recA allele sequence: id-72

Contig position

sequence bin id
3352
contig length
231275
start
128270
end
128662
length
393
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TGAAGCGGGC GCGCCTCTGA CAGACGCTGC TCATCATAGC AAAGGACGAT TCATGGAAGA TAGCAAGAAG GGCTCCGGGA TGACCGCCGA GAAGAGCAAG GCGCTGGCGG CCGCACTCGC GCAGATCGAG AAGCAGTTCG GCAAAGGGTC GATCATGCGG ATGGGCGACG GCGACGTGAA GGAAGACATC CAGGTCGTCT CCACGGGCTC GCTGGGCCTC GATATCGCGC TCGGCGTCGG CGGCCTGCCG CGCGGCCGGG TGGTCGAAAT CTACGGTCCG GAATCGTCCG GCAAGACCAC GCTCACGCTG CAGGTGATCG CCGAGCTGCA GAAGCTGGGC GGCACGGCAG CCTTCATCGA CGCCGAGCAC GCGCTCGACG TCCAGTACGC GGCGAAGCTC GGCGTGAACG TGCCGGAGCT GCTGATCTCG CAGCCGGACA CCGGCGAACA GGCGCTCGAA ATCACCGACG CGCTCGTGCG CTCGGGCTCG ATCGACATGA TCGTCATCGA CTCGGTCGCG GCACTGGTGC CGAAGGCCGA AATCGAAGGC GAGATGGGCG ATTCGCTGCC GGGTCTGCAG GCGCGTCTGA TGT

Translation


          *  S  G  R  A  S  D  R  R  C  S  S  *  Q  R  T  I  H  G  R  *  Q  E  G  L  R  D  D  R  R  E  E  Q  G   F1
           E  A  G  A  P  L  T  D  A  A  H  H  S  K  G  R  F  M  E  D  S  K  K  G  S  G  M  T  A  E  K  S  K     F2
            K  R  A  R  L  *  Q  T  L  L  I  I  A  K  D  D  S  W  K  I  A  R  R  A  P  G  *  P  P  R  R  A  R    F3
        1 TGAAGCGGGCGCGCCTCTGACAGACGCTGCTCATCATAGCAAAGGACGATTCATGGAAGATAGCAAGAAGGGCTCCGGGATGACCGCCGAGAAGAGCAAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  G  G  R  T  R  A  D  R  E  A  V  R  Q  R  V  D  H  A  D  G  R  R  R  R  E  G  R  H  P  G  R  L    F1
          A  L  A  A  A  L  A  Q  I  E  K  Q  F  G  K  G  S  I  M  R  M  G  D  G  D  V  K  E  D  I  Q  V  V  S   F2
           R  W  R  P  H  S  R  R  S  R  S  S  S  A  K  G  R  S  C  G  W  A  T  A  T  *  R  K  T  S  R  S  S     F3
      101 GCGCTGGCGGCCGCACTCGCGCAGATCGAGAAGCAGTTCGGCAAAGGGTCGATCATGCGGATGGGCGACGGCGACGTGAAGGAAGACATCCAGGTCGTCT 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           H  G  L  A  G  P  R  Y  R  A  R  R  R  R  P  A  A  R  P  G  G  R  N  L  R  S  G  I  V  R  Q  D  H     F1
            T  G  S  L  G  L  D  I  A  L  G  V  G  G  L  P  R  G  R  V  V  E  I  Y  G  P  E  S  S  G  K  T  T    F2
          P  R  A  R  W  A  S  I  S  R  S  A  S  A  A  C  R  A  A  G  W  S  K  S  T  V  R  N  R  P  A  R  P  R   F3
      201 CCACGGGCTCGCTGGGCCTCGATATCGCGCTCGGCGTCGGCGGCCTGCCGCGCGGCCGGGTGGTCGAAATCTACGGTCCGGAATCGTCCGGCAAGACCAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          A  H  A  A  G  D  R  R  A  A  E  A  G  R  H  G  S  L  H  R  R  R  A  R  A  R  R  P  V  R  G  E  A  R   F1
           L  T  L  Q  V  I  A  E  L  Q  K  L  G  G  T  A  A  F  I  D  A  E  H  A  L  D  V  Q  Y  A  A  K  L     F2
            S  R  C  R  *  S  P  S  C  R  S  W  A  A  R  Q  P  S  S  T  P  S  T  R  S  T  S  S  T  R  R  S  S    F3
      301 GCTCACGCTGCAGGTGATCGCCGAGCTGCAGAAGCTGGGCGGCACGGCAGCCTTCATCGACGCCGAGCACGCGCTCGACGTCCAGTACGCGGCGAAGCTC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  E  R  A  G  A  A  D  L  A  A  G  H  R  R  T  G  A  R  N  H  R  R  A  R  A  L  G  L  D  R  H  D    F1
          G  V  N  V  P  E  L  L  I  S  Q  P  D  T  G  E  Q  A  L  E  I  T  D  A  L  V  R  S  G  S  I  D  M  I   F2
           A  *  T  C  R  S  C  *  S  R  S  R  T  P  A  N  R  R  S  K  S  P  T  R  S  C  A  R  A  R  S  T  *     F3
      401 GGCGTGAACGTGCCGGAGCTGCTGATCTCGCAGCCGGACACCGGCGAACAGGCGCTCGAAATCACCGACGCGCTCGTGCGCTCGGGCTCGATCGACATGA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  H  R  L  G  R  G  T  G  A  E  G  R  N  R  R  R  D  G  R  F  A  A  G  S  A  G  A  S  D  V           F1
            V  I  D  S  V  A  A  L  V  P  K  A  E  I  E  G  E  M  G  D  S  L  P  G  L  Q  A  R  L  M  X          F2
          S  S  S  T  R  S  R  H  W  C  R  R  P  K  S  K  A  R  W  A  I  R  C  R  V  C  R  R  V  *  C            F3
      501 TCGTCATCGACTCGGTCGCGGCACTGGTGCCGAAGGCCGAAATCGAAGGCGAGATGGGCGATTCGCTGCCGGGTCTGCAGGCGCGTCTGATGT 593
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