trpB allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3325
- contig length
- 53702
- start
- 13444
- end
- 13744
- length
- 301
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCGACGGTCG TGCCGGTCGA ATCGGGTTCG CGCACGCTGA AGGACGCGCT CAACGAGGCG ATGCGCGACT GGGTCACGAA CATCGAAAGC ACGTTCTACA TCATCGGCAC GGTCGCGGGC CCGCATCCGT ATCCGGCGAT GGTGCGCGAC TTCCAGCGCG TGATCGGCGA CGAGTGCCGC GTGCAGATGC CGGAGCTGGC CGGCCGTCAA CCGGACGCGG TGATCGCGTG CGTGGGCGGC GGCTCGAACG CGATGGGCAT CTTCTATCCG TACATCGACG ACACGTCGGT GCAGTTGATC GGCGTCGAAG CGGCCGGCGA GGGCCTCGCG TCGGGCCATC ACGCGGCATC GCTGATCGCC GGCAGCCCCG GCGTGCTGCA CGGCAACCGC ACGTACCTGC TGCAGGACGA GAACGGCCAG ATCATCGAGA CGCATTCGGT GTCGGCCGGC CTCGACTATC CGGGCGTCGG CCCCGAGCAC GCATGGCTGA AGGACAGCGG C
Translation
A T V V P V E S G S R T L K D A L N E A M R D W V T N I E S T F Y I F1
R R S C R S N R V R A R * R T R S T R R C A T G S R T S K A R S T F2
D G R A G R I G F A H A E G R A Q R G D A R L G H E H R K H V L H F3
1 GCGACGGTCGTGCCGGTCGAATCGGGTTCGCGCACGCTGAAGGACGCGCTCAACGAGGCGATGCGCGACTGGGTCACGAACATCGAAAGCACGTTCTACA 100
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I G T V A G P H P Y P A M V R D F Q R V I G D E C R V Q M P E L A F1
S S A R S R A R I R I R R W C A T S S A * S A T S A A C R C R S W P F2
H R H G R G P A S V S G D G A R L P A R D R R R V P R A D A G A G F3
101 TCATCGGCACGGTCGCGGGCCCGCATCCGTATCCGGCGATGGTGCGCGACTTCCAGCGCGTGATCGGCGACGAGTGCCGCGTGCAGATGCCGGAGCTGGC 200
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G R Q P D A V I A C V G G G S N A M G I F Y P Y I D D T S V Q L I F1
A V N R T R * S R A W A A A R T R W A S S I R T S T T R R C S * S F2
R P S T G R G D R V R G R R L E R D G H L L S V H R R H V G A V D R F3
201 CGGCCGTCAACCGGACGCGGTGATCGCGTGCGTGGGCGGCGGCTCGAACGCGATGGGCATCTTCTATCCGTACATCGACGACACGTCGGTGCAGTTGATC 300
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G V E A A G E G L A S G H H A A S L I A G S P G V L H G N R T Y L L F1
A S K R P A R A S R R A I T R H R * S P A A P A C C T A T A R T C F2
R R S G R R G P R V G P S R G I A D R R Q P R R A A R Q P H V P A F3
301 GGCGTCGAAGCGGCCGGCGAGGGCCTCGCGTCGGGCCATCACGCGGCATCGCTGATCGCCGGCAGCCCCGGCGTGCTGCACGGCAACCGCACGTACCTGC 400
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Q D E N G Q I I E T H S V S A G L D Y P G V G P E H A W L K D S G F1
C R T R T A R S S R R I R C R P A S T I R A S A P S T H G * R T A A F2
A G R E R P D H R D A F G V G R P R L S G R R P R A R M A E G Q R F3
401 TGCAGGACGAGAACGGCCAGATCATCGAGACGCATTCGGTGTCGGCCGGCCTCGACTATCCGGGCGTCGGCCCCGAGCACGCATGGCTGAAGGACAGCGG 500
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F1
F2
X F3
501 C 501
-