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MLST
Finetyping antigens
16S
3' processing factors
ADP-heptose biosynthesis
Antibiotic resistance
Antigen genes
beta lactamase plasmid
Bexsero Antigen Sequence Typing (BAST)
Capsule Null (cnl)
Capsule Region A - Serogroup A
Capsule Region A - Serogroup B
Capsule Region A - Serogroup C
Capsule Region A - Serogroup E
Capsule Region A - Serogroup H
Capsule Region A - Serogroup L
Capsule Region A - Serogroup W
Capsule Region A - Serogroup X
Capsule Region A - Serogroup Y
Capsule Region A - Serogroup Z
Capsule Region B
Capsule Region C
Capsule Region D and D'
CCA adding factor
Class I
Class II
Class III
Class IV
Class V
Commensal cps: Group 1
Commensal cps: Group 2
Commensal cps: Group 3
Conjugative Plasmid
Core subunits
CRP/FNR family
Cryptic Plasmid
Deaminase
DeoR family
Dihydorouridine synthases
DNA methylation enzyme
DNA polymerase III holoenzyme
DNA replication
DNA replication
eMLST (20 locus partial genes)
eMLST (20 locus whole genes)
Factor H-binding protein
Fur family
GC OMV peptide typing
Glycolysis
GntR family
Gonococcal Genetic Island
Human-restricted Neisseria cgMLST v1.0
Initiation factors
Iron acquisition
Kdo addition
L23 cgMLST
L23 pgMLST
L3 cgMLST
L44 cgMLST
L44 pgMLST
L5 cgMLST
L5 pgMLST
Lipid A biosynthesis: acyltransferases
Lipid A biosynthesis: other
LOS alpha chain transferases
LOS inner core transferases
LOS transport/export
Lrp/AsnC family
LysR family
Methylthiotransferase
Methyltransferases
MGI-1
MGI-2
MGI-3
Multi-aminoacyl-tRNA synthetase complex (MSC)
Neisseria genus core genes
NG MAST v2.0
N. gonorrhoeae agMLST v1.0
N. gonorrhoeae Beta-lactam AMR
N. gonorrhoeae cgMLST v1.0
N. gonorrhoeae Efflux Pumps AMR
N. gonorrhoeae Fluoroquinolone AMR
N. gonorrhoeae Macrolides AMR
N. gonorrhoeae pgMLST v1.0
N. gonorrhoeae plasmid mediated AMR
NG STAR
N. meningitidis cgMLST v1.0
Nucleotide excision repair
OMV peptide
OMV peptide typing
Other AARSs
Other elongation factors
Other families
Others
Other tRNA modification factors
PenA locus
Peptidoglycan pathway
Pilus genes
PorB_loop_peptides
Prevention of re-replication factors
Protein glycosylation
Psudouridine synthases
Purine metabolism
Pyrimidine metabolism
Pyruvate dehydrogenase complex
Ribonuclease P
Ribosomal MLST
Ribosomal protein genes
RMS in Neisseria gonorrhoeae
RNA polymerase-associated proteins
RNase H
rplF species
Rrf2 family
Secreted peptides
Sigma factors
Small regulatory RNAs
TCA cycle
TetR/AcrR family
Thiolation factors
Topoisomerases
Topoisomerase subunits
Transcription elongation factors
Transcription termination factor
tRNA degradation factors
tRNA molecules
UDP-GlcNAc synthesis
UDP-glucose and UDP-galactose biosynthesis
VirB T4SS
All loci
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abcZ
adk
aroE
fumC
gdh
pdhC
pgm
Autofill profile by searching remote database
ST:
Filters
Project:
107 global collection
