BACT000064 (rpmI) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3353
- contig length
- 220068
- start
- 16255
- end
- 16452
- length
- 198
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCGGTTCGCC GTACACAAGT GGACTGGGTT TCGAAGGGCG GGTCGAGGGC GCAAGCCAAC CGCACACCCA TCGCCATCAA ATAAACTGGA GTTATTCGTC ATGCCTAAGA TGAAGACCAA GAAGAGTGCT GCAAAGCGCT TCGTGGTGCG TCCGGGCGGT ACCGTCAAGC GCGGTCAAGC CTTCAAGCGC CACATCCTGA CCAAGAAAAC CACGAAGAAC AAGCGTCACC TGCGCGGCGC AACGGCAGTT CATGATTCCG ATCTGAACTC CGTCCGCGCG ATGCTGCCGT TCGCGTAACC CCTCAACTGA TACTCTAAGG AGCGAAACAT GCCTCGAGTC AAACGTGGGG TAACCGCACG GGCCCGTCAC AAGAAGATCA TCAACCTGGC CAAGGGTT
Translation
A V R R T Q V D W V S K G G S R A Q A N R T P I A I K * T G V I R H F1
R F A V H K W T G F R R A G R G R K P T A H P S P S N K L E L F V F2
G S P Y T S G L G F E G R V E G A S Q P H T H R H Q I N W S Y S S F3
1 GCGGTTCGCCGTACACAAGTGGACTGGGTTTCGAAGGGCGGGTCGAGGGCGCAAGCCAACCGCACACCCATCGCCATCAAATAAACTGGAGTTATTCGTC 100
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A * D E D Q E E C C K A L R G A S G R Y R Q A R S S L Q A P H P D F1
M P K M K T K K S A A K R F V V R P G G T V K R G Q A F K R H I L T F2
C L R * R P R R V L Q S A S W C V R A V P S S A V K P S S A T S * F3
101 ATGCCTAAGATGAAGACCAAGAAGAGTGCTGCAAAGCGCTTCGTGGTGCGTCCGGGCGGTACCGTCAAGCGCGGTCAAGCCTTCAAGCGCCACATCCTGA 200
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Q E N H E E Q A S P A R R N G S S * F R S E L R P R D A A V R V T F1
K K T T K N K R H L R G A T A V H D S D L N S V R A M L P F A * P F2
P R K P R R T S V T C A A Q R Q F M I P I * T P S A R C C R S R N P F3
201 CCAAGAAAACCACGAAGAACAAGCGTCACCTGCGCGGCGCAACGGCAGTTCATGATTCCGATCTGAACTCCGTCCGCGCGATGCTGCCGTTCGCGTAACC 300
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P Q L I L * G A K H A S S Q T W G N R T G P S Q E D H Q P G Q G X F1
L N * Y S K E R N M P R V K R G V T A R A R H K K I I N L A K G X F2
S T D T L R S E T C L E S N V G * P H G P V T R R S S T W P R V F3
301 CCTCAACTGATACTCTAAGGAGCGAAACATGCCTCGAGTCAAACGTGGGGTAACCGCACGGGCCCGTCACAAGAAGATCATCAACCTGGCCAAGGGTT 398
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