recF allele sequence: id-61

Contig position

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4
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4389210
start
1891997
end
1892557
length
561
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

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Translation


          P  S  D  V  K  *  *  R  T  H  T  M  G  *  R  L  C  *  N  R  R  Q  G  H  *  K  K  R  F  C  S  H  S  A   F1
           H  R  T  S  N  D  K  E  L  I  R  W  D  E  D  Y  A  K  I  E  G  R  V  I  K  K  N  G  S  V  P  I  Q     F2
            I  G  R  Q  M  I  K  N  S  Y  D  G  M  K  T  M  L  K  *  K  A  G  S  L  K  K  T  V  L  F  P  F  S    F3
        1 CCATCGGACGTCAAATGATAAAGAACTCATACGATGGGATGAAGACTATGCTAAAATAGAAGGCAGGGTCATTAAAAAAAACGGTTCTGTTCCCATTCAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  D  F  Q  K  R  K  K  R  *  S  *  S  Y  *  T  A  E  A  E  P  V  C  R  G  C  Q  H  D  Y  V  R  A    F1
          L  V  I  S  K  K  G  K  K  G  K  V  N  H  I  E  Q  Q  K  L  S  Q  Y  V  G  A  V  N  T  I  M  F  A  P   F2
           S  *  F  P  K  K  E  K  K  V  K  L  I  I  L  N  S  R  S  *  A  S  M  S  G  L  S  T  R  L  C  S  R     F3
      101 CTCGTGATTTCCAAAAAAGGAAAAAAAGGTAAAGTTAATCATATTGAACAGCAGAAGCTGAGCCAGTATGTCGGGGCTGTCAACACGATTATGTTCGCGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  G  F  K  S  C  K  R  K  S  S  G  Q  K  K  V  S  R  Y  G  N  R  P  S  I  T  C  L  S  S  *  P  F     F1
            E  D  L  N  L  V  K  G  S  P  Q  V  R  R  R  F  L  D  M  E  I  G  Q  V  S  P  V  Y  L  H  D  L  S    F2
          R  R  I  *  I  L  *  K  E  V  L  R  S  E  E  G  F  S  I  W  K  S  A  K  Y  H  L  S  I  F  M  T  F  L   F3
      201 CGGAGGATTTAAATCTTGTAAAAGGAAGTCCTCAGGTCAGAAGAAGGTTTCTCGATATGGAAATCGGCCAAGTATCACCTGTCTATCTTCATGACCTTTC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  L  P  K  N  P  F  T  T  E  S  F  P  E  T  A  S  N  E  K  A  N  R  S  N  D  A  *  R  A  D  G  T  A   F1
           L  Y  Q  K  I  L  S  Q  R  N  H  F  L  K  Q  L  Q  T  R  K  Q  T  D  Q  T  M  L  D  V  L  T  E  Q     F2
            F  T  K  K  S  F  H  N  G  I  I  S  *  N  S  F  K  R  E  S  K  P  I  K  R  C  L  T  C  *  R  N  S    F3
      301 TCTTTACCAAAAAATCCTTTCACAACGGAATCATTTCCTGAAACAGCTTCAAACGAGAAAGCAAACCGATCAAACGATGCTTGACGTGCTGACGGAACAG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            Y  G  I  R  S  K  G  C  D  E  T  A  S  V  C  R  S  A  *  K  M  G  S  A  H  S  F  R  N  F  K  R  S    F1
          L  T  E  F  A  A  K  V  V  M  K  R  L  Q  F  V  D  Q  L  E  K  W  A  Q  P  I  H  S  G  I  S  R  G  L   F2
           L  R  N  S  Q  Q  R  L  *  *  N  G  F  S  L  S  I  S  L  K  N  G  L  S  P  F  I  P  E  F  Q  E  V     F3
      401 CTTACGGAATTCGCAGCAAAGGTTGTGATGAAACGGCTTCAGTTTGTCGATCAGCTTGAAAAATGGGCTCAGCCCATTCATTCCGGAATTTCAAGAGGTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  R  A  D  A  K  V  S  Y  V  S  S  R  I  R  F  A  R  F  V  E  N  D  Q  *  L  S  R  N  V  F  *  I     F1
            E  E  L  T  L  K  Y  H  T  S  L  H  V  S  D  S  P  D  L  S  K  M  I  N  S  Y  Q  E  T  F  S  K  L    F2
          W  K  S  *  R  *  S  I  I  R  L  F  T  Y  Q  I  R  P  I  C  R  K  *  S  I  V  I  K  K  R  F  L  N  *   F3
      501 TGGAAGAGCTGACGCTAAAGTATCATACGTCTCTTCACGTATCAGATTCGCCCGATTTGTCGAAAATGATCAATAGTTATCAAGAAACGTTTTCTAAATT 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          K  R  *  R  N  R  T  G  G  I  S  V  R  S  P  Q  G  *  C  S  L  L  R  Q  W  P  *  C  A  D  L  R  I  A   F1
           R  D  K  E  I  E  R  G  V  S  L  S  G  P  H  R  D  D  V  L  F  Y  V  N  G  R  D  V  Q  T  Y  G  S     F2
            E  I  K  K  *  N  G  G  Y  L  C  Q  V  P  T  G  M  M  F  S  S  T  S  M  A  V  M  C  R  L  T  D  R    F3
      601 AAGAGATAAAGAAATAGAACGGGGGGTATCTCTGTCAGGTCCCCACAGGGATGATGTTCTCTTCTACGTCAATGGCCGTGATGTGCAGACTTACGGATCG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  S  A  A  N  D  C  I  V  A  *  I  G  *  N  R  F  D  S  G                                           F1
          Q  G  Q  Q  R  T  T  A  L  S  L  K  L  A  E  I  D  L  I  Q  X                                          F2
           R  V  S  S  E  R  L  H  C  R  L  N  W  L  K  S  I  *  F  R                                            F3
      701 CAGGGTCAGCAGCGAACGACTGCATTGTCGCTTAAATTGGCTGAAATCGATTTGATTCAGG 761
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