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MLST
Finetyping antigens
16S
3' processing factors
ADP-heptose biosynthesis
Antibiotic resistance
Antigen genes
beta lactamase plasmid
Bexsero Antigen Sequence Typing (BAST)
Capsule Null (cnl)
Capsule Region A - Serogroup A
Capsule Region A - Serogroup B
Capsule Region A - Serogroup C
Capsule Region A - Serogroup E
Capsule Region A - Serogroup H
Capsule Region A - Serogroup L
Capsule Region A - Serogroup W
Capsule Region A - Serogroup X
Capsule Region A - Serogroup Y
Capsule Region A - Serogroup Z
Capsule Region B
Capsule Region C
Capsule Region D and D'
CCA adding factor
Class I
Class II
Class III
Class IV
Class V
Commensal cps: Group 1
Commensal cps: Group 2
Commensal cps: Group 3
Conjugative Plasmid
Core subunits
CRP/FNR family
Cryptic Plasmid
Deaminase
DeoR family
Dihydorouridine synthases
DNA methylation enzyme
DNA polymerase III holoenzyme
DNA replication
DNA replication
eMLST (20 locus partial genes)
eMLST (20 locus whole genes)
Factor H-binding protein
Fur family
GC OMV peptide typing
Glycolysis
GntR family
Gonococcal Genetic Island
Human-restricted Neisseria cgMLST v1.0
Initiation factors
Iron acquisition
Kdo addition
L23 cgMLST
L23 pgMLST
L3 cgMLST
L4821 cgMLST
L4821 pgMLST
L5 cgMLST
L5 pgMLST
Lipid A biosynthesis: acyltransferases
Lipid A biosynthesis: other
LOS alpha chain transferases
LOS inner core transferases
LOS transport/export
Lrp/AsnC family
LysR family
Methylthiotransferase
Methyltransferases
MGI-1
MGI-2
MGI-3
Multi-aminoacyl-tRNA synthetase complex (MSC)
Neisseria genus core genes
NG MAST
N. gonorrhoeae Beta-lactam AMR
N. gonorrhoeae cgMLST v1.0
N. gonorrhoeae Efflux Pumps AMR
N. gonorrhoeae Fluoroquinolone AMR
N. gonorrhoeae Macrolides AMR
N. gonorrhoeae plasmid mediated AMR
NG STAR
N. meningitidis cgMLST v1.0
Nucleotide excision repair
OMV peptide
OMV peptide typing
Other AARSs
Other elongation factors
Other families
Others
Other tRNA modification factors
Pilus genes
Prevention of re-replication factors
Protein glycosylation
Psudouridine synthases
Purine metabolism
Pyrimidine metabolism
Pyruvate dehydrogenase complex
Ribonuclease P
Ribosomal MLST
Ribosomal protein genes
RNA polymerase-associated proteins
RNase H
rplF species
Rrf2 family
Sigma factors
Small regulatory RNAs
TCA cycle
TetR/AcrR family
Thiolation factors
Topoisomerases
Topoisomerase subunits
Transcription elongation factors
Transcription termination factor
tRNA degradation factors
tRNA molecules
UDP-GlcNAc synthesis
UDP-glucose and UDP-galactose biosynthesis
VirB T4SS
All loci
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abcZ
adk
aroE
fumC
gdh
pdhC
pgm
Autofill profile by searching remote database
ST:
Filters
Project:
107 global collection
EUMenNet
gyrA sequence analysis
Irish Meningococcus Genome Library
MRF Meningococcal Genome Library
NI_EXCL_MRF
penA sequence analysis
rpoB sequence analysis
Scottish MRF Genome Library
UK & Ireland MGL 2010/11-2013/14
UKMenCar1
UKMenCar2
UKMenCar3
Zooniverse
Include old record versions
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Search:
Exact or nearest match
Exact match only
6 or more matches
5 or more matches
4 or more matches
3 or more matches
2 or more matches
1 or more matches
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id
