sucC allele sequence: id-57

Contig position

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3
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4239205
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end
1802671
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orientation
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yes
Options

Sequence

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Translation


          *  N  C  K  I  K  R  R  S  Q  S  L  C  G  R  I  V  G  K  D  A  C  H  S  P  D  G  S  R  R  P  T  N  K   F1
           K  I  A  K  S  K  E  E  V  K  A  Y  A  E  E  L  L  G  K  T  L  V  T  H  Q  T  G  P  D  G  Q  Q  I     F2
            K  L  Q  N  Q  K  K  K  S  K  P  M  R  K  N  C  W  E  R  R  L  S  L  T  R  R  V  P  T  A  N  K  *    F3
        1 TAAAATTGCAAAATCAAAAGAAGAAGTCAAAGCCTATGCGGAAGAATTGTTGGGAAAGACGCTTGTCACTCACCAGACGGGTCCCGACGGCCAACAAATA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            T  L  T  Y  *  R  R  L  R  Y  Q  K  R  I  L  C  R  P  S  S  R  Q  G  D  F  T  H  R  A  D  G  L  *    F1
          K  R  L  L  I  E  E  G  C  D  I  K  K  E  Y  Y  V  G  L  V  L  D  R  A  T  S  R  I  V  L  M  A  S  E   F2
           N  A  Y  L  L  K  K  A  A  I  S  K  K  N  T  M  S  A  *  F  S  T  G  R  L  H  A  S  C  *  W  P  L     F3
      101 AAACGCTTACTTATTGAAGAAGGCTGCGATATCAAAAAAGAATACTATGTCGGCCTAGTTCTCGACAGGGCGACTTCACGCATCGTGCTGATGGCCTCTG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  R  R  H  G  N  *  R  S  R  *  K  N  T  G  K  N  R  Q  R  S  D  R  S  G  C  R  T  A  E  L  P  G     F1
            E  G  G  T  E  I  E  E  V  A  E  K  T  P  E  K  I  V  K  E  V  I  D  P  A  V  G  L  Q  S  Y  Q  A    F2
          K  K  A  A  R  K  L  K  K  S  L  K  K  H  R  K  K  S  S  K  K  *  S  I  R  L  S  D  C  R  A  T  R  R   F3
      201 AAGAAGGCGGCACGGAAATTGAAGAAGTCGCTGAAAAAACACCGGAAAAAATCGTCAAAGAAGTGATCGATCCGGCTGTCGGACTGCAGAGCTACCAGGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          E  K  N  R  L  R  H  Q  Y  S  E  R  A  C  R  P  G  R  *  V  Y  D  G  A  V  Q  G  V  Y  *  K  R  L  F   F1
           R  K  I  A  F  A  I  N  I  P  K  E  L  V  G  Q  A  V  K  F  M  M  G  L  Y  K  A  F  T  E  K  D  C     F2
            E  K  S  P  S  P  S  I  F  R  K  S  L  S  A  R  P  L  S  L  *  W  G  C  T  R  R  L  L  K  K  T  V    F3
      301 GAGAAAAATCGCCTTCGCCATCAATATTCCGAAAGAGCTTGTCGGCCAGGCCGTTAAGTTTATGATGGGGCTGTACAAGGCGTTTACTGAAAAAGACTGT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            H  C  *  N  Q  S  A  R  R  H  R  G  R  K  S  H  G  P  *  R  Q  A  E  L  *  Q  Q  C  A  I  Q  T  K    F1
          S  I  A  E  I  N  P  L  V  V  T  G  D  G  K  V  M  A  L  D  A  K  L  N  F  D  S  N  A  L  Y  R  Q  K   F2
           P  L  L  K  S  I  R  S  S  S  Q  G  T  E  K  S  W  P  L  T  P  S  *  T  L  T  A  M  R  Y  T  D  K     F3
      401 TCCATTGCTGAAATCAATCCGCTCGTCGTCACAGGGGACGGAAAAGTCATGGCCCTTGACGCCAAGCTGAACTTTGACAGCAATGCGCTATACAGACAAA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  H  L  G  V  Q  R  S  R  *  R  R  S  E  G  N  R  S  I  Q  V  *  F  K  L  Y  F  A  R  W  K  H  R     F1
            D  I  L  E  Y  R  D  L  D  E  E  D  P  K  E  I  E  A  S  K  Y  D  L  S  Y  I  S  L  D  G  N  I  G    F2
          K  T  S  W  S  T  E  I  S  M  K  K  I  R  R  K  S  K  H  P  S  M  I  *  A  I  F  R  S  M  E  T  S  A   F3
      501 AAGACATCTTGGAGTACAGAGATCTCGATGAAGAAGATCCGAAGGAAATCGAAGCATCCAAGTATGATTTAAGCTATATTTCGCTCGATGGAAACATCGG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  H  G  Q  R  S  G  A  C  D  V  D  H  G  H  Y  Q  A  L  R  R  G  T  G  Q  L  P  *  R  W  R  R  R  D   F1
           C  M  V  N  G  A  G  L  A  M  S  T  M  D  I  I  K  H  Y  G  G  E  P  A  N  F  L  D  V  G  G  G  A     F2
            A  W  S  T  E  R  G  L  R  C  R  P  W  T  L  S  S  T  T  E  G  N  R  P  T  S  L  T  L  E  A  A  R    F3
      601 CTGCATGGTCAACGGAGCGGGGCTTGCGATGTCGACCATGGACATTATCAAGCACTACGGAGGGGAACCGGCCAACTTCCTTGACGTTGGAGGCGGCGCG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  R  K  G  N  G  S  V  Q  D  H  F  V  *  S  X                                                       F1
          T  A  E  K  V  T  E  A  F  K  I  I  L  S  D  Q  X                                                      F2
           Q  P  K  R  *  R  K  R  S  R  S  F  C  L  I  K                                                        F3
      701 ACAGCCGAAAAGGTAACGGAAGCGTTCAAGATCATTTTGTCTGATCAAA 749
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