gyrB allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3397
- contig length
- 268617
- start
- 258947
- end
- 259400
- length
- 454
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGACCGACG TGAAGATGAA CGACAAGCAC GAGCCGAAGC GCAGCGCCGC CGAGATCGTG ATGACCGAGC TGCATGCGGG CGGCAAGTTC GACCAGAACA GCTACAAGGT GTCGGGCGGG CTGCACGGCG TGGGCGTGTC GTGCGTGAAC GCCCTGTCGA GCTGGTTGCG GCTCACCGTG CGCCGCAACG GCAAGAAGCA CTTCATGGAG TTCCATCGCG GCATCGCACA GGATCGTGTG CTCGAGCAGG TCGATGGCGT CGAAGTGTCG CCGATGCTCG TCACCGGCGA CACCGAGAAC CGCGGCACCG AAGTGCATTT CATGGCCGAT CCGACGATCT TCGGGACCGT CGAGTATCAC TACGACATCC TCGCGAAGCG GATGCGCGAG CTCTCGTTCC TGAACAACGG CGTGCGGATT CGTCTTACCG ACCTGCGTTC GGGCAAGGAA GACGATTTCG CGTTCGCCGG CGGTGTGAAG GGCTTCGTCG AGTACATCAA CAAGACGAAG ACCAACCTGC ACCCGACCGT GTTCTTCGCC AACGGCGAGA AGGACGGCGT GGGCGTCGAA GTCGCGATGC AGTGGAACGA CAGCTACAAC GAAAACGTGC TGTGCTTCAC GAACAACATT CCGCAGCGCG ACGGCGGCAC GCAC
Translation
P T D V K M N D K H E P K R S A A E I V M T E L H A G G K F D Q N S F1
R P T * R * T T S T S R S A A P P R S * * P S C M R A A S S T R T F2
D R R E D E R Q A R A E A Q R R R D R D D R A A C G R Q V R P E Q F3
1 CCGACCGACGTGAAGATGAACGACAAGCACGAGCCGAAGCGCAGCGCCGCCGAGATCGTGATGACCGAGCTGCATGCGGGCGGCAAGTTCGACCAGAACA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Y K V S G G L H G V G V S C V N A L S S W L R L T V R R N G K K H F1
A T R C R A G C T A W A C R A * T P C R A G C G S P C A A T A R S T F2
L Q G V G R A A R R G R V V R E R P V E L V A A H R A P Q R Q E A F3
101 GCTACAAGGTGTCGGGCGGGCTGCACGGCGTGGGCGTGTCGTGCGTGAACGCCCTGTCGAGCTGGTTGCGGCTCACCGTGCGCCGCAACGGCAAGAAGCA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
F M E F H R G I A Q D R V L E Q V D G V E V S P M L V T G D T E N F1
S W S S I A A S H R I V C S S R S M A S K C R R C S S P A T P R T F2
L H G V P S R H R T G S C A R A G R W R R S V A D A R H R R H R E P F3
201 CTTCATGGAGTTCCATCGCGGCATCGCACAGGATCGTGTGCTCGAGCAGGTCGATGGCGTCGAAGTGTCGCCGATGCTCGTCACCGGCGACACCGAGAAC 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R G T E V H F M A D P T I F G T V E Y H Y D I L A K R M R E L S F L F1
A A P K C I S W P I R R S S G P S S I T T T S S R S G C A S S R S F2
R H R S A F H G R S D D L R D R R V S L R H P R E A D A R A L V P F3
301 CGCGGCACCGAAGTGCATTTCATGGCCGATCCGACGATCTTCGGGACCGTCGAGTATCACTACGACATCCTCGCGAAGCGGATGCGCGAGCTCTCGTTCC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
N N G V R I R L T D L R S G K E D D F A F A G G V K G F V E Y I N F1
* T T A C G F V L P T C V R A R K T I S R S P A V * R A S S S T S T F2
E Q R R A D S S Y R P A F G Q G R R F R V R R R C E G L R R V H Q F3
401 TGAACAACGGCGTGCGGATTCGTCTTACCGACCTGCGTTCGGGCAAGGAAGACGATTTCGCGTTCGCCGGCGGTGTGAAGGGCTTCGTCGAGTACATCAA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
K T K T N L H P T V F F A N G E K D G V G V E V A M Q W N D S Y N F1
R R R P T C T R P C S S P T A R R T A W A S K S R C S G T T A T T F2
Q D E D Q P A P D R V L R Q R R E G R R G R R S R D A V E R Q L Q R F3
501 CAAGACGAAGACCAACCTGCACCCGACCGTGTTCTTCGCCAACGGCGAGAAGGACGGCGTGGGCGTCGAAGTCGCGATGCAGTGGAACGACAGCTACAAC 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
E N V L C F T N N I P Q R D G G T H F1
K T C C A S R T T F R S A T A A R T F2
K R A V L H E Q H S A A R R R H A X F3
601 GAAAACGTGCTGTGCTTCACGAACAACATTCCGCAGCGCGACGGCGGCACGCAC 654
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----