isolate
country
region
year
date sampled
isoyear sampled
week sampled
date received
non culture
epidemiological year
age yr
age range
age mth
sex
disease
source
epidemiology
species
serogroup
genogroup
genogroup notes
capsule group
MLEE designation
serotype
sero subtype
ET no
penicillin
penicillin range
amoxicillin
sulphonamide
ceftriaxone
ceftriaxone range
chloramphenicol
chloramphenicol range
cefotaxime
cefotaxime range
rifampicin
rifampicin range
ciprofloxacin
ciprofloxacin range
tetracycline
cefixime
azithromycin
spectinomycin
bioproject accession
biosample accession
ENA run accession
private project
comments
sender
curator
date entered
datestamp
'16S_rDNA
'fHbp
'mtrR
'porA
'porB
'rplF
16S_rRNA (SSU_rRNA)
23S_rRNA
abcZ
abcZ (NEIS1015)
aceF (NEIS1279)
ackA2 (NEIS1727)
acnA (NEIS1729)
acnB (NEIS1492)
adhA (NEIS0486)
adhC (NEIS1241)
adk
adk (NEIS0767)
aldA (NEIS1942)
aniA (NEIS2779)
aniA, pan1 (NEIS1549)
anmK (NEIS1788)
apaH (NEIS0610)
argH (NEIS0580)
aroE
aroE (NEIS1810)
ArsR (NEIS1769)
AsnC (NEIS1566)
aspA
aspA (NEIS1185)
atlA (NEIS2274)
BACT000001 (rpsA)
BACT000002 (rpsB)
BACT000003 (rpsC)
BACT000004 (rpsD)
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BACT000039 (rplJ)
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carB
carB (NEIS0363)
CcoO (NEIS1643)
chpA (NEIS2019)
clpS (NEIS0775)
cmk (NEIS1237)
cnl (NEIS2743)
csaA (NEIS2157)
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csaD (NEIS2160)
csb (NEIS2161)
csc (NEIS0051)
cseA (NEIS2165)
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cseD (NEIS2168)
cseE (NEIS2169)
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cseG (NEIS2171)
cshC (NEIS2177)
cshD (NEIS2178)
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cslB (NEIS2185)
cslC (NEIS2186)
cspA (NEIS2277)
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cssE (NEIS0050)
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cszC (NEIS2175)
cszD (NEIS2176)
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cysN (NEIS1093)
cysU (NEIS0822)
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dhpS
dnaN (NEIS0321)
dnaQ (NEIS1443)
doc (NEIS0881)
dpnIIB (NEIS0328)
drg (NEIS2477)
dsbC (NEIS2260)
eno (NEIS1220)
eppA (NEIS2311)
ermE (NEIS2487)
etfB (NEIS2133)
exl2 (NEIS2521)
exp1 (NEIS2276)
exp2 (NEIS2278)
fba (NEIS0350)
fbp (NEIS0004)
fbp (NEIS1022)
fetA (NEIS1963)
FetA_VR
fetB2 (NEIS0340)
FfrR_Regulon
fHbp (NEIS0349)
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fHbp_peptide
fHbp_PEPTIDEfrag_Pasteur
fis (NEIS1353)
folB (NEIS1027)
folP (NEIS1609)
frpC (NEIS0527)
fumA (NEIS1534)
fumC
fumC (NEIS1396)
fur (NEIS0197)
galE (NEIS0048)
galE2 (NEIS0062)
galM (NEIS1778)
galU (NEIS0581)
gam (NEIS1054)
gapA (NEIS0199)
gapA2 (NEIS2137)
gatC (NEIS1290)
gcp (NEIS0419)
gdh
gdh (NEIS1331)
ggt (NEIS1018)
glmU (NEIS0015)
glnA
glnA (NEIS1809)
gloA (NEIS1830)
gltA (NEIS0930)
gmhA (NEIS2070)
gmhB (NEIS2014)
gntP (NEIS2006)
gpm
gpm (NEIS1524)
gpxA (NEIS1547)
gyrA
hemk (NEIS2046)
hfq (NEIS0702)
hisE (NEIS0546)
hldA (NEIS0769)
hldC (NEIS2055)
hldD (NEIS0773)
hmbR
hpuA (NEIS1946)
hpuB (NEIS1947)
hscA (NEIS1070)
hscB (NEIS1319)
icd (NEIS0897)
iga2 (NEIS1959)
igr_NEIS0405_0406
igr_up_NEIS0055
igr_up_NEIS0349
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igr_up_NEIS0351
igr_up_NEIS1364
