PubMLST Database home Contents
Log in
Help

Sequence bin for L. biflexa. Patoc 1 (Paris)

Contig summary statistics

Contigs
3
Total length
3,951,448
Minimum length
74,116
Maximum length
3,599,677
Mean length
1,317,150
N50 contig number
1
N50 length (L50)
3,599,677
N90 contig number
1
N90 length (L90)
3,599,677
N95 contig number
2
N95 length (L95)
277,655

FASTAEMBLGBKGFF3

SequenceSequencing methodOriginal designationLengthCommentsLocusStartEndDirectionAnnotation
94Sanger6425551253599677NC_010602 Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' chromosome I, complete sequence.LEPT00005 43336252 EMBL GBK
LEPT00006 62728803
LEPT00035 2412226104
LEPT03905 3738338582
LEPT03783 3869440085
LEPT03080 4728248586
LEPT03484 4869549462
LEPT03627 5605157217
LEPT03634 6213863694
LEPT04248 7174572608
LEPT04168 8379984212
LEPT04165 8686588073
LEPT03982 140731141102
LEPT03964 161146162162
LEPT00280 163235164446
LEPT04092 168109169536
LEPT00335 175429176826
LEPT00693 182925184139
LEPT03577 189695190477
LEPT03576 190487191320
LEPT03819 223900225852
LEPT03822 227116228057
LEPT03747 252066253415
LEPT03961 262046262948
LEPT00447 268834268995
LEPT00179 285777286508
BACT000063 (rpmH) 289046289207
LEPT03636 305566306810
LEPT00612 316390317589
LEPT00618 320886321872
LEPT03939 344782345783
LEPT03941 346521347525
LEPT03948 350803351771
LEPT00457 354518355699
LEPT02759 439088440110
LEPT01511 467471469072
LEPT01518 474657475727
LEPT04155 502781503512
LEPT04150 508461509486
BACT000020 (rpsT) 513407513682
LEPT03803 519107520708
LEPT02739 548418549296
LEPT00144 561286561927
LEPT00146 565407567524
LEPT01963 576549577967
LEPT03461 579167580579
LEPT00082 586779587633
LEPT00083 587737588583
LEPT00084 588621589325
LEPT04139 600825602090
LEPT04138 602104603414
LEPT04190 682296683849
LEPT04193 684784686169
LEPT04194 686176688302
LEPT00828 717252718571
LEPT04242 718620719621
LEPT03350 737934740135
LEPT02591 755184756884
LEPT00346 767512767973
LEPT00347 767984768415
LEPT02917 790667791305
LEPT02627 804620805798
LEPT03806 813204814493
LEPT02779 818914820428
LEPT02776 821331822737
LEPT02143 841130842185
BACT000001 (rpsA) 854889856046
LEPT00649 857245859239
LEPT03596 859253861742
LEPT02575 903246903542
LEPT01388 910462911946
LEPT03070 928447928788
LEPT03052 942580943881
LEPT02935 944687945715
LEPT01948 963420963890
LEPT01459 969586970890
LEPT02605 976745977668
LEPT02603 978240979040
LEPT02558 10059001007180
LEPT01409 10514671052717
BACT000057 (rpmB) 10645741064864
LEPT00778 10683031069235
LEPT00776 10695801070806
LEPT01021 10738861075289
BACT000060 (rpmE) 10753001075500
LEPT01019 10755501076344
LEPT00790 10841181085407
LEPT00799 10898351090275
LEPT01224 10955761098344
LEPT02894 11693031169926
LEPT00411 11800921181050
LEPT00412 11810611181822
LEPT00414 11863171187501
LEPT02139 11923291193312
LEPT00313 11995421201662
LEPT04220 12315611232469
LEPT01986 13181801319706
LEPT00895 13513211351698
LEPT00892 13527841354004
LEPT00890 13544941355765
LEPT00889 13557811356851
LEPT02119 13783691379865
LEPT01487 13938321394974
LEPT02821 14098001410204
LEPT02809 14146511415244
