adk allele sequence: id-61

Contig position

sequence bin id
4
contig length
4389210
start
729137
end
729601
length
465
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TTCCCTCTAA AATAGAGAGG ACGGGGAATC CGAAATGAAC TTAGTCTTAA TGGGACTGCC TGGGGCCGGT AAAGGGACAC AGGCTGAACG GATTGTTGAA GATTTTGGGA TACCTCATAT CTCAACAGGA GACATGTTCC GCGCTGCGAT GAAAGAAGAA ACGGATCTGG GACTCGAAGC CAAATCATAC ATTGATAAAG GTGAGCTTGT TCCGGATGAA GTGACAATTG GTATTGTCAG GGAGAGACTT GGCAAGAATG ATTGTGACGG AGGTTTTCTT CTGGACGGAT TTCCGAGAAC AGTCGCTCAA GCTGAAGCAC TTGAGGAAAT TCTTAAAGGA CTTGGCAAGT CGATTGACCA TGTCATCAAC ATTCAAGTCG ATAAAGATGC ATTGATGGAA CGTCTGACAG GACGCAGAAT CTGCAGAAAC TGCGGTGCAA CTTATCATTT AGTCTTTAAT CCGCCTGCGA AAGAAAATGT ATGCGACAAG TGTGGAGGAG AGCTTTATCA GCGTGAAGAC GATAATGAAG CTACTGTATC TACACGGTTA GAGGTCAACA TGAAGCAAAC CCAGCCTTTA CTCGATTTCT ATGCGGATAA AGGATATCTC GTAAACATTG ACGGGCAGAA GCACATCAAT GAAGTTTACG CTGATATAAA GGAGC

Translation


          F  P  L  K  *  R  G  R  G  I  R  N  E  L  S  L  N  G  T  A  W  G  R  *  R  D  T  G  *  T  D  C  *  R   F1
           S  L  *  N  R  E  D  G  E  S  E  M  N  L  V  L  M  G  L  P  G  A  G  K  G  T  Q  A  E  R  I  V  E     F2
            P  S  K  I  E  R  T  G  N  P  K  *  T  *  S  *  W  D  C  L  G  P  V  K  G  H  R  L  N  G  L  L  K    F3
        1 TTCCCTCTAAAATAGAGAGGACGGGGAATCCGAAATGAACTTAGTCTTAATGGGACTGCCTGGGGCCGGTAAAGGGACACAGGCTGAACGGATTGTTGAA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            F  W  D  T  S  Y  L  N  R  R  H  V  P  R  C  D  E  R  R  N  G  S  G  T  R  S  Q  I  I  H  *  *  R    F1
          D  F  G  I  P  H  I  S  T  G  D  M  F  R  A  A  M  K  E  E  T  D  L  G  L  E  A  K  S  Y  I  D  K  G   F2
           I  L  G  Y  L  I  S  Q  Q  E  T  C  S  A  L  R  *  K  K  K  R  I  W  D  S  K  P  N  H  T  L  I  K     F3
      101 GATTTTGGGATACCTCATATCTCAACAGGAGACATGTTCCGCGCTGCGATGAAAGAAGAAACGGATCTGGGACTCGAAGCCAAATCATACATTGATAAAG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           *  A  C  S  G  *  S  D  N  W  Y  C  Q  G  E  T  W  Q  E  *  L  *  R  R  F  S  S  G  R  I  S  E  N     F1
            E  L  V  P  D  E  V  T  I  G  I  V  R  E  R  L  G  K  N  D  C  D  G  G  F  L  L  D  G  F  P  R  T    F2
          V  S  L  F  R  M  K  *  Q  L  V  L  S  G  R  D  L  A  R  M  I  V  T  E  V  F  F  W  T  D  F  R  E  Q   F3
      201 GTGAGCTTGTTCCGGATGAAGTGACAATTGGTATTGTCAGGGAGAGACTTGGCAAGAATGATTGTGACGGAGGTTTTCTTCTGGACGGATTTCCGAGAAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  R  S  S  *  S  T  *  G  N  S  *  R  T  W  Q  V  D  *  P  C  H  Q  H  S  S  R  *  R  C  I  D  G  T   F1
           V  A  Q  A  E  A  L  E  E  I  L  K  G  L  G  K  S  I  D  H  V  I  N  I  Q  V  D  K  D  A  L  M  E     F2
            S  L  K  L  K  H  L  R  K  F  L  K  D  L  A  S  R  L  T  M  S  S  T  F  K  S  I  K  M  H  *  W  N    F3
      301 AGTCGCTCAAGCTGAAGCACTTGAGGAAATTCTTAAAGGACTTGGCAAGTCGATTGACCATGTCATCAACATTCAAGTCGATAAAGATGCATTGATGGAA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  D  R  T  Q  N  L  Q  K  L  R  C  N  L  S  F  S  L  *  S  A  C  E  R  K  C  M  R  Q  V  W  R  R    F1
          R  L  T  G  R  R  I  C  R  N  C  G  A  T  Y  H  L  V  F  N  P  P  A  K  E  N  V  C  D  K  C  G  G  E   F2
           V  *  Q  D  A  E  S  A  E  T  A  V  Q  L  I  I  *  S  L  I  R  L  R  K  K  M  Y  A  T  S  V  E  E     F3
      401 CGTCTGACAGGACGCAGAATCTGCAGAAACTGCGGTGCAACTTATCATTTAGTCTTTAATCCGCCTGCGAAAGAAAATGTATGCGACAAGTGTGGAGGAG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  L  S  A  *  R  R  *  *  S  Y  C  I  Y  T  V  R  G  Q  H  E  A  N  P  A  F  T  R  F  L  C  G  *     F1
            L  Y  Q  R  E  D  D  N  E  A  T  V  S  T  R  L  E  V  N  M  K  Q  T  Q  P  L  L  D  F  Y  A  D  K    F2
          S  F  I  S  V  K  T  I  M  K  L  L  Y  L  H  G  *  R  S  T  *  S  K  P  S  L  Y  S  I  S  M  R  I  K   F3
      501 AGCTTTATCAGCGTGAAGACGATAATGAAGCTACTGTATCTACACGGTTAGAGGTCAACATGAAGCAAACCCAGCCTTTACTCGATTTCTATGCGGATAA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  I  S  R  K  H  *  R  A  E  A  H  Q  *  S  L  R  *  Y  K  G  A                                       F1
           G  Y  L  V  N  I  D  G  Q  K  H  I  N  E  V  Y  A  D  I  K  E  X                                      F2
            D  I  S  *  T  L  T  G  R  S  T  S  M  K  F  T  L  I  *  R  S                                        F3
      601 AGGATATCTCGTAAACATTGACGGGCAGAAGCACATCAATGAAGTTTACGCTGATATAAAGGAGC 665
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----: