ccpA allele sequence: id-57

Contig position

sequence bin id
3
contig length
4239205
start
3023917
end
3024477
length
561
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

TACATGAAAA TGTTTATGCT ATAGGAAAAG AAAAGTGTAC CCAGTTGAAG GAGTGGTAAA AATGAGTAAT GTGACAATAT ATGATGTAGC ACGCGAAGCA AATGTAAGTA TGGCAACCGT TTCCCGGGTC GTCAACGGGA ATCCGAATGT CAAGCCGACG ACGAGAAAGA AGGTGCTTGA AGCGATCGAG CGTCTTGGCT ATCGTCCAAA CGCCGTGGCA AGAGGGCTGG CAAGCAAAAA GACGACGACT GTCGGCGTGA TCATTCCCGA TATTTCCAGT ATCTTTTATT CAGAGCTGGC GAGGGGAATC GAAGATATCG CAACGATGTA CAAGTACAAT ATTATTTTGA GCAATTCCGA CCAGAATATG GACAAAGAAC TTCATCTTTT GAATACGATG CTAGGAAAGC AAGTTGACGG TATCGTCTTT ATGAGCGGAA ATGTGACTGA AGAGCATGTG GAGGAATTTA AGCGATCGCC AGTTCCGATC GTGCTTGCGG CATCTGTTGA AGAAAAAGGG GAAACGCCGT CGGTTGCGAT CGATTATGAA CAGGCGATTT ATGATGCGGC AACCATGCTG ATTGAGAAAG GCCATAAGCG CCTTGCGTTC GTCTCAGGAC CTATGGCTGA ACCGGTTAAT CAAGCGAAAA AACTGCAAGG CTTTAAAAGA GCGCTTGGGG ATAAGGGGCT GCAATTTAAG GAAGAGTATG TTGTAGAAGG CGATTATACG TACGATTCAG GAATGGAAGC GCTGGAGGCT T

