BACT000061 (rpmF) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3327
- contig length
- 292274
- start
- 225377
- end
- 225556
- length
- 180
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AAGCAGTTGT GGCGCGGGAA GGCGTAAGGG CTTTGGGCCA GGGTAGTTAA GCGCCGGATC GGGCTGTGTT AGAATCCGGA AAATCAATTA GGAGTTAGTC ATGGCAGTCC AGCAAAACAA GAAGTCGCCG TCGAAGCGCG GCATGCATCG TTCGCACGAT TTCCTGACGG CAGCGCCGCT GGCAGTCGAG CCGAGCACGG GTGAAGTGCA TCTGCGTCAC CACGTCAGCC CGAACGGCTA CTATCGCGGC AAGAAAGTCG TCAAGACGAA GAACGACTAA GCGTCAAGTC ACGCGTTGCG CGCTACGTTC GCCGTTCGCG TGACAACTGG TTCGCTTGAC ACTTTCCTGG CTCAACAAAA AGGCGGCATT CAACTCCCGC
Translation
K Q L W R G K A * G L W A R V V K R R I G L C * N P E N Q L G V S H F1
S S C G A G R R K G F G P G * L S A G S G C V R I R K I N * E L V F2
A V V A R E G V R A L G Q G S * A P D R A V L E S G K S I R S * S F3
1 AAGCAGTTGTGGCGCGGGAAGGCGTAAGGGCTTTGGGCCAGGGTAGTTAAGCGCCGGATCGGGCTGTGTTAGAATCCGGAAAATCAATTAGGAGTTAGTC 100
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G S P A K Q E V A V E A R H A S F A R F P D G S A A G S R A E H G F1
M A V Q Q N K K S P S K R G M H R S H D F L T A A P L A V E P S T G F2
W Q S S K T R S R R R S A A C I V R T I S * R Q R R W Q S S R A R F3
101 ATGGCAGTCCAGCAAAACAAGAAGTCGCCGTCGAAGCGCGGCATGCATCGTTCGCACGATTTCCTGACGGCAGCGCCGCTGGCAGTCGAGCCGAGCACGG 200
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* S A S A S P R Q P E R L L S R Q E S R Q D E E R L S V K S R V A F1
E V H L R H H V S P N G Y Y R G K K V V K T K N D * A S S H A L R F2
V K C I C V T T S A R T A T I A A R K S S R R R T T K R Q V T R C A F3
201 GTGAAGTGCATCTGCGTCACCACGTCAGCCCGAACGGCTACTATCGCGGCAAGAAAGTCGTCAAGACGAAGAACGACTAAGCGTCAAGTCACGCGTTGCG 300
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R Y V R R S R D N W F A * H F P G S T K R R H S T P A F1
A T F A V R V T T G S L D T F L A Q Q K G G I Q L P X F2
L R S P F A * Q L V R L T L S W L N K K A A F N S R F3
301 CGCTACGTTCGCCGTTCGCGTGACAACTGGTTCGCTTGACACTTTCCTGGCTCAACAAAAAGGCGGCATTCAACTCCCGC 380
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