igr_up_NEIS1969
igr_up_NEIS2109
incC2 (NEIS2237)
infA (NEIS0153)
infC (NEIS0673)
kdsA (NEIS1218)
kdsB (NEIS0624)
kdsC (NEIS1815)
kdtA (NEIS2152)
kfrB (NEIS2239)
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kleE (NEIS2236)
korC (NEIS2235)
kpsF (NEIS1816)
lacY (NEIS2199)
lacZ (NEIS2200)
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lgtG (NEIS2011)
lot (NEIS0291)
lpd (NEIS1280)
lpdA2 (NEIS0924)
lpt3 (NEIS1986)
lpt6 (NEIS2012)
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lspA (NEIS0384)
lst (NEIS0899)
ltgx (NEIS2253)
LysR (NEIS1162)
maeA (NEIS0620)
mafA_MGI-1 (NEIS1789)
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mafA_MGI-3 (NEIS2083)
mafB-CT_o1MGI-1 (NEIS1800)
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mafB_MGI-3 (NEIS2084)
mafI1_MGI-2 (NEIS2574)
mafI2_MGI-2 (NEIS0598)
mafI_MGI-1 (NEIS1799)
mafI_o1MGI-1 (NEIS0221)
mafI_o1MGI-2 (NEIS0223)
mafI_o2MGI-3 (NEIS2087)
mafI_o3MGI-3 (NEIS2092)
mafI_o4MGI-3 (NEIS2577)
mafI_o5MGI-3 (NEIS2085)
mafI_o6MGI-3 (NEIS2508)
mafS1 (NEIS0599)
mafS10 (NEIS2098)
mafS2 (NEIS0601)
mafS3 (NEIS1794)
mafS4 (NEIS1797)
mafS7 (NEIS2090)
mafS8 (NEIS2091)
marR (NEIS2216)
minD (NEIS0161)
mlp (NEIS0325)
mobA (NEIS2961)
mobC (NEIS2951)
modB (NEIS1194)
modD (NEIS2364)
msbA (NEIS0304)
mspA (NEIS1974)
mtgA
mtgA (NEIS1811)
mutY (NEIS1336)
nadA (NEIS1969)
NadA_peptide
natC (NEIS1657)
ndk (NEIS1244)
NEIS0001 (lpxC)
NEIS0004 (fbp)
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NEIS0020 (pilB/msrAB)
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NEIS0023
NEIS0024
NEIS0025
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NEIS0036 (pilT1)
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NEIS0118 (nusG)
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NEIS0149 (rpsE)
NEIS0150 (rpmD)
NEIS0151 (rplO)
NEIS0152
NEIS0153 (infA)
NEIS0154 (rpmJ)
NEIS0155 (rpsM)
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NEIS0171 (lpxD)
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NEIS0181
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NEIS0211
NEIS0212
NEIS0213 (pglA)
NEIS0214
NEIS0215
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NEIS0220
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NEIS0222
NEIS0223 (mafI_o1MGI-2)
NEIS0224
NEIS0225
NEIS0226
NEIS0227
NEIS0228
NEIS0229
NEIS0230
NEIS0231
NEIS0232
NEIS0233
NEIS0235
NEIS0236
NEIS0237
NEIS0238 (nuoB)
NEIS0239
NEIS0240
NEIS0241
NEIS0242
NEIS0243
NEIS0244
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NEIS0255
NEIS0256 (xseB)
NEIS0257
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NEIS0303
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NEIS0341
NEIS0342
NEIS0343
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NEIS0346
NEIS0347
NEIS0348
NEIS0349 (fHbp)
NEIS0350 (fba)
NEIS0351
NEIS0352
NEIS0353
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opcB (NEIS1877)
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rpoB
rpsA (BACT000001)
rpsA (NEIS1238)
rpsB (BACT000002)
rpsB (NEIS2080)
rpsC (BACT000003)
rpsC (NEIS0138)
rpsD (BACT000004)
rpsD (NEIS0157)
rpsE (BACT000005)
rpsE (NEIS0149)
rpsF (BACT000006)
rpsF (NEIS1260)
rpsG (BACT000007)
rpsG (NEIS0126)
rpsH (BACT000008)
rpsH (NEIS0146)
rpsI (BACT000009)
rpsI (NEIS2037)
rpsJ (BACT000010)
rpsJ (NEIS0129)
rpsK (BACT000011)
