atpD allele sequence: id-223
Contig position
- sequence bin id
- 1485
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- end
- 24176
- length
- 453
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCGTGCGAGC CATCTCCCTC AAACCGACTG ACGGTATGCG CCGCGGCACT GAGGTGCGCG ACACCGGTGC CCCGATTAGC GTGCCAGTGG GTGACGTCAC TAAGGGTCAC GTCTGGAATG TGACAGGTGA CGTTCTTAAC GCCGATCCCT CCACAATCGA GGTGACTGAG CGTTGGCCGA TCCACCGGGA TCCCCCGGCC TTCGATGACC TTGAGCCCGA GACCGAGATG CTGGAGACCG GTATTAAGGT CCTTGACTTG CTGACTCCTT ACGTCAAGGG CGGCAAGATT GGCCTCTTTG GCGGCGCTGG TGTGGGTAAG ACGGTGCTCA TTCAGGAGAT GATTTACCGT ATCGCCCACA ACTTCGGCGG TACCTCGGTT TTCGCCGGTG TCGGTGAACG TACCCGTGAG GGTAACGACC TCATCAACGA GATGGACGAG GCCGGTGTGC TCAAGGACAC CGCTCTGGTA TTCGGCCAGA TGGACGAGCC CCCGGGCACG CGTTTGCGCA TCGCTTTGAC CGGTTTGACG ATGGCTGAGT ACTTCCGCGA TGTTCAGAAC CAGGACGTGC TGTTGTTCAT CGACAACATC TTCCGGTTCT CCCAGGCTGG TTCTGAGGTT TCAACCCTGC TAGGTCGTAT GCCCTCGGCG GTG
Translation
S C E P S P S N R L T V C A A A L R C A T P V P R L A C Q W V T S L F1
R A S H L P Q T D * R Y A P R H * G A R H R C P D * R A S G * R H F2
V R A I S L K P T D G M R R G T E V R D T G A P I S V P V G D V T F3
1 TCGTGCGAGCCATCTCCCTCAAACCGACTGACGGTATGCGCCGCGGCACTGAGGTGCGCGACACCGGTGCCCCGATTAGCGTGCCAGTGGGTGACGTCAC 100
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R V T S G M * Q V T F L T P I P P Q S R * L S V G R S T G I P R P F1
* G S R L E C D R * R S * R R S L H N R G D * A L A D P P G S P G L F2
K G H V W N V T G D V L N A D P S T I E V T E R W P I H R D P P A F3
101 TAAGGGTCACGTCTGGAATGTGACAGGTGACGTTCTTAACGCCGATCCCTCCACAATCGAGGTGACTGAGCGTTGGCCGATCCACCGGGATCCCCCGGCC 200
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S M T L S P R P R C W R P V L R S L T C * L L T S R A A R L A S L F1
R * P * A R D R D A G D R Y * G P * L A D S L R Q G R Q D W P L W F2
F D D L E P E T E M L E T G I K V L D L L T P Y V K G G K I G L F G F3
201 TTCGATGACCTTGAGCCCGAGACCGAGATGCTGGAGACCGGTATTAAGGTCCTTGACTTGCTGACTCCTTACGTCAAGGGCGGCAAGATTGGCCTCTTTG 300
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A A L V W V R R C S F R R * F T V S P T T S A V P R F S P V S V N V F1
R R W C G * D G A H S G D D L P Y R P Q L R R Y L G F R R C R * T F2
G A G V G K T V L I Q E M I Y R I A H N F G G T S V F A G V G E R F3
301 GCGGCGCTGGTGTGGGTAAGACGGTGCTCATTCAGGAGATGATTTACCGTATCGCCCACAACTTCGGCGGTACCTCGGTTTTCGCCGGTGTCGGTGAACG 400
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P V R V T T S S T R W T R P V C S R T P L W Y S A R W T S P R A R F1
Y P * G * R P H Q R D G R G R C A Q G H R S G I R P D G R A P G H A F2
T R E G N D L I N E M D E A G V L K D T A L V F G Q M D E P P G T F3
401 TACCCGTGAGGGTAACGACCTCATCAACGAGATGGACGAGGCCGGTGTGCTCAAGGACACCGCTCTGGTATTCGGCCAGATGGACGAGCCCCCGGGCACG 500
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V C A S L * P V * R W L S T S A M F R T R T C C C S S T T S S G S F1
F A H R F D R F D D G * V L P R C S E P G R A V V H R Q H L P V L F2
R L R I A L T G L T M A E Y F R D V Q N Q D V L L F I D N I F R F S F3
501 CGTTTGCGCATCGCTTTGACCGGTTTGACGATGGCTGAGTACTTCCGCGATGTTCAGAACCAGGACGTGCTGTTGTTCATCGACAACATCTTCCGGTTCT 600
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P R L V L R F Q P C * V V C P R R X F1
P G W F * G F N P A R S Y A L G G X F2
Q A G S E V S T L L G R M P S A V F3
601 CCCAGGCTGGTTCTGAGGTTTCAACCCTGCTAGGTCGTATGCCCTCGGCGGTG 653
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