gltB allele sequence: id-72

Contig position

sequence bin id
3346
contig length
48187
start
44510
end
44909
length
400
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

CGGTGCTGCG CGCGAAGTTC AAGGGCCAGC CCGAGCACGT CGTGAACTAC TTCTTCTTCG TCGCCGAGGA AGTGCGCGAG ATCATGGCGC AGCTCGGCAT CGCGAAGTTC GACGACCTGA TCGGCCGCCC CGACCTGCTC GACACCCGCA AGGGCATCGA GCACTGGAAG GCGAAGGGCC TCGACTTCTC GCGCGTGTTC TATCAGCCGG AAGGCTGCGA GGACGTCGCC CGCCGTCACG TCGAAGGGCA GGACCACGGC CTCGAGCGCG CGCTCGACCA CGTGCTGATC GAGAAGGCGA AGGCTGCGAT CGAGAACGGC GAGCATGTGT CGTTCATCCA GCCGGTGCGC AACGTGAACC GGACGGTCGG CGCGATGCTG TCGGGCGTGA TCGCGAAGAA GCACGGCCAC GACGGCCTCG CCGACGATGC GGTGCACATC CAGCTGAAAG GCACGGCCGG CCAGAGCTTC GGCGCGTTCC TCGCGAAGGG CGTGACGCTC GACCTCGTCG GCGACGGCAA CGACTACGTC GGCAAGGGCC TGTCGGGCGG CCGGATCATC ATCCGTCCGA CCAACGACTT CCGCGGCAAG TCCGAAGAGA

Translation


          R  C  C  A  R  S  S  R  A  S  P  S  T  S  *  T  T  S  S  S  S  P  R  K  C  A  R  S  W  R  S  S  A  S   F1
           G  A  A  R  E  V  Q  G  P  A  R  A  R  R  E  L  L  L  L  R  R  R  G  S  A  R  D  H  G  A  A  R  H     F2
            V  L  R  A  K  F  K  G  Q  P  E  H  V  V  N  Y  F  F  F  V  A  E  E  V  R  E  I  M  A  Q  L  G  I    F3
        1 CGGTGCTGCGCGCGAAGTTCAAGGGCCAGCCCGAGCACGTCGTGAACTACTTCTTCTTCGTCGCCGAGGAAGTGCGCGAGATCATGGCGCAGCTCGGCAT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  S  S  T  T  *  S  A  A  P  T  C  S  T  P  A  R  A  S  S  T  G  R  R  R  A  S  T  S  R  A  C  S    F1
          R  E  V  R  R  P  D  R  P  P  R  P  A  R  H  P  Q  G  H  R  A  L  E  G  E  G  P  R  L  L  A  R  V  L   F2
           A  K  F  D  D  L  I  G  R  P  D  L  L  D  T  R  K  G  I  E  H  W  K  A  K  G  L  D  F  S  R  V  F     F3
      101 CGCGAAGTTCGACGACCTGATCGGCCGCCCCGACCTGCTCGACACCCGCAAGGGCATCGAGCACTGGAAGGCGAAGGGCCTCGACTTCTCGCGCGTGTTC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           I  S  R  K  A  A  R  T  S  P  A  V  T  S  K  G  R  T  T  A  S  S  A  R  S  T  T  C  *  S  R  R  R     F1
            S  A  G  R  L  R  G  R  R  P  P  S  R  R  R  A  G  P  R  P  R  A  R  A  R  P  R  A  D  R  E  G  E    F2
          Y  Q  P  E  G  C  E  D  V  A  R  R  H  V  E  G  Q  D  H  G  L  E  R  A  L  D  H  V  L  I  E  K  A  K   F3
      201 TATCAGCCGGAAGGCTGCGAGGACGTCGCCCGCCGTCACGTCGAAGGGCAGGACCACGGCCTCGAGCGCGCGCTCGACCACGTGCTGATCGAGAAGGCGA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  L  R  S  R  T  A  S  M  C  R  S  S  S  R  C  A  T  *  T  G  R  S  A  R  C  C  R  A  *  S  R  R  S   F1
           G  C  D  R  E  R  R  A  C  V  V  H  P  A  G  A  Q  R  E  P  D  G  R  R  D  A  V  G  R  D  R  E  E     F2
            A  A  I  E  N  G  E  H  V  S  F  I  Q  P  V  R  N  V  N  R  T  V  G  A  M  L  S  G  V  I  A  K  K    F3
      301 AGGCTGCGATCGAGAACGGCGAGCATGTGTCGTTCATCCAGCCGGTGCGCAACGTGAACCGGACGGTCGGCGCGATGCTGTCGGGCGTGATCGCGAAGAA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            T  A  T  T  A  S  P  T  M  R  C  T  S  S  *  K  A  R  P  A  R  A  S  A  R  S  S  R  R  A  *  R  S    F1
          A  R  P  R  R  P  R  R  R  C  G  A  H  P  A  E  R  H  G  R  P  E  L  R  R  V  P  R  E  G  R  D  A  R   F2
           H  G  H  D  G  L  A  D  D  A  V  H  I  Q  L  K  G  T  A  G  Q  S  F  G  A  F  L  A  K  G  V  T  L     F3
      401 GCACGGCCACGACGGCCTCGCCGACGATGCGGTGCACATCCAGCTGAAAGGCACGGCCGGCCAGAGCTTCGGCGCGTTCCTCGCGAAGGGCGTGACGCTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           T  S  S  A  T  A  T  T  T  S  A  R  A  C  R  A  A  G  S  S  S  V  R  P  T  T  S  A  A  S  P  K  R     F1
            P  R  R  R  R  Q  R  L  R  R  Q  G  P  V  G  R  P  D  H  H  P  S  D  Q  R  L  P  R  Q  V  R  R  X    F2
          D  L  V  G  D  G  N  D  Y  V  G  K  G  L  S  G  G  R  I  I  I  R  P  T  N  D  F  R  G  K  S  E  E  X   F3
      501 GACCTCGTCGGCGACGGCAACGACTACGTCGGCAAGGGCCTGTCGGGCGGCCGGATCATCATCCGTCCGACCAACGACTTCCGCGGCAAGTCCGAAGAGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|