aroE allele sequence: id-223
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGCATACCAG GTCCTCGGCC TGGAGTGGTC CTACCAGGCC ATCGACGTCG AGCCTGGTGG TTTGCGTGCT TTTATTGAGG GGCTCGACGG TTCCTGGCGA GGGCTATCAG TGACGATGCC TCACAAGGCC GATCTCGTCG AGTTGGGGGA GACCGACGCG ACGGTTGACA TGTTGGGAGC GGCGAATACC TGGGTTTGTC GTGACGGCAC GACCATCGTC CGCAATACCG ACGTCACGGG GGCAGAGGCT GCGCTTCGTG CCAGGGGAGT GACTGATGTC GAGAAGGTTG TCATGCTGGG GGCGGGCGCA ACAGCCCGGT CTGTTCTTGC GGCTGCCATT GGGATGGGAG CGGGCGAAGC CGTCGTGATG TCGCGCTCGC GCGAACGGTC CACGAAGATC CTTAAACTTG CTGATGGCCT CGGCATTCGT GTTGCCTGGT TGCCTTTCGA ATCGGAGCCT CCGCGGTGCA ACCTCATAGT CTCGACGGTT CCAGCCGGTT CCTTGATAAG GCGTGCTGAA GATCTCGCTG CTCGAGCTAA TGCGGTCTTT GACGTCGTCT ATGATCCCTG GCCAACCCCT TTGGCCGTGG CTGGGAAGAT CGCTGGTGCA ACCGTCATTG ACGG
Translation
R I P G P R P G V V L P G H R R R A W W F A C F Y * G A R R F L A R F1
A Y Q V L G L E W S Y Q A I D V E P G G L R A F I E G L D G S W R F2
H T R S S A W S G P T R P S T S S L V V C V L L L R G S T V P G E F3
1 CGCATACCAGGTCCTCGGCCTGGAGTGGTCCTACCAGGCCATCGACGTCGAGCCTGGTGGTTTGCGTGCTTTTATTGAGGGGCTCGACGGTTCCTGGCGA 100
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A I S D D A S Q G R S R R V G G D R R D G * H V G S G E Y L G L S F1
G L S V T M P H K A D L V E L G E T D A T V D M L G A A N T W V C R F2
G Y Q * R C L T R P I S S S W G R P T R R L T C W E R R I P G F V F3
101 GGGCTATCAGTGACGATGCCTCACAAGGCCGATCTCGTCGAGTTGGGGGAGACCGACGCGACGGTTGACATGTTGGGAGCGGCGAATACCTGGGTTTGTC 200
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* R H D H R P Q Y R R H G G R G C A S C Q G S D * C R E G C H A G F1
D G T T I V R N T D V T G A E A A L R A R G V T D V E K V V M L G F2
V T A R P S S A I P T S R G Q R L R F V P G E * L M S R R L S C W G F3
201 GTGACGGCACGACCATCGTCCGCAATACCGACGTCACGGGGGCAGAGGCTGCGCTTCGTGCCAGGGGAGTGACTGATGTCGAGAAGGTTGTCATGCTGGG 300
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G G R N S P V C S C G C H W D G S G R S R R D V A L A R T V H E D P F1
A G A T A R S V L A A A I G M G A G E A V V M S R S R E R S T K I F2
R A Q Q P G L F L R L P L G W E R A K P S * C R A R A N G P R R S F3
301 GGCGGGCGCAACAGCCCGGTCTGTTCTTGCGGCTGCCATTGGGATGGGAGCGGGCGAAGCCGTCGTGATGTCGCGCTCGCGCGAACGGTCCACGAAGATC 400
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* T C * W P R H S C C L V A F R I G A S A V Q P H S L D G S S R F F1
L K L A D G L G I R V A W L P F E S E P P R C N L I V S T V P A G S F2
L N L L M A S A F V L P G C L S N R S L R G A T S * S R R F Q P V F3
401 CTTAAACTTGCTGATGGCCTCGGCATTCGTGTTGCCTGGTTGCCTTTCGAATCGGAGCCTCCGCGGTGCAACCTCATAGTCTCGACGGTTCCAGCCGGTT 500
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L D K A C * R S R C S S * C G L * R R L * S L A N P F G R G W E D F1
L I R R A E D L A A R A N A V F D V V Y D P W P T P L A V A G K I F2
P * * G V L K I S L L E L M R S L T S S M I P G Q P L W P W L G R S F3
501 CCTTGATAAGGCGTGCTGAAGATCTCGCTGCTCGAGCTAATGCGGTCTTTGACGTCGTCTATGATCCCTGGCCAACCCCTTTGGCCGTGGCTGGGAAGAT 600
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R W C N R H * R F1
A G A T V I D G F2
L V Q P S L T X F3
601 CGCTGGTGCAACCGTCATTGACGG 624
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