England MRF Genome Library
EUMenNet
GMGL
gyrA sequence analysis
Irish Meningococcus Genome Library
MRF Meningococcal Genome Library
NI_EXCL_MRF
penA sequence analysis
rpoB sequence analysis
Scottish MRF Genome Library
UK & Ireland MGL 2010/11-2013/14
UKMenCar1
UKMenCar2
UKMenCar3
Zooniverse
Include old record versions
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Exact or nearest match
Exact match only
6 or more matches
5 or more matches
4 or more matches
3 or more matches
2 or more matches
1 or more matches
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id
isolate
country
region
year
date sampled
isoyear sampled
week sampled
date received
non culture
epidemiological year
age yr
age range
age mth
sex
disease
source
epidemiology
species
serogroup
genogroup
genogroup notes
capsule group
serotype
sero subtype
amoxicillin mic sign
amoxicillin mic
azithromycin mic sign
azithromycin mic
cefixime mic sign
cefixime mic
cefixime SIR
cefotaxime mic sign
cefotaxime mic
cefotaxime SIR
ceftriaxone mic sign
ceftriaxone mic
ceftriaxone SIR
chloramphenicol mic sign
chloramphenicol mic
chloramphenicol SIR
ciprofloxacin mic sign
ciprofloxacin mic
ciprofloxacin SIR
penicillin mic sign
penicillin mic
penicillin SIR
rifampicin mic sign
rifampicin mic
rifampicin SIR
spectinomycin mic sign
spectinomycin mic
spectinomycin SIR
sulphonamide mic sign
sulphonamide mic
tetracycline mic sign
tetracycline mic
tetracycline SIR
bioproject accession
biosample accession
ENA run accession
private project
comments
sender
curator
date entered
datestamp
'16S_rDNA
'fHbp
'mtrR
'porA
'porB
'rplF
16S_rRNA (SSU_rRNA)
23S_rRNA
abcZ
abcZ (NEIS1015)
aceF (NEIS1279)
ackA2 (NEIS1727)
acnA (NEIS1729)
acnB (NEIS1492)
adhA (NEIS0486)
adhC (NEIS1241)
adk
adk (NEIS0767)
aldA (NEIS1942)
aniA (NEIS2779)
aniA, pan1 (NEIS1549)
anmK (NEIS1788)
apaH (NEIS0610)
argH (NEIS0580)
aroE
aroE (NEIS1810)
ArsR (NEIS1769)
AsnC (NEIS1566)
aspA
aspA (NEIS1185)
atlA (NEIS2274)
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BACT000019 (rpsS)
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BACT000030 (rplA)
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BACT000064 (rpmI)
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carB
carB (NEIS0363)
CcoO (NEIS1643)
chpA (NEIS2019)
clpS (NEIS0775)
cmk (NEIS1237)
cnl (NEIS2743)
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csaD (NEIS2160)
csb (NEIS2161)
csc (NEIS0051)
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cshD (NEIS2178)
cslA (NEIS2184)
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cslC (NEIS2186)
cspA (NEIS2277)
cssA (NEIS0054)
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csw (NEIS2162)
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cszB;cshB (NEIS2174)
cszC (NEIS2175)
cszD (NEIS2176)
ctrA (NEIS0055)
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ctrD (NEIS0058)
ctrE (NEIS0066)
ctrF (NEIS0067)
