recF allele sequence: id-57

Contig position

sequence bin id
3
contig length
4239205
start
3306
end
3866
length
561
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

CCATCGGACG TCAAATGATA AAGAACTCAT ACGATGGGAT GAAGACTATG CTAAAATAGA AGGCAGGGTC ATTAAAAAAA ACGGTTCTGT TCCCATTCAG CTTGTGATTT CCAAAAAAGG AAAAAAAGGT AAAGTGAATC ATATTGAACA GCAGAAGCTG AGCCAGTATG TCGGGGCTGT CAACACGATT ATGTTCGCGC CGGAGGATTT AAATCTCGTA AAAGGAAGTC CTCAGGTCAG AAGAAGGTTT CTCGACATGG AAATCGGCCA AGTATCACCT GTCTATCTTC ATGACCTTTC TCTTTACCAA AAAATCCTTT CACAACGGAA TCATTTCTTG AAGCAGCTTC AAACGAGAAA GCAAACCGAT CAAACGATGC TTGACGTGCT GACGGAACAG CTTACGGAAT TCGCGGCAAA GGTTGTGATG AAACGGCTTC AGTTTGTCGA TCAGCTTGAA AAATGGGCTC AGCCCATTCA TTCCGGAATT TCAAGAGGTC TGGAAGAGCT GACGTTAAAG TATCATACGT CTCTTCACGT ATCAGATTCG CCCGATTTGT CGAAAATGAT CAATAGTTAT CAAGAAACGT TTTCTAAATT AAGAGATAAA GAAATAGAAC GGGGGGTATC TCTTTCAGGT CCCCACAGGG ATGATGTTCT TTTCTATGTC AATGGCCGTG ATGTGCAGAC TTACGGATCG CAGGGCCAGC AGCGCACGAC TGCATTGTCG CTTAAATTGG CTGAAATCGA CTTGATTCAG G

Translation


          P  S  D  V  K  *  *  R  T  H  T  M  G  *  R  L  C  *  N  R  R  Q  G  H  *  K  K  R  F  C  S  H  S  A   F1
           H  R  T  S  N  D  K  E  L  I  R  W  D  E  D  Y  A  K  I  E  G  R  V  I  K  K  N  G  S  V  P  I  Q     F2
            I  G  R  Q  M  I  K  N  S  Y  D  G  M  K  T  M  L  K  *  K  A  G  S  L  K  K  T  V  L  F  P  F  S    F3
        1 CCATCGGACGTCAAATGATAAAGAACTCATACGATGGGATGAAGACTATGCTAAAATAGAAGGCAGGGTCATTAAAAAAAACGGTTCTGTTCCCATTCAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            C  D  F  Q  K  R  K  K  R  *  S  E  S  Y  *  T  A  E  A  E  P  V  C  R  G  C  Q  H  D  Y  V  R  A    F1
          L  V  I  S  K  K  G  K  K  G  K  V  N  H  I  E  Q  Q  K  L  S  Q  Y  V  G  A  V  N  T  I  M  F  A  P   F2
           L  *  F  P  K  K  E  K  K  V  K  *  I  I  L  N  S  R  S  *  A  S  M  S  G  L  S  T  R  L  C  S  R     F3
      101 CTTGTGATTTCCAAAAAAGGAAAAAAAGGTAAAGTGAATCATATTGAACAGCAGAAGCTGAGCCAGTATGTCGGGGCTGTCAACACGATTATGTTCGCGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  G  F  K  S  R  K  R  K  S  S  G  Q  K  K  V  S  R  H  G  N  R  P  S  I  T  C  L  S  S  *  P  F     F1
            E  D  L  N  L  V  K  G  S  P  Q  V  R  R  R  F  L  D  M  E  I  G  Q  V  S  P  V  Y  L  H  D  L  S    F2
          R  R  I  *  I  S  *  K  E  V  L  R  S  E  E  G  F  S  T  W  K  S  A  K  Y  H  L  S  I  F  M  T  F  L   F3
      201 CGGAGGATTTAAATCTCGTAAAAGGAAGTCCTCAGGTCAGAAGAAGGTTTCTCGACATGGAAATCGGCCAAGTATCACCTGTCTATCTTCATGACCTTTC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  L  P  K  N  P  F  T  T  E  S  F  L  E  A  A  S  N  E  K  A  N  R  S  N  D  A  *  R  A  D  G  T  A   F1
           L  Y  Q  K  I  L  S  Q  R  N  H  F  L  K  Q  L  Q  T  R  K  Q  T  D  Q  T  M  L  D  V  L  T  E  Q     F2
            F  T  K  K  S  F  H  N  G  I  I  S  *  S  S  F  K  R  E  S  K  P  I  K  R  C  L  T  C  *  R  N  S    F3
      301 TCTTTACCAAAAAATCCTTTCACAACGGAATCATTTCTTGAAGCAGCTTCAAACGAGAAAGCAAACCGATCAAACGATGCTTGACGTGCTGACGGAACAG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            Y  G  I  R  G  K  G  C  D  E  T  A  S  V  C  R  S  A  *  K  M  G  S  A  H  S  F  R  N  F  K  R  S    F1
          L  T  E  F  A  A  K  V  V  M  K  R  L  Q  F  V  D  Q  L  E  K  W  A  Q  P  I  H  S  G  I  S  R  G  L   F2
           L  R  N  S  R  Q  R  L  *  *  N  G  F  S  L  S  I  S  L  K  N  G  L  S  P  F  I  P  E  F  Q  E  V     F3
      401 CTTACGGAATTCGCGGCAAAGGTTGTGATGAAACGGCTTCAGTTTGTCGATCAGCTTGAAAAATGGGCTCAGCCCATTCATTCCGGAATTTCAAGAGGTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  R  A  D  V  K  V  S  Y  V  S  S  R  I  R  F  A  R  F  V  E  N  D  Q  *  L  S  R  N  V  F  *  I     F1
            E  E  L  T  L  K  Y  H  T  S  L  H  V  S  D  S  P  D  L  S  K  M  I  N  S  Y  Q  E  T  F  S  K  L    F2
          W  K  S  *  R  *  S  I  I  R  L  F  T  Y  Q  I  R  P  I  C  R  K  *  S  I  V  I  K  K  R  F  L  N  *   F3
      501 TGGAAGAGCTGACGTTAAAGTATCATACGTCTCTTCACGTATCAGATTCGCCCGATTTGTCGAAAATGATCAATAGTTATCAAGAAACGTTTTCTAAATT 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          K  R  *  R  N  R  T  G  G  I  S  F  R  S  P  Q  G  *  C  S  F  L  C  Q  W  P  *  C  A  D  L  R  I  A   F1
           R  D  K  E  I  E  R  G  V  S  L  S  G  P  H  R  D  D  V  L  F  Y  V  N  G  R  D  V  Q  T  Y  G  S     F2
            E  I  K  K  *  N  G  G  Y  L  F  Q  V  P  T  G  M  M  F  F  S  M  S  M  A  V  M  C  R  L  T  D  R    F3
      601 AAGAGATAAAGAAATAGAACGGGGGGTATCTCTTTCAGGTCCCCACAGGGATGATGTTCTTTTCTATGTCAATGGCCGTGATGTGCAGACTTACGGATCG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  P  A  A  H  D  C  I  V  A  *  I  G  *  N  R  L  D  S  G                                           F1
          Q  G  Q  Q  R  T  T  A  L  S  L  K  L  A  E  I  D  L  I  Q  X                                          F2
           R  A  S  S  A  R  L  H  C  R  L  N  W  L  K  S  T  *  F  R                                            F3
      701 CAGGGCCAGCAGCGCACGACTGCATTGTCGCTTAAATTGGCTGAAATCGACTTGATTCAGG 761
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|-