atpD allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3321
- contig length
- 132030
- start
- 87672
- end
- 88114
- length
- 443
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GTGGAATTCC CGCGCGACAG CATGCCGAAG ATCTACGACG CGCTTATTCT CGATGGCTCG GAACTGACGC TCGAAGTCCA GCAGCAGCTG GGCGACGGCG TGGTCCGCAC CATCTGTCTG GGTGCATCCG ACGGCCTGCG CCGCGGCCTG ACCGTGAAGA ACACGGCCAA GCCGATTTCG GTGCCGGTCG GCAAGCCGAC CCTCGGTCGT ATCATGGACG TCCTCGGCCG TCCGATCGAC GAGGCCGGCC CGATCGAAAG CGAACATACG CGTTCGATCC ACCAGAAGGC TCCGGCGTTC GACGAGCTGT CGCCGTCGAC CGAACTGCTC GAAACGGGTA TCAAGGTCAT CGACCTGATC TGCCCGTTCG CGAAGGGCGG CAAGGTCGGT CTGTTCGGTG GTGCAGGCGT GGGCAAGACC GTCAACATGA TGGAGCTCAT CAACAACATC GCGAAGGAGC ACGGCGGTTA CTCCGTGTTC GCGGGCGTGG GCGAGCGTAC CCGTGAAGGG AACGACTTCT ACCACGAAAT GAAGGACTCG AACGTTCTCG ACAAGGTCGC GCTGGTGTAC GGCCAGATGA ACGAGCCGCC GGGCAACCGT CTGCGCGTCG CGCTGACCGG CCTGACGATG GCTGAGCACT TCC
Translation
V E F P R D S M P K I Y D A L I L D G S E L T L E V Q Q Q L G D G V F1
W N S R A T A C R R S T T R L F S M A R N * R S K S S S S W A T A F2
G I P A R Q H A E D L R R A Y S R W L G T D A R S P A A A G R R R F3
1 GTGGAATTCCCGCGCGACAGCATGCCGAAGATCTACGACGCGCTTATTCTCGATGGCTCGGAACTGACGCTCGAAGTCCAGCAGCAGCTGGGCGACGGCG 100
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V R T I C L G A S D G L R R G L T V K N T A K P I S V P V G K P T F1
W S A P S V W V H P T A C A A A * P * R T R P S R F R C R S A S R P F2
G P H H L S G C I R R P A P R P D R E E H G Q A D F G A G R Q A D F3
101 TGGTCCGCACCATCTGTCTGGGTGCATCCGACGGCCTGCGCCGCGGCCTGACCGTGAAGAACACGGCCAAGCCGATTTCGGTGCCGGTCGGCAAGCCGAC 200
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L G R I M D V L G R P I D E A G P I E S E H T R S I H Q K A P A F F1
S V V S W T S S A V R S T R P A R S K A N I R V R S T R R L R R S F2
P R S Y H G R P R P S D R R G R P D R K R T Y A F D P P E G S G V R F3
201 CCTCGGTCGTATCATGGACGTCCTCGGCCGTCCGATCGACGAGGCCGGCCCGATCGAAAGCGAACATACGCGTTCGATCCACCAGAAGGCTCCGGCGTTC 300
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D E L S P S T E L L E T G I K V I D L I C P F A K G G K V G L F G G F1
T S C R R R P N C S K R V S R S S T * S A R S R R A A R S V C S V F2
R A V A V D R T A R N G Y Q G H R P D L P V R E G R Q G R S V R W F3
301 GACGAGCTGTCGCCGTCGACCGAACTGCTCGAAACGGGTATCAAGGTCATCGACCTGATCTGCCCGTTCGCGAAGGGCGGCAAGGTCGGTCTGTTCGGTG 400
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A G V G K T V N M M E L I N N I A K E H G G Y S V F A G V G E R T F1
V Q A W A R P S T * W S S S T T S R R S T A V T P C S R A W A S V P F2
C R R G Q D R Q H D G A H Q Q H R E G A R R L L R V R G R G R A Y F3
401 GTGCAGGCGTGGGCAAGACCGTCAACATGATGGAGCTCATCAACAACATCGCGAAGGAGCACGGCGGTTACTCCGTGTTCGCGGGCGTGGGCGAGCGTAC 500
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R E G N D F Y H E M K D S N V L D K V A L V Y G Q M N E P P G N R F1
V K G T T S T T K * R T R T F S T R S R W C T A R * T S R R A T V F2
P * R E R L L P R N E G L E R S R Q G R A G V R P D E R A A G Q P S F3
501 CCGTGAAGGGAACGACTTCTACCACGAAATGAAGGACTCGAACGTTCTCGACAAGGTCGCGCTGGTGTACGGCCAGATGAACGAGCCGCCGGGCAACCGT 600
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L R V A L T G L T M A E H F X F1
C A S R * P A * R W L S T S F2
A R R A D R P D D G * A L P F3
601 CTGCGCGTCGCGCTGACCGGCCTGACGATGGCTGAGCACTTCC 643
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