spo0A allele sequence: id-84

Contig position

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97
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1020369
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end
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orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          *  *  *  Q  G  A  C  R  P  I  K  R  I  Y  R  G  T  K  R  H  G  S  A  W  C  R  I  Q  R  T  G  M  P  F   F1
           D  D  N  R  E  L  V  G  L  L  S  E  Y  I  E  G  Q  S  D  M  E  V  L  G  V  A  Y  N  G  Q  E  C  L     F2
            M  I  T  G  S  L  S  A  Y  *  A  N  I  S  R  D  K  A  T  W  K  C  L  V  S  H  T  T  D  R  N  A  F    F3
        1 TGATGATAACAGGGAGCTTGTCGGCCTATTAAGCGAATATATCGAGGGACAAAGCGACATGGAAGTGCTTGGTGTCGCATACAACGGACAGGAATGCCTT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  V  *  R  Q  G  A  R  C  A  C  A  G  Y  Y  Y  A  S  S  R  R  I  G  R  S  *  K  A  E  G  I  A  A    F1
          S  L  F  K  D  K  E  P  D  V  L  V  L  D  I  I  M  P  H  L  D  G  L  A  V  L  E  R  L  R  E  S  Q  L   F2
           R  C  L  K  T  R  S  P  M  C  L  C  W  I  L  L  C  L  I  S  T  D  W  P  F  L  K  G  *  G  N  R  S     F3
      101 TCGTTGTTTAAAGACAAGGAGCCCGATGTGCTTGTGCTGGATATTATTATGCCTCATCTCGACGGATTGGCCGTTCTTGAAAGGCTGAGGGAATCGCAGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           *  K  A  A  E  C  H  H  A  D  G  V  R  S  G  R  R  D  E  K  S  C  R  F  G  R  V  V  F  Y  F  E  A     F1
            K  K  Q  P  N  V  I  M  L  T  A  F  G  Q  E  D  V  T  K  K  A  V  D  L  G  A  S  Y  F  I  L  K  P    F2
          L  K  S  S  R  M  S  S  C  *  R  R  S  V  R  K  T  *  R  K  K  L  *  I  W  A  R  R  I  L  F  *  S  L   F3
      201 TTAAAAAGCAGCCGAATGTCATCATGCTGACGGCGTTCGGTCAGGAAGACGTGACGAAAAAAGCTGTAGATTTGGGCGCGTCGTATTTTATTTTGAAGCC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          F  *  H  G  E  L  S  R  P  Y  P  P  G  *  R  K  R  V  S  I  D  T  P  C  P  V  L  S  K  Q  C  A  S  A   F1
           F  D  M  E  N  L  V  G  H  I  R  Q  V  S  G  N  G  S  Q  L  T  H  R  A  P  S  S  Q  S  S  V  L  R     F2
            L  T  W  R  T  *  S  A  I  S  A  R  L  A  E  T  G  L  N  *  H  T  V  P  R  P  L  K  A  V  C  F  G    F3
      301 TTTTGACATGGAGAACTTAGTCGGCCATATCCGCCAGGTTAGCGGAAACGGGTCTCAATTGACACACCGTGCCCCGTCCTCTCAAAGCAGTGTGCTTCGG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  A  G  I  A  E  E  K  P  G  C  Q  H  H  D  H  H  P  R  D  R  R  A  R  S  Y  K  R  L  F  I  L  K    F1
          P  Q  P  E  S  P  K  K  N  L  D  A  S  I  T  T  I  I  H  E  I  G  V  P  A  H  I  K  G  Y  L  Y  L  R   F2
           R  S  R  N  R  R  R  K  T  W  M  P  A  S  R  P  S  S  T  R  S  A  C  P  L  I  *  K  A  I  Y  T  *     F3
      401 CCGCAGCCGGAATCGCCGAAGAAAAACCTGGATGCCAGCATCACGACCATCATCCACGAGATCGGCGTGCCCGCTCATATAAAAGGCTATTTATACTTAA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  S  H  L  H  G  V  *  *  H  R  T  A  R  E  H  Y  K  S  A  L  S  G  Y  R  Q  K  I  Q  H  N  C  K     F1
            E  A  I  S  M  V  Y  N  D  I  E  L  L  G  S  I  T  K  V  L  Y  P  D  I  A  K  K  F  N  T  T  A  S    F2
          G  K  P  S  P  W  C  I  M  T  S  N  C  S  G  A  L  Q  K  C  F  I  R  I  S  P  K  N  S  T  Q  L  Q  A   F3
      501 GGGAAGCCATCTCCATGGTGTATAATGACATCGAACTGCTCGGGAGCATTACAAAAGTGCTTTATCCGGATATCGCCAAAAAATTCAACACAACTGCAAG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  S  R  T  G  D  S  P  R  H  R  S  R  M  E  Q  R  Q  Y  R  L  D  F  V  T  F  R  L  H  S  Q  H  V  K   F1
           R  V  E  R  A  I  R  H  A  I  E  V  A  W  S  R  G  N  I  D  S  I  S  S  L  F  G  Y  T  V  S  M  S     F2
            E  S  N  G  R  F  A  T  P  S  K  S  H  G  A  E  A  I  S  T  R  F  R  H  F  S  A  T  Q  S  A  C  Q    F3
      601 CCGAGTCGAACGGGCGATTCGCCACGCCATCGAAGTCGCATGGAGCAGAGGCAATATCGACTCGATTTCGTCACTTTTCGGCTACACAGTCAGCATGTCA 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  K  A  D  E  F  R  I  H  R  D  G  R  R  Q  A  E  T  G                                              F1
          K  A  K  P  T  N  S  E  F  I  A  M  V  A  D  K  L  R  L  X                                             F2
           K  Q  S  R  R  I  Q  N  S  S  R  W  S  Q  T  S  *  D  W                                               F3
      701 AAAGCAAAGCCGACGAATTCAGAATTCATCGCGATGGTCGCAGACAAGCTGAGACTGG 758
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