LEPT02808 14152781416675
LEPT00841 14218971422942
LEPT03266 14289491430322
LEPT01032 14389741439807
BACT000042 (rplM) 14452021445654
BACT000009 (rpsI) 14456561446051
LEPT01147 14649751466183
LEPT01293 14677551468897
LEPT01313 14803991481859
LEPT01044 14948811495285
LEPT01132 15154741515731
LEPT02297 15213141522636
LEPT02283 15298691531410
LEPT00942 15882751589675
LEPT00943 15896911592444
BACT000015 (rpsO) 15939291594195
LEPT02667 15981931598987
LEPT02009 16255501626524
LEPT02226 16292921630443
BACT000021 (rpsU) 16313441631562
LEPT02229 16313441631562
LEPT02232 16338781635650
LEPT02237 16386371639863
LEPT02438 16444901645029
LEPT02433 16487411650387
LEPT02420 16638101664757
LEPT02418 16649941665842
LEPT02071 16777551678675
LEPT02072 16786771679597
LEPT02081 16846401685665
LEPT02095 16984101699804
LEPT02096 16998061700432
LEPT02409 17199751721597
LEPT02405 17243951725093
BACT000016 (rpsP) 17363821736639
BACT000048 (rplS) 17380551738483
LEPT02374 17478251749501
LEPT02360 17573941761020
LEPT01897 17700591771984
LEPT01896 17719841772724
LEPT01888 17757171777522
LEPT01951 17776451778946
LEPT01953 17794141780022
LEPT01880 17881101788505
LEPT01865 17953681796210
LEPT01863 17971591798616
LEPT02188 18238451824633
LEPT02048 18375201838632
LEPT02044 18414761842042
LEPT01378 18509671852796
BACT000050 (rplU) 18528941853202
BACT000056 (rpmA) 18535361853793
LEPT02690 18696401870116
LEPT02712 18799121882014
LEPT01105 18963521897728
LEPT02513 19063261909748
LEPT02515 19106061911898
LEPT02202 19366251938127
LEPT02057 19559871956763
LEPT01995 19895151991008
LEPT01911 19917751992998
LEPT02113 19984671999237
LEPT03563 20089602009712
BACT000046 (rplQ) 20275922028110
LEPT00765 20281122029089
BACT000004 (rpsD) 20291152029747
LEPT00764 20291152029747
BACT000011 (rpsK) 20297572030170
LEPT00763 20297572030170
BACT000013 (rpsM) 20301822030559
LEPT00762 20301822030559
BACT000065 (rpmJ) 20305662030679
LEPT00761 20306892030907
LEPT00760 20309182031481
LEPT00759 20314852032864
BACT000044 (rplO) 20328712033404
BACT000059 (rpmD) 20334092033588
BACT000005 (rpsE) 20336032034109
LEPT00756 20336032034109
BACT000047 (rplR) 20341102034478
LEPT00754 20344852035024
BACT000035 (rplF) 20344852035024
BACT000008 (rpsH) 20350392035437
BACT000014 (rpsN) 20354552035640
LEPT00751 20356512036202
BACT000034 (rplE) 20356512036202
LEPT00750 20362052036588
BACT000053 (rplX) 20362052036588
LEPT00749 20365902036982
BACT000043 (rplN) 20365902036982
BACT000017 (rpsQ) 20369792037248
BACT000058 (rpmC) 20372522037524
LEPT00746 20375212037934
BACT000045 (rplP) 20375212037934
LEPT00745 20379572038634
BACT000003 (rpsC) 20379572038634
BACT000051 (rplV) 20386382038988
BACT000019 (rpsS) 20389972039275
BACT000031 (rplB) 20392892040125
BACT000052 (rplW) 20401282040433
BACT000033 (rplD) 20404382041073
BACT000032 (rplC) 20410852041708
LEPT00738 20417202042028
BACT000010 (rpsJ) 20417202042028
LEPT00737 20420332043238
BACT000007 (rpsG) 20452902045763
LEPT03416 20452902045763
BACT000012 (rpsL) 20457782046152
LEPT03417 20457782046152
LEPT03419 20463002050601
LEPT03420 20506162054302
LEPT03421 20544282054811
