gmk allele sequence: id-95

Contig position

sequence bin id
893
contig length
23094
start
4564
end
4929
length
366
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

GAACATAGAA AAAGGGTTAC TGATAGTGCT CTCTGGCCCA TCTGGAGTTG GTAAAGGAAC AGTACGTAAA TCAATATTTG ATGATCCGAG TACGGATTTT AAATATTCTA TCTCTATGAC TACTCGAAAC ATGCGTGAAG GAGAAACGGA TGGCGTAGAT TATTTCTTTA AATCAAGAGA AGAATTTGAA GCTTTAATTG CTGATGACCA ATTTATAGAG TATGCTGAGT ATGTTGGTAA TTACTATGGT ACGCCAGTAC AATACGTAAG AGATACGATG GATAACGGTT ATGATGTATT TTTAGAAATT GAAGTAGAAG GTGCGAAACA GGTTAGAAAG AAATTTCCTG AAGCATTATT TATTTTCTTA GCACCACCGA GTCTTGAGCA TTTAAAAGAA AGACTTGTCG GTCGTGGAAC TGAATCAGAT GAAATCATAC AGAACCGTAT TCTTGAAGCA CGTAAAGAAG TTGAAATGAT GAACCTTTAC GATTATGTTG TTGTAAACGA TGAAGTTGAA TTAGCGAAAG AGCGTATTCA AGCCATCGTA GAAGCTGAAC ACTTAA

Translation


          E  H  R  K  R  V  T  D  S  A  L  W  P  I  W  S  W  *  R  N  S  T  *  I  N  I  *  *  S  E  Y  G  F  *   F1
           N  I  E  K  G  L  L  I  V  L  S  G  P  S  G  V  G  K  G  T  V  R  K  S  I  F  D  D  P  S  T  D  F     F2
            T  *  K  K  G  Y  *  *  C  S  L  A  H  L  E  L  V  K  E  Q  Y  V  N  Q  Y  L  M  I  R  V  R  I  L    F3
        1 GAACATAGAAAAAGGGTTACTGATAGTGCTCTCTGGCCCATCTGGAGTTGGTAAAGGAACAGTACGTAAATCAATATTTGATGATCCGAGTACGGATTTT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            I  F  Y  L  Y  D  Y  S  K  H  A  *  R  R  N  G  W  R  R  L  F  L  *  I  K  R  R  I  *  S  F  N  C    F1
          K  Y  S  I  S  M  T  T  R  N  M  R  E  G  E  T  D  G  V  D  Y  F  F  K  S  R  E  E  F  E  A  L  I  A   F2
           N  I  L  S  L  *  L  L  E  T  C  V  K  E  K  R  M  A  *  I  I  S  L  N  Q  E  K  N  L  K  L  *  L     F3
      101 AAATATTCTATCTCTATGACTACTCGAAACATGCGTGAAGGAGAAACGGATGGCGTAGATTATTTCTTTAAATCAAGAGAAGAATTTGAAGCTTTAATTG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           *  *  P  I  Y  R  V  C  *  V  C  W  *  L  L  W  Y  A  S  T  I  R  K  R  Y  D  G  *  R  L  *  C  I     F1
            D  D  Q  F  I  E  Y  A  E  Y  V  G  N  Y  Y  G  T  P  V  Q  Y  V  R  D  T  M  D  N  G  Y  D  V  F    F2
          L  M  T  N  L  *  S  M  L  S  M  L  V  I  T  M  V  R  Q  Y  N  T  *  E  I  R  W  I  T  V  M  M  Y  F   F3
      201 CTGATGACCAATTTATAGAGTATGCTGAGTATGTTGGTAATTACTATGGTACGCCAGTACAATACGTAAGAGATACGATGGATAACGGTTATGATGTATT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          F  R  N  *  S  R  R  C  E  T  G  *  K  E  I  S  *  S  I  I  Y  F  L  S  T  T  E  S  *  A  F  K  R  K   F1
           L  E  I  E  V  E  G  A  K  Q  V  R  K  K  F  P  E  A  L  F  I  F  L  A  P  P  S  L  E  H  L  K  E     F2
            *  K  L  K  *  K  V  R  N  R  L  E  R  N  F  L  K  H  Y  L  F  S  *  H  H  R  V  L  S  I  *  K  K    F3
      301 TTTAGAAATTGAAGTAGAAGGTGCGAAACAGGTTAGAAAGAAATTTCCTGAAGCATTATTTATTTTCTTAGCACCACCGAGTCTTGAGCATTTAAAAGAA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            T  C  R  S  W  N  *  I  R  *  N  H  T  E  P  Y  S  *  S  T  *  R  S  *  N  D  E  P  L  R  L  C  C    F1
          R  L  V  G  R  G  T  E  S  D  E  I  I  Q  N  R  I  L  E  A  R  K  E  V  E  M  M  N  L  Y  D  Y  V  V   F2
           D  L  S  V  V  E  L  N  Q  M  K  S  Y  R  T  V  F  L  K  H  V  K  K  L  K  *  *  T  F  T  I  M  L     F3
      401 AGACTTGTCGGTCGTGGAACTGAATCAGATGAAATCATACAGAACCGTATTCTTGAAGCACGTAAAGAAGTTGAAATGATGAACCTTTACGATTATGTTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  K  R  *  S  *  I  S  E  R  A  Y  S  S  H  R  R  S  *  T  L  X                                      F1
            V  N  D  E  V  E  L  A  K  E  R  I  Q  A  I  V  E  A  E  H  L  X                                     F2
          L  *  T  M  K  L  N  *  R  K  S  V  F  K  P  S  *  K  L  N  T  *                                       F3
      501 TTGTAAACGATGAAGTTGAATTAGCGAAAGAGCGTATTCAAGCCATCGTAGAAGCTGAACACTTAA 566
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