rpoB allele sequence: id-61

Contig position

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4
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706590
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495
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forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          Y  F  L  H  I  C  G  R  N  A  C  Y  T  Y  I  T  H  D  L  R  G  E  S  V  D  R  S  T  S  S  V  W  T  T   F1
           I  S  Y  I  F  A  E  E  M  L  V  T  H  I  L  R  M  I  *  G  V  N  Q  L  T  G  Q  L  V  Q  Y  G  R     F2
            F  L  T  Y  L  R  K  K  C  L  L  H  I  Y  Y  A  *  F  E  G  *  I  S  *  Q  V  N  *  F  S  M  D  D    F3
        1 TATTTCTTACATATTTGCGGAAGAAATGCTTGTTACACATATATTACGCATGATTTGAGGGGTGAATCAGTTGACAGGTCAACTAGTTCAGTATGGACGA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  P  A  Q  K  L  C  T  H  *  R  S  V  R  I  T  K  S  H  *  N  S  N  L  F  L  S  V  V  S  *  *  G    F1
          H  R  Q  R  R  S  Y  A  R  I  S  E  V  L  E  L  P  N  L  I  E  I  Q  T  S  S  Y  Q  W  F  L  D  E  G   F2
           T  A  S  A  E  A  M  H  A  L  A  K  C  *  N  Y  Q  I  S  L  K  F  K  P  L  L  I  S  G  F  L  M  R     F3
      101 CACCGCCAGCGCAGAAGCTATGCACGCATTAGCGAAGTGTTAGAATTACCAAATCTCATTGAAATTCAAACCTCTTCTTATCAGTGGTTTCTTGATGAGG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           S  *  R  D  V  S  R  H  I  A  N  *  G  F  H  W  *  P  L  S  G  I  Y  R  L  Q  L  G  R  A  *  V  S     F1
            L  R  E  M  F  Q  D  I  S  P  I  E  D  F  T  G  N  L  S  L  E  F  I  D  Y  S  L  G  E  P  K  Y  P    F2
          V  L  E  R  C  F  K  T  Y  R  Q  L  R  I  S  L  V  T  S  L  W  N  L  S  T  T  A  W  A  S  L  S  I  R   F3
      201 GTCTTAGAGAGATGTTTCAAGACATATCGCCAATTGAGGATTTCACTGGTAACCTCTCTCTGGAATTTATCGACTACAGCTTGGGCGAGCCTAAGTATCC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  R  R  I  K  R  A  R  R  D  L  L  S  S  A  A  C  *  S  P  L  N  Q  Q  R  D  R  *  S  K  G  S  G  C   F1
           V  E  E  S  K  E  R  D  V  T  Y  S  A  P  L  R  V  K  V  R  L  I  N  K  E  T  G  E  V  K  D  Q  D     F2
            *  K  N  Q  K  S  A  T  *  P  T  Q  L  R  C  V  L  K  S  A  *  S  T  K  R  P  V  K  *  R  I  R  M    F3
      301 GGTAGAAGAATCAAAAGAGCGCGACGTGACCTACTCAGCTCCGCTGCGTGTTAAAGTCCGCTTAATCAACAAAGAGACCGGTGAAGTAAAGGATCAGGAT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            L  H  G  *  F  P  Y  Y  D  R  H  W  N  L  Y  Y  Q  R  C  G  T  G  H  C  I  S  A  R  S  F  S  K  C    F1
          V  F  M  G  D  F  P  I  M  T  D  T  G  T  F  I  I  N  G  A  E  R  V  I  V  S  Q  L  V  R  S  P  S  V   F2
           S  S  W  V  I  S  L  L  *  Q  T  L  E  P  L  L  S  T  V  R  N  G  S  L  Y  L  S  S  F  V  L  Q  V     F3
      401 GTCTTCATGGGTGATTTCCCTATTATGACAGACACTGGAACCTTTATTATCAACGGTGCGGAACGGGTCATTGTATCTCAGCTCGTTCGTTCTCCAAGTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           I  F  *  W  *  S  R  Q  K  R  *  E  R  F  Y  R  D  C  H  S  K  P  W  R  M  V  R  I  R  D  *  C  E     F1
            Y  F  S  G  K  V  D  K  N  G  K  K  G  F  T  A  T  V  I  P  N  R  G  A  W  L  E  Y  E  T  D  A  K    F2
          Y  I  L  V  V  K  *  T  K  T  V  R  K  V  L  P  R  L  S  F  Q  T  V  A  H  G  *  N  T  R  L  M  R  K   F3
      501 TATATTTTAGTGGTAAAGTAGACAAAAACGGTAAGAAAGGTTTTACCGCGACTGTCATTCCAAACCGTGGCGCATGGTTAGAATACGAGACTGATGCGAA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  C  C  L  C  T  H  R  S  H  T  *  V  A  G  Y  G  S  F  A  C  S  W  L  R  I  *  P  R  D  H  X         F1
           D  V  V  Y  V  R  I  D  R  T  R  K  L  P  V  T  V  L  L  R  A  L  G  F  G  S  D  Q  E  I  I  X        F2
            M  L  F  M  Y  A  S  I  A  H  V  S  C  R  L  R  F  F  C  V  L  L  A  S  D  L  T  K  R  S  L          F3
      601 AGATGTTGTTTATGTACGCATCGATCGCACACGTAAGTTGCCGGTTACGGTTCTTTTGCGTGCTCTTGGCTTCGGATCTGACCAAGAGATCATTG 695
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