ctrG (NEIS0049)
cybB (NEIS2066)
cysD (NEIS1094)
cysG (NEIS1096)
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cysI (NEIS1091)
cysJ (NEIS1092)
cysN (NEIS1093)
cysU (NEIS0822)
dadA (NEIS0166)
ddpX (NEIS1731)
dhpS
dnaN (NEIS0321)
dnaQ (NEIS1443)
doc (NEIS0881)
dpnIIB (NEIS0328)
drg (NEIS2477)
dsbC (NEIS2260)
eno (NEIS1220)
eppA (NEIS2311)
ermE (NEIS2487)
etfB (NEIS2133)
exl2 (NEIS2521)
exp1 (NEIS2276)
exp2 (NEIS2278)
fba (NEIS0350)
fbp (NEIS0004)
fbp (NEIS1022)
fcpB (NEIS3237)
fcpI (NEIS3238)
fetA (NEIS1963)
FetA_VR
fetB2 (NEIS0340)
FfrR_Regulon
fHbp (NEIS0349)
fHbp_DNAfrag_Pasteur
fHbp_peptide
fHbp_PEPTIDEfrag_Pasteur
fis (NEIS1353)
folB (NEIS1027)
folP (NEIS1609)
frpC (NEIS0527)
fumA (NEIS1534)
fumC
fumC (NEIS1396)
fur (NEIS0197)
galE (NEIS0048)
galE2 (NEIS0062)
galM (NEIS1778)
galU (NEIS0581)
gam (NEIS1054)
gapA (NEIS0199)
gapA2 (NEIS2137)
gatC (NEIS1290)
gcp (NEIS0419)
gdh
gdh (NEIS1331)
ggt (NEIS1018)
glmU (NEIS0015)
glnA
glnA (NEIS1809)
gloA (NEIS1830)
gltA (NEIS0930)
gmhA (NEIS2070)
gmhB (NEIS2014)
gntP (NEIS2006)
gpm
gpm (NEIS1524)
gpxA (NEIS1547)
gyrA
hemk (NEIS2046)
hfq (NEIS0702)
hisE (NEIS0546)
hldA (NEIS0769)
hldC (NEIS2055)
hldD (NEIS0773)
hmbR
hpuA (NEIS1946)
hpuB (NEIS1947)
hscA (NEIS1070)
hscB (NEIS1319)
icd (NEIS0897)
iga2 (NEIS1959)
igr_NEIS0405_0406
igr_up_NEIS0055
igr_up_NEIS0349
igr_up_NEIS0350
igr_up_NEIS0351
igr_up_NEIS1364
igr_up_NEIS1969
igr_up_NEIS2109
incC2 (NEIS2237)
infA (NEIS0153)
infC (NEIS0673)
kdsA (NEIS1218)
kdsB (NEIS0624)
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kfrB (NEIS2239)
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kleE (NEIS2236)
korC (NEIS2235)
kpsF (NEIS1816)
lacY (NEIS2199)
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lgtG (NEIS2011)
lot (NEIS0291)
lpd (NEIS1280)
lpdA2 (NEIS0924)
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lpt6 (NEIS2012)
lptA (NEIS1553)
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lpxL2 (NEIS0421)
lspA (NEIS0384)
lst (NEIS0899)
ltgx (NEIS2253)
LysR (NEIS1162)
maeA (NEIS0620)
mafA_MGI-1 (NEIS1789)
mafA_MGI-2 (NEIS0596)
mafA_MGI-3 (NEIS2083)
mafB-CT_o1MGI-1 (NEIS1800)
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mafB2 (NEIS1790)
mafB_MGI-1 or mafB2_MGI-2 (NEIS0597)
mafB_MGI-3 (NEIS2084)
mafI1_MGI-2 (NEIS2574)
mafI2_MGI-2 (NEIS0598)
mafI_MGI-1 (NEIS1799)
mafI_o1MGI-1 (NEIS0221)
mafI_o1MGI-2 (NEIS0223)
mafI_o2MGI-3 (NEIS2087)
mafI_o3MGI-3 (NEIS2092)
mafI_o4MGI-3 (NEIS2577)
mafI_o5MGI-3 (NEIS2085)
mafI_o6MGI-3 (NEIS2508)
mafS1 (NEIS0599)
mafS10 (NEIS2098)
mafS2 (NEIS0601)
mafS3 (NEIS1794)
mafS4 (NEIS1797)
mafS7 (NEIS2090)
mafS8 (NEIS2091)
marR (NEIS2216)
minD (NEIS0161)
mlp (NEIS0325)
mobA (NEIS2961)
mobC (NEIS2951)
modB (NEIS1194)
modD (NEIS2364)
msbA (NEIS0304)
mspA (NEIS1974)
mtgA
mtgA (NEIS1811)
mutY (NEIS1336)
nadA (NEIS1969)
NadA_peptide
natC (NEIS1657)
ndk (NEIS1244)
NEIS0001 (lpxC)
NEIS0004 (fbp)
NEIS0005
NEIS0006
NEIS0007
