lepA allele sequence: id-72

Contig position

sequence bin id
3327
contig length
292274
start
237047
end
237443
length
397
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

CGTCGGCGTG TTCACGCCGA AGTCGCGCAA TCTCGAATCG CTGTCGGCCG GGCAGGTGGG CTTCATCATC GCCGGCATCA AGGAACTGAC GGCCGCGAAG GTCGGCGATA CCGTCACGCA CGTGGCGAAG CCTGCCACCG AGCCGCTGCC GGGCTTCAAG GAAGTGAAGC CGCAGGTGTT CGCGGGCCTC TATCCGGTCG AGGCGAACCA GTACGACGCG CTGCGCGAAT CGCTCGAGAA GCTGAAGCTC AACGACGCGT CGCTGCAGTA CGAGCCGGAA GTGTCGCAGG CGCTCGGCTT CGGCTTCCGC TGCGGCTTCC TCGGCCTGCT GCACATGGAA ATCGTGCAAG AGCGGCTCGA GCGCGAGTTC GACATGGACC TCATCACGAC CGCACCGACG GTCGTCTATG AAGTGGTGCA GAGCGACGGC TCGACGATCA TGGTCGAGAA CCCGGCGAAG ATGCCGGAAC CCGGCCGCAT CGCCGAGGTT CGCGAGCCGA TCGTCACCGT GAACCTGTAC ATGCCGCAGG ACTACGTCGG CTCGGTGATC ACGCTGTGCG AGCAGAAGCG CGGCTCGCAG ATCAACATGC AGTATCA

Translation


          R  R  R  V  H  A  E  V  A  Q  S  R  I  A  V  G  R  A  G  G  L  H  H  R  R  H  Q  G  T  D  G  R  E  G   F1
           V  G  V  F  T  P  K  S  R  N  L  E  S  L  S  A  G  Q  V  G  F  I  I  A  G  I  K  E  L  T  A  A  K     F2
            S  A  C  S  R  R  S  R  A  I  S  N  R  C  R  P  G  R  W  A  S  S  S  P  A  S  R  N  *  R  P  R  R    F3
        1 CGTCGGCGTGTTCACGCCGAAGTCGCGCAATCTCGAATCGCTGTCGGCCGGGCAGGTGGGCTTCATCATCGCCGGCATCAAGGAACTGACGGCCGCGAAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  R  Y  R  H  A  R  G  E  A  C  H  R  A  A  A  G  L  Q  G  S  E  A  A  G  V  R  G  P  L  S  G  R    F1
          V  G  D  T  V  T  H  V  A  K  P  A  T  E  P  L  P  G  F  K  E  V  K  P  Q  V  F  A  G  L  Y  P  V  E   F2
           S  A  I  P  S  R  T  W  R  S  L  P  P  S  R  C  R  A  S  R  K  *  S  R  R  C  S  R  A  S  I  R  S     F3
      101 GTCGGCGATACCGTCACGCACGTGGCGAAGCCTGCCACCGAGCCGCTGCCGGGCTTCAAGGAAGTGAAGCCGCAGGTGTTCGCGGGCCTCTATCCGGTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  E  P  V  R  R  A  A  R  I  A  R  E  A  E  A  Q  R  R  V  A  A  V  R  A  G  S  V  A  G  A  R  L     F1
            A  N  Q  Y  D  A  L  R  E  S  L  E  K  L  K  L  N  D  A  S  L  Q  Y  E  P  E  V  S  Q  A  L  G  F    F2
          R  R  T  S  T  T  R  C  A  N  R  S  R  S  *  S  S  T  T  R  R  C  S  T  S  R  K  C  R  R  R  S  A  S   F3
      201 AGGCGAACCAGTACGACGCGCTGCGCGAATCGCTCGAGAAGCTGAAGCTCAACGACGCGTCGCTGCAGTACGAGCCGGAAGTGTCGCAGGCGCTCGGCTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  L  P  L  R  L  P  R  P  A  A  H  G  N  R  A  R  A  A  R  A  R  V  R  H  G  P  H  H  D  R  T  D  G   F1
           G  F  R  C  G  F  L  G  L  L  H  M  E  I  V  Q  E  R  L  E  R  E  F  D  M  D  L  I  T  T  A  P  T     F2
            A  S  A  A  A  S  S  A  C  C  T  W  K  S  C  K  S  G  S  S  A  S  S  T  W  T  S  S  R  P  H  R  R    F3
      301 CGGCTTCCGCTGCGGCTTCCTCGGCCTGCTGCACATGGAAATCGTGCAAGAGCGGCTCGAGCGCGAGTTCGACATGGACCTCATCACGACCGCACCGACG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  L  *  S  G  A  E  R  R  L  D  D  H  G  R  E  P  G  E  D  A  G  T  R  P  H  R  R  G  S  R  A  D    F1
          V  V  Y  E  V  V  Q  S  D  G  S  T  I  M  V  E  N  P  A  K  M  P  E  P  G  R  I  A  E  V  R  E  P  I   F2
           S  S  M  K  W  C  R  A  T  A  R  R  S  W  S  R  T  R  R  R  C  R  N  P  A  A  S  P  R  F  A  S  R     F3
      401 GTCGTCTATGAAGTGGTGCAGAGCGACGGCTCGACGATCATGGTCGAGAACCCGGCGAAGATGCCGGAACCCGGCCGCATCGCCGAGGTTCGCGAGCCGA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  H  R  E  P  V  H  A  A  G  L  R  R  L  G  D  H  A  V  R  A  E  A  R  L  A  D  Q  H  A  V  S        F1
            V  T  V  N  L  Y  M  P  Q  D  Y  V  G  S  V  I  T  L  C  E  Q  K  R  G  S  Q  I  N  M  Q  Y  X       F2
          S  S  P  *  T  C  T  C  R  R  T  T  S  A  R  *  S  R  C  A  S  R  S  A  A  R  R  S  T  C  S  I  X      F3
      501 TCGTCACCGTGAACCTGTACATGCCGCAGGACTACGTCGGCTCGGTGATCACGCTGTGCGAGCAGAAGCGCGGCTCGCAGATCAACATGCAGTATCA 597
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