adk allele sequence: id-84

Contig position

sequence bin id
113
contig length
65815
start
44053
end
44517
length
465
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          F  P  L  K  *  R  G  R  G  I  R  N  E  L  S  L  N  G  T  A  W  S  R  *  R  D  T  G  *  T  D  C  *  R   F1
           S  L  *  N  R  E  D  G  E  S  E  M  N  L  V  L  M  G  L  P  G  A  G  K  G  T  Q  A  E  R  I  V  E     F2
            P  S  K  I  E  R  T  G  N  P  K  *  T  *  S  *  W  D  C  L  E  P  V  K  G  H  R  L  N  G  L  L  K    F3
        1 TTCCCTCTAAAATAGAGAGGACGGGGAATCCGAAATGAACTTAGTCTTAATGGGACTGCCTGGAGCCGGTAAAGGGACACAGGCTGAACGGATTGTTGAA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            F  W  D  T  S  Y  L  N  R  R  H  V  P  R  C  D  E  R  R  N  G  S  G  T  R  S  Q  I  I  H  *  *  R    F1
          D  F  G  I  P  H  I  S  T  G  D  M  F  R  A  A  M  K  E  E  T  D  L  G  L  E  A  K  S  Y  I  D  K  G   F2
           I  L  G  Y  L  I  S  Q  Q  E  T  C  S  A  L  R  *  K  K  K  R  I  W  D  S  K  P  N  H  T  L  I  K     F3
      101 GATTTTGGGATACCTCATATCTCAACAGGAGACATGTTCCGCGCTGCGATGAAAGAAGAAACGGATCTGGGACTCGAAGCCAAATCATACATTGATAAAG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           *  A  C  S  G  *  S  D  N  W  Y  C  Q  G  E  T  W  Q  E  *  L  *  R  R  F  S  S  G  R  I  S  E  N     F1
            E  L  V  P  D  E  V  T  I  G  I  V  R  E  R  L  G  K  N  D  C  D  G  G  F  L  L  D  G  F  P  R  T    F2
          V  S  L  F  R  M  K  *  Q  L  V  L  S  G  R  D  L  A  R  M  I  V  T  E  V  F  F  W  T  D  F  R  E  Q   F3
      201 GTGAGCTTGTTCCGGATGAAGTGACAATTGGTATTGTCAGGGAGAGACTTGGCAAGAATGATTGTGACGGAGGTTTTCTTCTGGACGGATTTCCGAGAAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  R  S  S  *  S  T  *  G  N  S  *  R  T  W  Q  V  D  *  P  C  H  Q  H  S  S  R  *  R  C  I  D  G  T   F1
           V  A  Q  A  E  A  L  E  E  I  L  K  G  L  G  K  S  I  D  H  V  I  N  I  Q  V  D  K  D  A  L  M  E     F2
            S  L  K  L  K  H  L  R  K  F  L  K  D  L  A  S  R  L  T  M  S  S  T  F  K  S  I  K  M  H  *  W  N    F3
      301 AGTCGCTCAAGCTGAAGCACTTGAGGAAATTCTTAAAGGACTTGGCAAGTCGATTGACCATGTCATCAACATTCAAGTCGATAAAGATGCATTGATGGAA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  D  R  T  Q  N  L  Q  K  L  R  C  N  L  S  F  S  L  *  S  A  C  E  R  K  C  M  R  Q  V  W  R  R    F1
          R  L  T  G  R  R  I  C  R  N  C  G  A  T  Y  H  L  V  F  N  P  P  A  K  E  N  V  C  D  K  C  G  G  E   F2
           V  *  Q  D  A  E  S  A  E  T  A  V  Q  L  I  I  *  S  L  I  R  L  R  K  K  M  Y  A  T  S  V  E  E     F3
      401 CGTCTGACAGGACGCAGAATCTGCAGAAACTGCGGTGCAACTTATCATTTAGTCTTTAATCCGCCTGCGAAAGAAAATGTATGCGACAAGTGTGGAGGAG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  L  S  A  *  R  R  *  *  S  Y  C  I  Y  T  V  R  G  Q  H  E  A  N  P  A  F  T  R  F  L  C  G  *     F1
            L  Y  Q  R  E  D  D  N  E  A  T  V  S  T  R  L  E  V  N  M  K  Q  T  Q  P  L  L  D  F  Y  A  D  K    F2
          S  F  I  S  V  K  T  I  M  K  L  L  Y  L  H  G  *  R  S  T  *  S  K  P  S  L  Y  S  I  S  M  R  I  K   F3
      501 AGCTTTATCAGCGTGAAGACGATAATGAAGCTACTGTATCTACACGGTTAGAGGTCAACATGAAGCAAACCCAGCCTTTACTCGATTTCTATGCGGATAA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  I  S  R  K  H  *  R  A  E  A  H  Q  *  S  L  R  *  Y  K  G  A                                       F1
           G  Y  L  V  N  I  D  G  Q  K  H  I  N  E  V  Y  A  D  I  K  E  X                                      F2
            D  I  S  *  T  L  T  G  R  S  T  S  M  K  F  T  L  I  *  R  S                                        F3
      601 AGGATATCTCGTAAACATTGACGGGCAGAAGCACATCAATGAAGTTTACGCTGATATAAAGGAGC 665
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