CAMP2 allele sequence: id-223
Contig position
- sequence bin id
- 1690
- contig length
- 79293
- start
- 57744
- end
- 58547
- length
- 804
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GTAAAGACAA TTTTCTTCTG CACAGCGCAC TCGGTGCCTT GCCCGCACGC AGGCGGGCAA GGCACCGAGT GTTGATGTCA ATTAGCGAGT GCGTTCTGAC TCAGGCAGCC TTCTTGACAT CGGGGGAGTT GAATGCGGTC TGATAGGCCG CAAGGAGCTC GGTGCGTGCA GCCTGGATAT TCCCTACGGT CGTCTTTGGG TTCAGTCGAA CGCCGACGGC CTTGGTGATC GCGTGATTGA GCGTCTTGTA CACTGCGGCG CTCTTGTGAC CAAGGATGTA CCGGTCACGG TTGGCGCGCA CCTGCCAGAT CGTCTTACTG AAGTTGGTGC GTACGTACAC AGTGGCAACG TCATTCGGGG TGAGGTCGGG GTACTGCGAG ACCTTTTCCA GGCGAGCCTT GAGGGCGGCG CCCTCGGCGT CGAGTTCCTT GGCGGTGGAC GCTGGGTTAG CGGTCAGCAG GACGGCCTTG GTGACTTCGA GACCGAGTTC GACGTGGGCG GGGCGGACCT TGTTTTGGAG AGTGGTGGTA GCAGTGTGAA TGGTGTCAAT AGTGGTGGCG ACCAACTTGA TCCTCGGCAT GATCGTCGAA GGGTCGTAGA ACGGGATCCC CCCATGGGCA AGGGTCTCGA TGAGGCCACG CAGGTCGAAG GCAGCCTTGA GAAGATCTCG GATCTGGTCA GAGTAGTCAG AACCGGGGAC GGATTTCTGT ACTGACTGAA GGGTCGCAAT ATGTGCGTTC AGAAGCTGGA TGCTATTGCG AGCGTCACTG GCCGAGAGCT CGTGGGTGCT GGTCGCCGAG ATGGTCGTCG TCGGCTCGAC AGCATGAGCA CTGGGAGCTG ACAGCGCCGC TGGTACGAGC ATTGCGCCGA CAAGGAGGGG AGCTACAAGA TGGGTCTTCT TCATAAAGGT TCTCCGTTTA TTGGTTGCGG ATGCCCCGGT CGAGGCAAGC GAAGTGTATC GGATATTTTG GATGGGGGTC GGTGTGGTGA ACGGCGTGTA CGCC
Translation
Internal stop codons at positions: 713, 839 (numbering includes upstream flanking sequence).
V K T I F F C T A H S V P C P H A G G Q G T E C * C Q L A S A F * L F1
* R Q F S S A Q R T R C L A R T Q A G K A P S V D V N * R V R S D F2
K D N F L L H S A L G A L P A R R R A R H R V L M S I S E C V L T F3
1 GTAAAGACAATTTTCTTCTGCACAGCGCACTCGGTGCCTTGCCCGCACGCAGGCGGGCAAGGCACCGAGTGTTGATGTCAATTAGCGAGTGCGTTCTGAC 100
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R Q P S * H R G S * M R S D R P Q G A R C V Q P G Y S L R S S L G F1
S G S L L D I G G V E C G L I G R K E L G A C S L D I P Y G R L W V F2
Q A A F L T S G E L N A V * * A A R S S V R A A W I F P T V V F G F3
101 TCAGGCAGCCTTCTTGACATCGGGGGAGTTGAATGCGGTCTGATAGGCCGCAAGGAGCTCGGTGCGTGCAGCCTGGATATTCCCTACGGTCGTCTTTGGG 200
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S V E R R R P W * S R D * A S C T L R R S C D Q G C T G H G W R A F1
Q S N A D G L G D R V I E R L V H C G A L V T K D V P V T V G A H F2
F S R T P T A L V I A * L S V L Y T A A L L * P R M Y R S R L A R T F3
201 TTCAGTCGAACGCCGACGGCCTTGGTGATCGCGTGATTGAGCGTCTTGTACACTGCGGCGCTCTTGTGACCAAGGATGTACCGGTCACGGTTGGCGCGCA 300
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P A R S S Y * S W C V R T Q W Q R H S G * G R G T A R P F P G E P * F1
L P D R L T E V G A Y V H S G N V I R G E V G V L R D L F Q A S L F2
C Q I V L L K L V R T Y T V A T S F G V R S G Y C E T F S R R A L F3
301 CCTGCCAGATCGTCTTACTGAAGTTGGTGCGTACGTACACAGTGGCAACGTCATTCGGGGTGAGGTCGGGGTACTGCGAGACCTTTTCCAGGCGAGCCTT 400
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G R R P R R R V P W R W T L G * R S A G R P W * L R D R V R R G R F1
E G G A L G V E F L G G G R W V S G Q Q D G L G D F E T E F D V G G F2
R A A P S A S S S L A V D A G L A V S R T A L V T S R P S S T W A F3
401 GAGGGCGGCGCCCTCGGCGTCGAGTTCCTTGGCGGTGGACGCTGGGTTAGCGGTCAGCAGGACGGCCTTGGTGACTTCGAGACCGAGTTCGACGTGGGCG 500
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G G P C F G E W W * Q C E W C Q * W W R P T * S S A * S S K G R R F1
A D L V L E S G G S S V N G V N S G G D Q L D P R H D R R R V V E F2
G R T L F W R V V V A V * M V S I V V A T N L I L G M I V E G S * N F3
501 GGGCGGACCTTGTTTTGGAGAGTGGTGGTAGCAGTGTGAATGGTGTCAATAGTGGTGGCGACCAACTTGATCCTCGGCATGATCGTCGAAGGGTCGTAGA 600
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T G S P H G Q G S R * G H A G R R Q P * E D L G S G Q S S Q N R G R F1
R D P P M G K G L D E A T Q V E G S L E K I S D L V R V V R T G D F2
G I P P W A R V S M R P R R S K A A L R R S R I W S E * S E P G T F3
601 ACGGGATCCCCCCATGGGCAAGGGTCTCGATGAGGCCACGCAGGTCGAAGGCAGCCTTGAGAAGATCTCGGATCTGGTCAGAGTAGTCAGAACCGGGGAC 700
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I S V L T E G S Q Y V R S E A G C Y C E R H W P R A R G C W S P R F1
G F L Y * L K G R N M C V Q K L D A I A S V T G R E L V G A G R R D F2
D F C T D * R V A I C A F R S W M L L R A S L A E S S W V L V A E F3
701 GGATTTCTGTACTGACTGAAGGGTCGCAATATGTGCGTTCAGAAGCTGGATGCTATTGCGAGCGTCACTGGCCGAGAGCTCGTGGGTGCTGGTCGCCGAG 800
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W S S S A R Q H E H W E L T A P L V R A L R R Q G G E L Q D G S S F1
G R R R L D S M S T G S * Q R R W Y E H C A D K E G S Y K M G L L F2
M V V V G S T A * A L G A D S A A G T S I A P T R R G A T R W V F F F3
801 ATGGTCGTCGTCGGCTCGACAGCATGAGCACTGGGAGCTGACAGCGCCGCTGGTACGAGCATTGCGCCGACAAGGAGGGGAGCTACAAGATGGGTCTTCT 900
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S * R F S V Y W L R M P R S R Q A K C I G Y F G W G S V W * T A C T F1
H K G S P F I G C G C P G R G K R S V S D I L D G G R C G E R R V F2
I K V L R L L V A D A P V E A S E V Y R I F W M G V G V V N G V Y F3
901 TCATAAAGGTTCTCCGTTTATTGGTTGCGGATGCCCCGGTCGAGGCAAGCGAAGTGTATCGGATATTTTGGATGGGGGTCGGTGTGGTGAACGGCGTGTA 1000
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P F1
R X F2
A F3
1001 CGCC 1004
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