BACT000063 (rpmH) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3397
- contig length
- 268617
- start
- 254984
- end
- 255118
- length
- 135
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AACCAATCCT GTATTCCCGG CGATTGCGTT CGCCCGAATG CCTACGGTTA AGGGCACGCG GTCCCCTGAA TTTCGACATT CTCGAACAAG TGAGAACATC ATGAAACGTA CTTACCAACC GTCCGTGACG CGCCGCAAGC GCACCCATGG CTTCCGTGTC CGCATGAAGA CTGCAGGCGG CCGCAAGGTC ATCAACGCTC GCCGCGCGAA GGGCCGCAAG CGCCTCGCCA TCTAAGGCAG GTTGCGCGCT GTGTCCGCCG TCCGCAGTGC CGCGGAAGGT GCCGTCGAGC CGGGTGCGAA TCCGTCGCAG ACGAAAGCCG CCTTCCCGAA AGCTG
Translation
N Q S C I P G D C V R P N A Y G * G H A V P * I S T F S N K * E H H F1
T N P V F P A I A F A R M P T V K G T R S P E F R H S R T S E N I F2
P I L Y S R R L R S P E C L R L R A R G P L N F D I L E Q V R T S F3
1 AACCAATCCTGTATTCCCGGCGATTGCGTTCGCCCGAATGCCTACGGTTAAGGGCACGCGGTCCCCTGAATTTCGACATTCTCGAACAAGTGAGAACATC 100
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E T Y L P T V R D A P Q A H P W L P C P H E D C R R P Q G H Q R S F1
M K R T Y Q P S V T R R K R T H G F R V R M K T A G G R K V I N A R F2
* N V L T N R P * R A A S A P M A S V S A * R L Q A A A R S S T L F3
101 ATGAAACGTACTTACCAACCGTCCGTGACGCGCCGCAAGCGCACCCATGGCTTCCGTGTCCGCATGAAGACTGCAGGCGGCCGCAAGGTCATCAACGCTC 200
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P R E G P Q A P R H L R Q V A R C V R R P Q C R G R C R R A G C E F1
R A K G R K R L A I * G R L R A V S A V R S A A E G A V E P G A N F2
A A R R A A S A S P S K A G C A L C P P S A V P R K V P S S R V R I F3
201 GCCGCGCGAAGGGCCGCAAGCGCCTCGCCATCTAAGGCAGGTTGCGCGCTGTGTCCGCCGTCCGCAGTGCCGCGGAAGGTGCCGTCGAGCCGGGTGCGAA 300
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S V A D E S R L P E S X F1
P S Q T K A A F P K A X F2
R R R R K P P S R K L F3
301 TCCGTCGCAGACGAAAGCCGCCTTCCCGAAAGCTG 335
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