BACT000036 (rplL) 20544282054811
BACT000039 (rplJ) 20548472055380
BACT000030 (rplA) 20553932056085
LEPT03423 20553932056085
LEPT03424 20561112056536
BACT000040 (rplK) 20561112056536
LEPT03425 20565762057130
LEPT02323 20577352058427
LEPT02324 20585012059268
LEPT01577 21192552120211
LEPT01102 21445752145786
LEPT01101 21457992146689
LEPT01704 21748522175859
LEPT01703 21758612177051
BACT000038 (rplI) 21930622193508
BACT000018 (rpsR) 21935172193861
BACT000006 (rpsF) 21943102194585
LEPT02019 22240732224921
LEPT02017 22250962225941
LEPT01205 22389252239503
LEPT01735 23603212361949
LEPT01729 23650462365402
LEPT01930 23703322371462
LEPT02154 23845122386266
LEPT02152 23874772388556
LEPT03096 24000502400385
LEPT03094 24015942402073
LEPT02654 24152522415542
LEPT02655 24155652417214
LEPT02337 24193302420382
LEPT02346 24256932426226
LEPT02483 24267042427612
LEPT02494 24282922429233
LEPT02570 24316542433381
LEPT02572 24334602434578
LEPT00380 24496432450302
LEPT01255 24600712460709
LEPT01253 24614632461825
BACT000049 (rplT) 24682882468641
BACT000064 (rpmI) 24686452468845
LEPT01240 24704402472356
LEPT02840 25057162506648
LEPT02841 25074912508483
LEPT02179 25209702522133
LEPT02818 25959612596995
LEPT02130 26310012632218
LEPT02129 26322272633924
LEPT02611 26397682640577
LEPT00512 26470762648095
LEPT00391 26606022663151
LEPT01264 26784672679489
BACT000061 (rpmF) 26794952679695
BACT000001 (rpsA) 26811322682832
LEPT03289 26974782698668
LEPT03297 27064732707069
LEPT03298 27070692707971
BACT000002 (rpsB) 27070692707971
LEPT02469 27578462758310
LEPT00250 27721102773166
LEPT00249 27732072773788
LEPT00243 27796812781294
LEPT00970 28216242822385
LEPT03173 28233052824801
LEPT00632 29297762930237
LEPT00629 29323432932621
LEPT00627 29327002934241
LEPT03143 29732572974423
LEPT04067 29819892983200
LEPT03144 30025283003676
LEPT02876 30198783020393
LEPT00258 30334083036929
LEPT00256 30395753041038
LEPT02589 30493963050319
LEPT02632 30711823072147
LEPT02633 30721503073316
LEPT00251 30948253096417
LEPT02755 31845593186496
LEPT02751 32281143228335
LEPT00296 32306883231935
LEPT00185 32429393244327
LEPT03607 32800403280459
LEPT00361 32998273300219
LEPT00360 33002303303151
LEPT02947 33216903322535
LEPT04308 33275693328837
LEPT04309 33288403330753
LEPT00051 33450903346022
LEPT04039 33473033348211
LEPT00072 33625373363054
LEPT00833 33855383386329
LEPT00114 33943843395445
LEPT00119 33986943399116
LEPT00560 34297793431455
LEPT03363 34419133443088
LEPT03709 34959483496910
LEPT03706 34969353498062
LEPT03705 34980853500019
LEPT03135 35230583524272
LEPT00161 35254653525992
LEPT00025 35425343543547
LEPT04327 35557853556708
LEPT04036 35593783562224
LEPT01471 35667543568901
LEPT04254 35702783572242
LEPT04255 35723263572877
LEPT04342 35893813589734
LEPT04347 35929123593673
LEPT04359 35956313597505
93Sanger642555186277655NC_010843 Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' chromosome II, complete sequence.BACT000062 (rpmG) 161463161624 EMBL GBK
95 Sanger 642555187 74116 NC_010844 Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' plasmid p74, complete sequence.