rpsK (NEIS0156)
rpsL (BACT000012)
rpsL (NEIS0125)
rpsM (BACT000013)
rpsM (NEIS0155)
rpsN (BACT000014)
rpsN (NEIS0145)
rpsO (BACT000015)
rpsO (NEIS0552)
rpsP (BACT000016)
rpsP (NEIS0534)
rpsQ (BACT000017)
rpsQ (NEIS0141)
rpsR (BACT000018)
rpsR (NEIS1258)
rpsS (BACT000019)
rpsS (NEIS0136)
rpsT (BACT000020)
rpsT (NEIS1688)
rpsU (BACT000021)
rpsU (NEIS1921)
rte (NEIS3173)
sdhA (NEIS0927)
sdhB (NEIS0928)
sdhC (NEIS0925)
sdhD (NEIS0926)
secE (NEIS0117)
serC
serC (NEIS1554)
sodB (NEIS0825)
sodC (NEIS1339)
speA (NEIS1682)
speB (NEIS1680)
sRNA25a
sRNA25b
ssb (NEIS2233)
ssbB (NEIS2303)
SSU_rRNA (16S_rRNA)
sucA (NEIS0931)
sucB (NEIS0932)
sucC (NEIS0935)
sucD (NEIS0936)
talA
talA (NEIS1818)
tatA/E (NEIS2375)
tbpA (NEIS1690)
tbpB (NEIS1691)
tetM (NEIS2210)
topB (NEIS2302)
tpsA (NEIS0444)
tpsA3 (NEIS2438)
tpsB (NEIS0443)
tpsS5 (NEIS0456)
traA (NEIS2255)
traB (NEIS2259)
traC (NEIS2202)
traC (NEIS2262)
traD (NEIS2249)
traD (NEIS2250)
traE (NEIS2248)
traE (NEIS2257)
traF (NEIS2247)
traF (NEIS2271)
traG (NEIS2246)
traG (NEIS2273)
traH (NEIS2272)
traI (NEIS2245)
traI (NEIS2251)
traJ (NEIS2244)
traK (NEIS2243)
traK (NEIS2258)
traL (NEIS2242)
traL (NEIS2256)
traM (NEIS2241)
traN (NEIS2269)
traU (NEIS2266)
traV (NEIS2261)
traW (NEIS2265)
trbA (NEIS2232)
trbB (NEIS2231)
trbC (NEIS2230)
trbC (NEIS2267)
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trbE (NEIS2228)
trbF (NEIS2227)
trbG (NEIS2226)
trbH (NEIS2225)
trbI (NEIS2224)
trbI (NEIS2264)
trbJ (NEIS2223)
trbK (NEIS2222)
trbL (NEIS2221)
trbM (NEIS2220)
trbN (NEIS2219)
trfA (NEIS2234)
tRNA-ala
tRNA-arg
tRNA-asn
tRNA-asp
tRNA-cys
tRNA-fmet
tRNA-gln
tRNA-glu
tRNA-gly
tRNA-his
tRNA-ile
tRNA-leu
tRNA-lys
tRNA-met
tRNA-phe
tRNA-pro
tRNA-ser
tRNA-thr
tRNA-trp
tRNA-tyr
tRNA-val
tspA (NEIS1829)
tuf (NEIS0116)
tuf (NEIS0128)
vapD (NEIS2218)
vapD (NEIS2956)
vapX (NEIS2955)
virB1 (NEIS2323)
virB2 (NEIS2324)
virB3 (NEIS2325)
vsr (NEIS0678)
vsr (NEIS1990)
xseB (NEIS0256)
yaf (NEIS2252)
yag (NEIS2254)
ybaQ (NEIS2837)
ybe (NEIS2263)
ybi (NEIS2268)
ycb (NEIS2270)
ych (NEIS2275)
ych1 (NEIS2312)
yda (NEIS2279)
ydbA (NEIS2280)
ydbB (NEIS2281)
ydcA (NEIS2282)
ydcB (NEIS2283)
ydd (NEIS2284)
ydeA (NEIS2285)
ydeB (NEIS2286)
ydf (NEIS2287)
ydg (NEIS2288)
ydhA (NEIS2289)
ydhB (NEIS2290)
ydi (NEIS2291)
ydiP (NEIS2796)
yea (NEIS2292)
yeb (NEIS2293)
yecA (NEIS2294)
yecB (NEIS2295)
yedA (NEIS2296)
yedB (NEIS2297)
yee (NEIS2298)
yegA (NEIS2204)
yegA (NEIS2299)
yegB (NEIS2300)
yeh (NEIS2301)
yfa (NEIS2304)
yfb (NEIS2305)
yfcA (NEIS2488)
yfd (NEIS2306)
yfeA (NEIS2307)
yfeB (NEIS2308)
yhbG (NEIS1812)
zupT (NEIS0165)
ST (MLST)
clonal complex (MLST)
pST (beta lactamase plasmid)
MenDeVAR Bexsero reactivity (Bexsero Antigen Sequence Typing (BAST))
MenDeVAR Trumenba reactivity (Bexsero Antigen Sequence Typing (BAST))
BAST (Bexsero Antigen Sequence Typing (BAST))
pST (Conjugative Plasmid)
pST (Cryptic Plasmid)
OMV (GC OMV peptide typing)
cluster (GC OMV peptide typing)
ST (NG MAST)
cgST (N. gonorrhoeae cgMLST v1.0)
ST (NG STAR)
cgST (N. meningitidis cgMLST v1.0)
rST (Ribosomal MLST)
genus (Ribosomal MLST)
species (Ribosomal MLST)
subspecies (Ribosomal MLST)
lineage (Ribosomal MLST)
sublineage (Ribosomal MLST)
other designation (Ribosomal MLST)
notes (Ribosomal MLST)
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