spo0A allele sequence: id-54
Contig position
- sequence bin id
- 2
- contig length
- 4388022
- start
- 2692918
- end
- 2693475
- length
- 558
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TGATGATAAC AGGGAGCTTG TCGGCCTATT AAGCGAATAT ATCGAGGGAC AAAGCGACAT GGAAGTACTT GGTGTCGCGT ACAACGGACA GGAATGCCTT TCGTTGTTTA AAGACAAGGA GCCCGATGTG CTTGTGCTGG ATATTATCAT GCCTCACCTC GATGGATTGG CCGTTCTTGA AAGGCTGAGG GAATCGCAGC TTAAAAAGCA GCCGAATGTC ATCATGCTGA CGGCGTTCGG TCAGGAAGAC GTGACGAAAA AAGCTGTAGA TTTGGGCGCG TCGTATTTTA TTTTGAAGCC TTTTGACATG GAGAACTTAG TCGGCCATAT CCGCCAGGTC AGCGGAAACG GATCTCAATT GACACACCGT GCCCCGTCTT CTCAAAGCAG TGTGCTTCGG CCGCAGCCGG AATCGCCGAA GAAAAACCTG GACGCCAGCA TCACGACCAT CATCCACGAA ATCGGCGTGC CCGCTCATAT AAAAGGCTAT TTATACTTAA GGGAAGCCAT CTCCATGGTG TATAACGACA TCGAACTGCT CGGAAGCATT ACAAAAGTGC TTTATCCGGA TATCGCCAAA AAATTCAACA CGACTGCAAG CCGAGTCGAA CGGGCGATTC GCCACGCCAT CGAAGTCGCA TGGAGCAGAG GCAACATCGA CTCGATTTCG TCACTTTTCG GCTACACAGT CAGCATGTCA AAAGCCAAGC CGACGAATTC AGAATTCATC GCGATGGTCG CAGACAAGCT GAGACTGG
Translation
* * * Q G A C R P I K R I Y R G T K R H G S T W C R V Q R T G M P F F1
D D N R E L V G L L S E Y I E G Q S D M E V L G V A Y N G Q E C L F2
M I T G S L S A Y * A N I S R D K A T W K Y L V S R T T D R N A F F3
1 TGATGATAACAGGGAGCTTGTCGGCCTATTAAGCGAATATATCGAGGGACAAAGCGACATGGAAGTACTTGGTGTCGCGTACAACGGACAGGAATGCCTT 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
V V * R Q G A R C A C A G Y Y H A S P R W I G R S * K A E G I A A F1
S L F K D K E P D V L V L D I I M P H L D G L A V L E R L R E S Q L F2
R C L K T R S P M C L C W I L S C L T S M D W P F L K G * G N R S F3
101 TCGTTGTTTAAAGACAAGGAGCCCGATGTGCTTGTGCTGGATATTATCATGCCTCACCTCGATGGATTGGCCGTTCTTGAAAGGCTGAGGGAATCGCAGC 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
* K A A E C H H A D G V R S G R R D E K S C R F G R V V F Y F E A F1
K K Q P N V I M L T A F G Q E D V T K K A V D L G A S Y F I L K P F2
L K S S R M S S C * R R S V R K T * R K K L * I W A R R I L F * S L F3
201 TTAAAAAGCAGCCGAATGTCATCATGCTGACGGCGTTCGGTCAGGAAGACGTGACGAAAAAAGCTGTAGATTTGGGCGCGTCGTATTTTATTTTGAAGCC 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
F * H G E L S R P Y P P G Q R K R I S I D T P C P V F S K Q C A S A F1
F D M E N L V G H I R Q V S G N G S Q L T H R A P S S Q S S V L R F2
L T W R T * S A I S A R S A E T D L N * H T V P R L L K A V C F G F3
301 TTTTGACATGGAGAACTTAGTCGGCCATATCCGCCAGGTCAGCGGAAACGGATCTCAATTGACACACCGTGCCCCGTCTTCTCAAAGCAGTGTGCTTCGG 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A A G I A E E K P G R Q H H D H H P R N R R A R S Y K R L F I L K F1
P Q P E S P K K N L D A S I T T I I H E I G V P A H I K G Y L Y L R F2
R S R N R R R K T W T P A S R P S S T K S A C P L I * K A I Y T * F3
401 CCGCAGCCGGAATCGCCGAAGAAAAACCTGGACGCCAGCATCACGACCATCATCCACGAAATCGGCGTGCCCGCTCATATAAAAGGCTATTTATACTTAA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G S H L H G V * R H R T A R K H Y K S A L S G Y R Q K I Q H D C K F1
E A I S M V Y N D I E L L G S I T K V L Y P D I A K K F N T T A S F2
G K P S P W C I T T S N C S E A L Q K C F I R I S P K N S T R L Q A F3
501 GGGAAGCCATCTCCATGGTGTATAACGACATCGAACTGCTCGGAAGCATTACAAAAGTGCTTTATCCGGATATCGCCAAAAAATTCAACACGACTGCAAG 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P S R T G D S P R H R S R M E Q R Q H R L D F V T F R L H S Q H V K F1
R V E R A I R H A I E V A W S R G N I D S I S S L F G Y T V S M S F2
E S N G R F A T P S K S H G A E A T S T R F R H F S A T Q S A C Q F3
601 CCGAGTCGAACGGGCGATTCGCCACGCCATCGAAGTCGCATGGAGCAGAGGCAACATCGACTCGATTTCGTCACTTTTCGGCTACACAGTCAGCATGTCA 700
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S Q A D E F R I H R D G R R Q A E T G F1
K A K P T N S E F I A M V A D K L R L X F2
K P S R R I Q N S S R W S Q T S * D W F3
701 AAAGCCAAGCCGACGAATTCAGAATTCATCGCGATGGTCGCAGACAAGCTGAGACTGG 758
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:---