tpiA allele sequence: id-95

Contig position

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876
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8494
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8970
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yes
Options

Sequence

AGCAAAAGAC TTTGTTAATG AACTTCCAGC ATTACCAGAT ACTAATGAGG TAGATTCAGT AATTTGTGCA CCAACTTTAC AATTAGATGC ACTTGTTAAC TTAACTAAAG AAGGCGTAGC ACAAGGCTTA CAAATTGGTG CGCAAAATGC ATACTTTGAA GATAATGGTG CTTTCACTGG TGAAACATCT CCAGCAGCAC TTGAAGATTT AGGTGTTAAG TATGTCGTTT TAGGACATTC TGAACGTCGT GAATACTTCC ACGAAACTGA CGAAGATGTT AATAAAAAAG CATTAGCTGT ATTTTCTCAT AATATGACAC CAATTATTTG TGTTGGTGAA ACATTAGAAG AAAGAGAAGC AGGTAAAGCT GAATCAGTAG TAGGTGGTCA AGTTGAAGCA GCACTTAAAG GCTTCACAGA AGATCAAGTT AAAGCGACAG TAATCGCTTA TGAACCTATC TGGGCAATTG GTACTGGTAA ATCTTCTACT TCTGAAGATG CTAACCAAAT GTGTGCACAC GTACGTAACG TTGTTGCAGG TGCTTTCTCT CAAGAAGCTG CTGATGCTTT ACGTGTACAA TACGGTGGTA GTGTTAAACC AGAAAATATT AAAGAATATA TGGCTCAATC AGATATCGAT GGCGCATTAG TTGGCGGCGC TTCATTAAAA GTTGATT

Translation


          S  K  R  L  C  *  *  T  S  S  I  T  R  Y  *  *  G  R  F  S  N  L  C  T  N  F  T  I  R  C  T  C  *  L   F1
           A  K  D  F  V  N  E  L  P  A  L  P  D  T  N  E  V  D  S  V  I  C  A  P  T  L  Q  L  D  A  L  V  N     F2
            Q  K  T  L  L  M  N  F  Q  H  Y  Q  I  L  M  R  *  I  Q  *  F  V  H  Q  L  Y  N  *  M  H  L  L  T    F3
        1 AGCAAAAGACTTTGTTAATGAACTTCCAGCATTACCAGATACTAATGAGGTAGATTCAGTAATTTGTGCACCAACTTTACAATTAGATGCACTTGTTAAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            N  *  R  R  R  S  T  R  L  T  N  W  C  A  K  C  I  L  *  R  *  W  C  F  H  W  *  N  I  S  S  S  T    F1
          L  T  K  E  G  V  A  Q  G  L  Q  I  G  A  Q  N  A  Y  F  E  D  N  G  A  F  T  G  E  T  S  P  A  A  L   F2
           *  L  K  K  A  *  H  K  A  Y  K  L  V  R  K  M  H  T  L  K  I  M  V  L  S  L  V  K  H  L  Q  Q  H     F3
      101 TTAACTAAAGAAGGCGTAGCACAAGGCTTACAAATTGGTGCGCAAAATGCATACTTTGAAGATAATGGTGCTTTCACTGGTGAAACATCTCCAGCAGCAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           *  R  F  R  C  *  V  C  R  F  R  T  F  *  T  S  *  I  L  P  R  N  *  R  R  C  *  *  K  S  I  S  C     F1
            E  D  L  G  V  K  Y  V  V  L  G  H  S  E  R  R  E  Y  F  H  E  T  D  E  D  V  N  K  K  A  L  A  V    F2
          L  K  I  *  V  L  S  M  S  F  *  D  I  L  N  V  V  N  T  S  T  K  L  T  K  M  L  I  K  K  H  *  L  Y   F3
      201 TTGAAGATTTAGGTGTTAAGTATGTCGTTTTAGGACATTCTGAACGTCGTGAATACTTCCACGAAACTGACGAAGATGTTAATAAAAAAGCATTAGCTGT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          I  F  S  *  Y  D  T  N  Y  L  C  W  *  N  I  R  R  K  R  S  R  *  S  *  I  S  S  R  W  S  S  *  S  S   F1
           F  S  H  N  M  T  P  I  I  C  V  G  E  T  L  E  E  R  E  A  G  K  A  E  S  V  V  G  G  Q  V  E  A     F2
            F  L  I  I  *  H  Q  L  F  V  L  V  K  H  *  K  K  E  K  Q  V  K  L  N  Q  *  *  V  V  K  L  K  Q    F3
      301 ATTTTCTCATAATATGACACCAATTATTTGTGTTGGTGAAACATTAGAAGAAAGAGAAGCAGGTAAAGCTGAATCAGTAGTAGGTGGTCAAGTTGAAGCA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            T  *  R  L  H  R  R  S  S  *  S  D  S  N  R  L  *  T  Y  L  G  N  W  Y  W  *  I  F  Y  F  *  R  C    F1
          A  L  K  G  F  T  E  D  Q  V  K  A  T  V  I  A  Y  E  P  I  W  A  I  G  T  G  K  S  S  T  S  E  D  A   F2
           H  L  K  A  S  Q  K  I  K  L  K  R  Q  *  S  L  M  N  L  S  G  Q  L  V  L  V  N  L  L  L  L  K  M     F3
      401 GCACTTAAAGGCTTCACAGAAGATCAAGTTAAAGCGACAGTAATCGCTTATGAACCTATCTGGGCAATTGGTACTGGTAAATCTTCTACTTCTGAAGATG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           *  P  N  V  C  T  R  T  *  R  C  C  R  C  F  L  S  R  S  C  *  C  F  T  C  T  I  R  W  *  C  *  T     F1
            N  Q  M  C  A  H  V  R  N  V  V  A  G  A  F  S  Q  E  A  A  D  A  L  R  V  Q  Y  G  G  S  V  K  P    F2
          L  T  K  C  V  H  T  Y  V  T  L  L  Q  V  L  S  L  K  K  L  L  M  L  Y  V  Y  N  T  V  V  V  L  N  Q   F3
      501 CTAACCAAATGTGTGCACACGTACGTAACGTTGTTGCAGGTGCTTTCTCTCAAGAAGCTGCTGATGCTTTACGTGTACAATACGGTGGTAGTGTTAAACC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  K  Y  *  R  I  Y  G  S  I  R  Y  R  W  R  I  S  W  R  R  F  I  K  S  *  X                           F1
           E  N  I  K  E  Y  M  A  Q  S  D  I  D  G  A  L  V  G  G  A  S  L  K  V  D  X                          F2
            K  I  L  K  N  I  W  L  N  Q  I  S  M  A  H  *  L  A  A  L  H  *  K  L  I                            F3
      601 AGAAAATATTAAAGAATATATGGCTCAATCAGATATCGATGGCGCATTAGTTGGCGGCGCTTCATTAAAAGTTGATT 677
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