sucC allele sequence: id-84
Contig position
- sequence bin id
- 92
- contig length
- 186997
- start
- 27820
- end
- 28368
- length
- 549
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TAAAATTGCA AAATCAAAAG AAGAAGTCAA AGCCTATGCG GAAGAATTGT TGGGGAAGAC GCTTGTCACT CACCAGACGG GTCCTGACGG CCAGCAAATA AAACGCTTAC TTATTGAAGA AGGCTGCGAT ATCAAAAAAG AATACTATGT CGGTCTGGTT CTTGACAGGG CGACTTCACG CATCGTGCTG ATGGCATCCG AAGAAGGCGG CACGGAAATT GAAGAAGTCG CTGAAAAAAC GCCGGAAAAA ATCGTCAAAG AAGTGATCGA TCCGGCTGTC GGACTGCAGG GTTACCAGGC GAGAAAAATC GCCTTCGCCA TCAATATCCC GAAAGAGCTT GTCGGCCAGG CTGTTAAGTT TATGATGGGA TTGTACAAGG CGTTTACTGA AAAAGACTGT TCCATTGCTG AAATCAATCC GCTCGTCGTC ACAGGTGACG GAAAAGTCAT GGCCCTTGAC GCCAAGCTGA ACTTTGACAG CAATGCGCTA TACAGACAAA AAGACATCTT GGAGTACAGA GATCTCGATG AAGAAGATCC GAAGGAAATC GAAGCATCCA AGTATGATTT AAGCTATATT TCGCTCGATG GAAACATCGG CTGCATGGTC AACGGAGCGG GGCTTGCGAT GTCGACCATG GACATTATCA AGCACTACGG AGGGGAACCG GCCAACTTCC TTGACGTTGG AGGCGGCGCG ACAGCTGAAA AGGTAACGGA AGCGTTCAAG ATCATTTTGT CTGATCAAA
Translation
* N C K I K R R S Q S L C G R I V G E D A C H S P D G S * R P A N K F1
K I A K S K E E V K A Y A E E L L G K T L V T H Q T G P D G Q Q I F2
K L Q N Q K K K S K P M R K N C W G R R L S L T R R V L T A S K * F3
1 TAAAATTGCAAAATCAAAAGAAGAAGTCAAAGCCTATGCGGAAGAATTGTTGGGGAAGACGCTTGTCACTCACCAGACGGGTCCTGACGGCCAGCAAATA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
T L T Y * R R L R Y Q K R I L C R S G S * Q G D F T H R A D G I R F1
K R L L I E E G C D I K K E Y Y V G L V L D R A T S R I V L M A S E F2
N A Y L L K K A A I S K K N T M S V W F L T G R L H A S C * W H P F3
101 AAACGCTTACTTATTGAAGAAGGCTGCGATATCAAAAAAGAATACTATGTCGGTCTGGTTCTTGACAGGGCGACTTCACGCATCGTGCTGATGGCATCCG 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R R R H G N * R S R * K N A G K N R Q R S D R S G C R T A G L P G F1
E G G T E I E E V A E K T P E K I V K E V I D P A V G L Q G Y Q A F2
K K A A R K L K K S L K K R R K K S S K K * S I R L S D C R V T R R F3
201 AAGAAGGCGGCACGGAAATTGAAGAAGTCGCTGAAAAAACGCCGGAAAAAATCGTCAAAGAAGTGATCGATCCGGCTGTCGGACTGCAGGGTTACCAGGC 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
E K N R L R H Q Y P E R A C R P G C * V Y D G I V Q G V Y * K R L F F1
R K I A F A I N I P K E L V G Q A V K F M M G L Y K A F T E K D C F2
E K S P S P S I S R K S L S A R L L S L * W D C T R R L L K K T V F3
301 GAGAAAAATCGCCTTCGCCATCAATATCCCGAAAGAGCTTGTCGGCCAGGCTGTTAAGTTTATGATGGGATTGTACAAGGCGTTTACTGAAAAAGACTGT 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
H C * N Q S A R R H R * R K S H G P * R Q A E L * Q Q C A I Q T K F1
S I A E I N P L V V T G D G K V M A L D A K L N F D S N A L Y R Q K F2
P L L K S I R S S S Q V T E K S W P L T P S * T L T A M R Y T D K F3
401 TCCATTGCTGAAATCAATCCGCTCGTCGTCACAGGTGACGGAAAAGTCATGGCCCTTGACGCCAAGCTGAACTTTGACAGCAATGCGCTATACAGACAAA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R H L G V Q R S R * R R S E G N R S I Q V * F K L Y F A R W K H R F1
D I L E Y R D L D E E D P K E I E A S K Y D L S Y I S L D G N I G F2
K T S W S T E I S M K K I R R K S K H P S M I * A I F R S M E T S A F3
501 AAGACATCTTGGAGTACAGAGATCTCGATGAAGAAGATCCGAAGGAAATCGAAGCATCCAAGTATGATTTAAGCTATATTTCGCTCGATGGAAACATCGG 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
L H G Q R S G A C D V D H G H Y Q A L R R G T G Q L P * R W R R R D F1
C M V N G A G L A M S T M D I I K H Y G G E P A N F L D V G G G A F2
A W S T E R G L R C R P W T L S S T T E G N R P T S L T L E A A R F3
601 CTGCATGGTCAACGGAGCGGGGCTTGCGATGTCGACCATGGACATTATCAAGCACTACGGAGGGGAACCGGCCAACTTCCTTGACGTTGGAGGCGGCGCG 700
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S * K G N G S V Q D H F V * S X F1
T A E K V T E A F K I I L S D Q X F2
Q L K R * R K R S R S F C L I K F3
701 ACAGCTGAAAAGGTAACGGAAGCGTTCAAGATCATTTTGTCTGATCAAA 749
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----