BACT000065 (rpmJ) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 30738
- end
- 30854
- length
- 117
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCTTGCCGGG CGACAAGGTC ACGGTTGAAT TGACGCCTTA CGATCTGTCT CGTGCGCGGA TCGTGTTCCG GGCGAAGTGA TTTGAAAAAA GGGTATTATC ATGAAAGTGA TGGCATCGGT TAAGCGCATT TGCCGCAATT GCAAGATCAT CAAGCGCAAA GGCGTCGTTC GCGTGATCTG CAGCTCGGAT CCGCGCCACA AGCAGCGCCA AGGCTGACCG CGCGTTTGTT TGCGCTTTTT GTTTGAGGAA AAACAATGGC TCGTATCGCA GGGGTTAACA TCCCGAATCA CCAGCATACC GAGATCGGCC TGACGGC
Translation
S C R A T R S R L N * R L T I C L V R G S C S G R S D L K K G Y Y H F1
L A G R Q G H G * I D A L R S V S C A D R V P G E V I * K K G I I F2
L P G D K V T V E L T P Y D L S R A R I V F R A K * F E K R V L S F3
1 TCTTGCCGGGCGACAAGGTCACGGTTGAATTGACGCCTTACGATCTGTCTCGTGCGCGGATCGTGTTCCGGGCGAAGTGATTTGAAAAAAGGGTATTATC 100
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E S D G I G * A H L P Q L Q D H Q A Q R R R S R D L Q L G S A P Q F1
M K V M A S V K R I C R N C K I I K R K G V V R V I C S S D P R H K F2
* K * W H R L S A F A A I A R S S S A K A S F A * S A A R I R A T F3
101 ATGAAAGTGATGGCATCGGTTAAGCGCATTTGCCGCAATTGCAAGATCATCAAGCGCAAAGGCGTCGTTCGCGTGATCTGCAGCTCGGATCCGCGCCACA 200
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A A P R L T A R L F A L F V * G K T M A R I A G V N I P N H Q H T F1
Q R Q G * P R V C L R F L F E E K Q W L V S Q G L T S R I T S I P F2
S S A K A D R A F V C A F C L R K N N G S Y R R G * H P E S P A Y R F3
201 AGCAGCGCCAAGGCTGACCGCGCGTTTGTTTGCGCTTTTTGTTTGAGGAAAAACAATGGCTCGTATCGCAGGGGTTAACATCCCGAATCACCAGCATACC 300
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E I G L T A F1
R S A * R X F2
D R P D G F3
301 GAGATCGGCCTGACGGC 317
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