NEIS0008
NEIS0009
NEIS0010
NEIS0011
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NEIS0017
NEIS0018
NEIS0019
NEIS0020 (pilB/msrAB)
NEIS0021 (pilA)
NEIS0023
NEIS0024
NEIS0025
NEIS0027
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NEIS0029
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NEIS0100
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NEIS0110
NEIS0111
NEIS0112
NEIS0113
NEIS0114
NEIS0115
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NEIS0118 (nusG)
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NEIS0120 (rplA)
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NEIS0147 (rplF)
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NEIS0149 (rpsE)
NEIS0150 (rpmD)
NEIS0151 (rplO)
NEIS0152
NEIS0153 (infA)
NEIS0154 (rpmJ)
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NEIS0179
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NEIS0183
NEIS0184
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NEIS0187
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NEIS0191 (lpxB)
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NEIS0194
NEIS0195
NEIS0196
NEIS0197 (fur)
NEIS0198
NEIS0199 (gapA)
NEIS0200
NEIS0201
NEIS0202
NEIS0203
NEIS0204
NEIS0205
NEIS0206
NEIS0207
NEIS0209
NEIS0210 (pilE)
NEIS0211
NEIS0212
NEIS0213 (pglA)
NEIS0214
NEIS0215
NEIS0216
NEIS0217
NEIS0218
NEIS0220
NEIS0221 (mafI_o1MGI-1)
NEIS0222
NEIS0223 (mafI_o1MGI-2)
NEIS0224
NEIS0225
NEIS0226
NEIS0227
NEIS0228
NEIS0229
NEIS0230
NEIS0231
NEIS0232
NEIS0233
NEIS0235
NEIS0236
NEIS0237
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NEIS0244
NEIS0245
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NEIS0251
NEIS0252
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NEIS0254
NEIS0255
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NEIS0257
NEIS0258
NEIS0259
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NEIS0262
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NEIS0264
NEIS0265
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NEIS0273
NEIS0274
NEIS0275
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NEIS0316
NEIS0317
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NEIS0321 (dnaN)
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NEIS0324
NEIS0325 (mlp)
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NG_porB
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NHBA_peptide
nlaIVM (NEIS1180)
nmgI (NEIS0772)
nrrF
ntpA (NEIS0585)
nuoB (NEIS0238)
nusG (NEIS0118)
opaB (NEIS1403)
opaC (NEIS1551)
opaD (NEIS0903)
opcA (NEIS2198)
opcB (NEIS1877)
ostA (NEIS1813)
oxyR (NEIS0163)
panD (NEIS1216)
parA (NEIS0895)
parA (NEIS2310)
parB (NEIS0893)
parB (NEIS2238)
parB (NEIS2309)
pdhC
pdhC (NEIS1278)
penA
pgi1 (NEIS1326)
pgi2 (NEIS1837)
pgk (NEIS2148)
pglA (NEIS0213)
pglB (NEIS0399)
pglB2 (NEIS2838)
pglB2a (NEIS2839)
pglB2b (NEIS2840)
pglC (NEIS0397)
pglD (NEIS0396)
pglE (NEIS0568)
pglF (NEIS0402)
pglG (NEIS0401)
