCAATGCTGACCAGCCGATCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  L  G  A  G  N  F  I  S  R  C  R  R  V  W  W  R  *  G  R  C  Q  Y  Q  E  S  P  *  C  W  W            F1
           F  L  V  Q  G  T  L  Y  P  D  V  V  E  S  G  G  G  E  G  A  A  N  I  K  S  H  H  N  V  G  G           F2
            S  W  C  R  E  L  Y  I  P  M  S  S  S  L  V  A  V  R  A  L  P  I  S  R  V  T  I  M  L  V  X          F3
      601 CTTCTTGGTGCAGGGAACTTTATATCCCGATGTCGTCGAGTCTGGTGGCGGTGAGGGCGCTGCCAATATCAAGAGTCACCATAATGTTGGTGG 693
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