Translation


          Y  M  K  M  F  M  L  *  E  K  K  S  V  P  S  *  R  S  G  K  N  E  *  C  D  N  I  *  C  S  T  R  S  K   F1
           T  *  K  C  L  C  Y  R  K  R  K  V  Y  P  V  E  G  V  V  K  M  S  N  V  T  I  Y  D  V  A  R  E  A     F2
            H  E  N  V  Y  A  I  G  K  E  K  C  T  Q  L  K  E  W  *  K  *  V  M  *  Q  Y  M  M  *  H  A  K  Q    F3
        1 TACATGAAAATGTTTATGCTATAGGAAAAGAAAAGTGTACCCAGTTGAAGGAGTGGTAAAAATGAGTAATGTGACAATATATGATGTAGCACGCGAAGCA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            C  K  Y  G  N  R  F  P  G  R  Q  R  E  S  E  C  Q  A  D  D  E  K  E  G  A  *  S  D  R  A  S  W  L    F1
          N  V  S  M  A  T  V  S  R  V  V  N  G  N  P  N  V  K  P  T  T  R  K  K  V  L  E  A  I  E  R  L  G  Y   F2
           M  *  V  W  Q  P  F  P  G  S  S  T  G  I  R  M  S  S  R  R  R  E  R  R  C  L  K  R  S  S  V  L  A     F3
      101 AATGTAAGTATGGCAACCGTTTCCCGGGTCGTCAACGGGAATCCGAATGTCAAGCCGACGACGAGAAAGAAGGTGCTTGAAGCGATCGAGCGTCTTGGCT 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           S  S  K  R  R  G  K  R  A  G  K  Q  K  D  D  D  C  R  R  D  H  S  R  Y  F  Q  Y  L  L  F  R  A  G     F1
            R  P  N  A  V  A  R  G  L  A  S  K  K  T  T  T  V  G  V  I  I  P  D  I  S  S  I  F  Y  S  E  L  A    F2
          I  V  Q  T  P  W  Q  E  G  W  Q  A  K  R  R  R  L  S  A  *  S  F  P  I  F  P  V  S  F  I  Q  S  W  R   F3
      201 ATCGTCCAAACGCCGTGGCAAGAGGGCTGGCAAGCAAAAAGACGACGACTGTCGGCGTGATCATTCCCGATATTTCCAGTATCTTTTATTCAGAGCTGGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          E  G  N  R  R  Y  R  N  D  V  Q  V  Q  Y  Y  F  E  Q  F  R  P  E  Y  G  Q  R  T  S  S  F  E  Y  D  A   F1
           R  G  I  E  D  I  A  T  M  Y  K  Y  N  I  I  L  S  N  S  D  Q  N  M  D  K  E  L  H  L  L  N  T  M     F2
            G  E  S  K  I  S  Q  R  C  T  S  T  I  L  F  *  A  I  P  T  R  I  W  T  K  N  F  I  F  *  I  R  C    F3
      301 GAGGGGAATCGAAGATATCGCAACGATGTACAAGTACAATATTATTTTGAGCAATTCCGACCAGAATATGGACAAAGAACTTCATCTTTTGAATACGATG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  K  A  S  *  R  Y  R  L  Y  E  R  K  C  D  *  R  A  C  G  G  I  *  A  I  A  S  S  D  R  A  C  G    F1
          L  G  K  Q  V  D  G  I  V  F  M  S  G  N  V  T  E  E  H  V  E  E  F  K  R  S  P  V  P  I  V  L  A  A   F2
           *  E  S  K  L  T  V  S  S  L  *  A  E  M  *  L  K  S  M  W  R  N  L  S  D  R  Q  F  R  S  C  L  R     F3
      401 CTAGGAAAGCAAGTTGACGGTATCGTCTTTATGAGCGGAAATGTGACTGAAGAGCATGTGGAGGAATTTAAGCGATCGCCAGTTCCGATCGTGCTTGCGG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           I  C  *  R  K  R  G  N  A  V  G  C  D  R  L  *  T  G  D  L  *  C  G  N  H  A  D  *  E  R  P  *  A     F1
            S  V  E  E  K  G  E  T  P  S  V  A  I  D  Y  E  Q  A  I  Y  D  A  A  T  M  L  I  E  K  G  H  K  R    F2
          H  L  L  K  K  K  G  K  R  R  R  L  R  S  I  M  N  R  R  F  M  M  R  Q  P  C  *  L  R  K  A  I  S  A   F3
      501 CATCTGTTGAAGAAAAAGGGGAAACGCCGTCGGTTGCGATCGATTATGAACAGGCGATTTATGATGCGGCAACCATGCTGATTGAGAAAGGCCATAAGCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  C  V  R  L  R  T  Y  G  *  T  G  *  S  S  E  K  T  A  R  L  *  K  S  A  W  G  *  G  A  A  I  *  G   F1
           L  A  F  V  S  G  P  M  A  E  P  V  N  Q  A  K  K  L  Q  G  F  K  R  A  L  G  D  K  G  L  Q  F  K     F2
            L  R  S  S  Q  D  L  W  L  N  R  L  I  K  R  K  N  C  K  A  L  K  E  R  L  G  I  R  G  C  N  L  R    F3
      601 CCTTGCGTTCGTCTCAGGACCTATGGCTGAACCGGTTAATCAAGCGAAAAAACTGCAAGGCTTTAAAAGAGCGCTTGGGGATAAGGGGCTGCAATTTAAG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  V  C  C  R  R  R  L  Y  V  R  F  R  N  G  S  A  G  G  X                                           F1
          E  E  Y  V  V  E  G  D  Y  T  Y  D  S  G  M  E  A  L  E  A  X                                          F2
           K  S  M  L  *  K  A  I  I  R  T  I  Q  E  W  K  R  W  R  L                                            F3
      701 GAAGAGTATGTTGTAGAAGGCGATTATACGTACGATTCAGGAATGGAAGCGCTGGAGGCTT 761
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