pglH (NEIS0400)
pglI (NEIS0380)
pglL (NEIS0539)
pglN (NEIS2841)
pglN2 (NEIS2846)
pgm
pgm (NEIS0743)
pgm2 (NEIS1776)
pilA
pilA (NEIS0021)
pilB/msrAB (NEIS0020)
pilC1 (NEIS0371)
pilC2 (NEIS0033)
pilD (NEIS1839)
pilE (NEIS0210)
pilF (NEIS1844)
pilG (NEIS1838)
pilM (NEIS0412)
pilN (NEIS0411)
pilO (NEIS0410)
pilP (NEIS0409)
pilQ (NEIS0408)
pilS
pilT1 (NEIS0036)
pilT2 (NEIS0721)
pip
pip (NEIS0905)
porA (NEIS1364)
PorA_VR1
PorA_VR2
PorA_VR3
porB (NEIS2020)
PorB_loop1
PorB_loop2
PorB_loop3
PorB_loop4
PorB_loop5
PorB_loop6
PorB_loop7
PorB_loop8
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ppk (NEIS0323)
pro_NEIS0350
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pro_NEIS0763
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proB (NEIS1033)
prpB (NEIS1733)
prpC (NEIS1732)
putA (NEIS1766)
pykA
pykA (NEIS0074)
rbgA (NEIS0692)
recX (NEIS1415)
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res (NEIS2217)
rfaC (NEIS2134)
rfaF (NEIS1456)
rfaK (NEIS1619)
rfbA (NEIS0046)
rfbB (NEIS0047)
rfbC (NEIS0045)
rfbC2 (NEIS0065)
rlpB (NEIS0657)
rluE (NEIS2449)
rnc (NEIS0637)
rpiA
rpiA (NEIS1440)
rplA (BACT000030)
rplA (NEIS0120)
rplB (BACT000031)
rplB (NEIS0135)
rplC (BACT000032)
rplC (NEIS0132)
rplD (BACT000033)
rplD (NEIS0133)
rplE (BACT000034)
rplE (NEIS0144)
rplF (BACT000035)
rplF (NEIS0147)
rplI (BACT000038)
rplI (NEIS1257)
rplJ (BACT000039)
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rplK (NEIS0119)
rplL (BACT000036)
rplL (NEIS0122)
rplM (BACT000042)
rplM (NEIS2038)
rplN (BACT000043)
rplN (NEIS0142)
rplO (BACT000044)
rplO (NEIS0151)
rplP (BACT000045)
rplP (NEIS0139)
rplQ (BACT000046)
rplQ (NEIS0159)
rplR (BACT000047)
rplR (NEIS0148)
rplS (BACT000048)
rplS (NEIS0531)
rplT (BACT000049)
rplT (NEIS0675)
rplU (BACT000050)
rplU (NEIS1847)
rplV (BACT000051)
rplV (NEIS0137)
rplW (BACT000052)
rplW (NEIS0134)
rplX (BACT000053)
rplX (NEIS0143)
rplY (NEIS0817)
rpmA (BACT000056)
rpmA (NEIS1848)
rpmB (BACT000057)
rpmB (NEIS1851)
rpmC (BACT000058)
rpmC (NEIS0140)
rpmD (BACT000059)
rpmD (NEIS0150)
rpmE (BACT000060)
rpmE (NEIS1928)
rpmF (BACT000061)
rpmF (NEIS0312)
rpmG (BACT000062)
rpmG (NEIS1850)
rpmH (BACT000063)
rpmH (NEIS0319)
rpmI (BACT000064)
rpmI (NEIS0674)
rpmJ (BACT000065)
rpmJ (NEIS0154)
rpoB
rpsA (BACT000001)
rpsA (NEIS1238)
rpsB (BACT000002)
rpsB (NEIS2080)
rpsC (BACT000003)
rpsC (NEIS0138)
rpsD (BACT000004)
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rpsF (BACT000006)
rpsF (NEIS1260)
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rpsL (NEIS0125)
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rpsU (NEIS1921)
rte (NEIS3173)
sdhA (NEIS0927)
sdhB (NEIS0928)
sdhC (NEIS0925)
sdhD (NEIS0926)
secE (NEIS0117)
serC
serC (NEIS1554)
sodB (NEIS0825)
sodC (NEIS1339)
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speB (NEIS1680)
sRNA25a
sRNA25b
ssb (NEIS2233)
ssbB (NEIS2303)
SSU_rRNA (16S_rRNA)
sucA (NEIS0931)
sucB (NEIS0932)
