phaC allele sequence: id-72

Contig position

sequence bin id
3376
contig length
227887
start
61527
end
61911
length
385
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

GTACGTAACA GGCGGCATGG GCGGCATCGG CACCAGTATT TGCCAGCGTC TGTCGAAAGA CGGCTTCAAG GTGGTTGCGG GTTGCGGCCC GAACTCGCCG CGCCGGGTGA AATGGCTCGA GGAACAGAAG GCACTCGGCT ACGATTTCAT CGCGTCTGAA GGTAACGTCG GCGACTGGGA CTCGACCAAG GCAGCGTTCG ACAAGGTCAA GGCCGAAGTC GGCGAGGTCG ACGTGCTGGT CAACAACGCG GGCATCACGC GCGACGTCGT GTTCCGCAAG ATGACGCACG AAGACTGGAC GGCCGTGATC GACACCAATC TGACGAGCCT GTTCAACGTG ACGAAACAGG TGATCGACGG GATGGTCGAG CGCGGCTGGG GCCGCATCGT CAACATTTCG TCGGTGAACG GCCAGAAGGG GCAATTCGGC CAGACCAACT ATTCGACCGC GAAGGCCGGC ATTCACGGCT TCACGATGGC GCTCGCACAG GAAGTTGCAA CGAAGGGCGT GACGGTCAAT ACCGTGTCGC CCGGCTACAT TGGCACCGAC ATGGTCAAGG CGATCCGTCC GGACGTACTG GAGAA

Translation


          V  R  N  R  R  H  G  R  H  R  H  Q  Y  L  P  A  S  V  E  R  R  L  Q  G  G  C  G  L  R  P  E  L  A  A   F1
           Y  V  T  G  G  M  G  G  I  G  T  S  I  C  Q  R  L  S  K  D  G  F  K  V  V  A  G  C  G  P  N  S  P     F2
            T  *  Q  A  A  W  A  A  S  A  P  V  F  A  S  V  C  R  K  T  A  S  R  W  L  R  V  A  A  R  T  R  R    F3
        1 GTACGTAACAGGCGGCATGGGCGGCATCGGCACCAGTATTTGCCAGCGTCTGTCGAAAGACGGCTTCAAGGTGGTTGCGGGTTGCGGCCCGAACTCGCCG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  G  E  M  A  R  G  T  E  G  T  R  L  R  F  H  R  V  *  R  *  R  R  R  L  G  L  D  Q  G  S  V  R    F1
          R  R  V  K  W  L  E  E  Q  K  A  L  G  Y  D  F  I  A  S  E  G  N  V  G  D  W  D  S  T  K  A  A  F  D   F2
           A  G  *  N  G  S  R  N  R  R  H  S  A  T  I  S  S  R  L  K  V  T  S  A  T  G  T  R  P  R  Q  R  S     F3
      101 CGCCGGGTGAAATGGCTCGAGGAACAGAAGGCACTCGGCTACGATTTCATCGCGTCTGAAGGTAACGTCGGCGACTGGGACTCGACCAAGGCAGCGTTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  G  Q  G  R  S  R  R  G  R  R  A  G  Q  Q  R  G  H  H  A  R  R  R  V  P  Q  D  D  A  R  R  L  D     F1
            K  V  K  A  E  V  G  E  V  D  V  L  V  N  N  A  G  I  T  R  D  V  V  F  R  K  M  T  H  E  D  W  T    F2
          T  R  S  R  P  K  S  A  R  S  T  C  W  S  T  T  R  A  S  R  A  T  S  C  S  A  R  *  R  T  K  T  G  R   F3
      201 ACAAGGTCAAGGCCGAAGTCGGCGAGGTCGACGTGCTGGTCAACAACGCGGGCATCACGCGCGACGTCGTGTTCCGCAAGATGACGCACGAAGACTGGAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  R  D  R  H  Q  S  D  E  P  V  Q  R  D  E  T  G  D  R  R  D  G  R  A  R  L  G  P  H  R  Q  H  F  V   F1
           A  V  I  D  T  N  L  T  S  L  F  N  V  T  K  Q  V  I  D  G  M  V  E  R  G  W  G  R  I  V  N  I  S     F2
            P  *  S  T  P  I  *  R  A  C  S  T  *  R  N  R  *  S  T  G  W  S  S  A  A  G  A  A  S  S  T  F  R    F3
      301 GGCCGTGATCGACACCAATCTGACGAGCCTGTTCAACGTGACGAAACAGGTGATCGACGGGATGGTCGAGCGCGGCTGGGGCCGCATCGTCAACATTTCG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  E  R  P  E  G  A  I  R  P  D  Q  L  F  D  R  E  G  R  H  S  R  L  H  D  G  A  R  T  G  S  C  N    F1
          S  V  N  G  Q  K  G  Q  F  G  Q  T  N  Y  S  T  A  K  A  G  I  H  G  F  T  M  A  L  A  Q  E  V  A  T   F2
           R  *  T  A  R  R  G  N  S  A  R  P  T  I  R  P  R  R  P  A  F  T  A  S  R  W  R  S  H  R  K  L  Q     F3
      401 TCGGTGAACGGCCAGAAGGGGCAATTCGGCCAGACCAACTATTCGACCGCGAAGGCCGGCATTCACGGCTTCACGATGGCGCTCGCACAGGAAGTTGCAA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           E  G  R  D  G  Q  Y  R  V  A  R  L  H  W  H  R  H  G  Q  G  D  P  S  G  R  T  G  E                    F1
            K  G  V  T  V  N  T  V  S  P  G  Y  I  G  T  D  M  V  K  A  I  R  P  D  V  L  E  X                   F2
          R  R  A  *  R  S  I  P  C  R  P  A  T  L  A  P  T  W  S  R  R  S  V  R  T  Y  W  R  X                  F3
      501 CGAAGGGCGTGACGGTCAATACCGTGTCGCCCGGCTACATTGGCACCGACATGGTCAAGGCGATCCGTCCGGACGTACTGGAGAA 585
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