sucC (NEIS0935)
sucD (NEIS0936)
talA
talA (NEIS1818)
tatA/E (NEIS2375)
tbpA (NEIS1690)
tbpB (NEIS1691)
tetM (NEIS2210)
topB (NEIS2302)
tpsA (NEIS0444)
tpsA3 (NEIS2438)
tpsB (NEIS0443)
tpsS5 (NEIS0456)
traA (NEIS2255)
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traC (NEIS2202)
traC (NEIS2262)
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traD (NEIS2250)
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traE (NEIS2257)
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traF (NEIS2271)
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traG (NEIS2273)
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traI (NEIS2245)
traI (NEIS2251)
traJ (NEIS2244)
traK (NEIS2243)
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traL (NEIS2256)
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trbC (NEIS2230)
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trbF (NEIS2227)
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trbI (NEIS2224)
trbI (NEIS2264)
trbJ (NEIS2223)
trbK (NEIS2222)
trbL (NEIS2221)
trbM (NEIS2220)
trbN (NEIS2219)
trfA (NEIS2234)
tRNA-ala
tRNA-arg
tRNA-asn
tRNA-asp
tRNA-cys
tRNA-fmet
tRNA-gln
tRNA-glu
tRNA-gly
tRNA-his
tRNA-ile
tRNA-leu
tRNA-lys
tRNA-met
tRNA-phe
tRNA-pro
tRNA-ser
tRNA-thr
tRNA-trp
tRNA-tyr
tRNA-val
tspA (NEIS1829)
tuf (NEIS0116)
tuf (NEIS0128)
vapD (NEIS2218)
vapD (NEIS2956)
vapX (NEIS2955)
virB1 (NEIS2323)
virB2 (NEIS2324)
virB3 (NEIS2325)
vsr (NEIS0678)
vsr (NEIS1990)
xseB (NEIS0256)
yaf (NEIS2252)
yag (NEIS2254)
ybaQ (NEIS2837)
ybe (NEIS2263)
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ycb (NEIS2270)
ych (NEIS2275)
ych1 (NEIS2312)
yda (NEIS2279)
ydbA (NEIS2280)
ydbB (NEIS2281)
ydcA (NEIS2282)
ydcB (NEIS2283)
ydd (NEIS2284)
ydeA (NEIS2285)
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ydf (NEIS2287)
ydg (NEIS2288)
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ydhB (NEIS2290)
ydi (NEIS2291)
ydiP (NEIS2796)
yea (NEIS2292)
yeb (NEIS2293)
yecA (NEIS2294)
yecB (NEIS2295)
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yee (NEIS2298)
yegA (NEIS2204)
yegA (NEIS2299)
yegB (NEIS2300)
yeh (NEIS2301)
yfa (NEIS2304)
yfb (NEIS2305)
yfcA (NEIS2488)
yfd (NEIS2306)
yfeA (NEIS2307)
yfeB (NEIS2308)
yhbG (NEIS1812)
zupT (NEIS0165)
ST (MLST)
clonal complex (MLST)
pST (beta lactamase plasmid)
MenDeVAR Bexsero reactivity (Bexsero Antigen Sequence Typing (BAST))
MenDeVAR Trumenba reactivity (Bexsero Antigen Sequence Typing (BAST))
BAST (Bexsero Antigen Sequence Typing (BAST))
pST (Conjugative Plasmid)
pST (Cryptic Plasmid)
ST (NG MAST v2.0)
cgST (N. gonorrhoeae cgMLST v1.0)
ST (NG STAR)
cgST (N. meningitidis cgMLST v1.0)
rST (Ribosomal MLST)
genus (Ribosomal MLST)
species (Ribosomal MLST)
subspecies (Ribosomal MLST)
lineage (Ribosomal MLST)
sublineage (Ribosomal MLST)
other designation (Ribosomal MLST)
notes (Ribosomal MLST)
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