BACT000060 (rpmE) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3376
- contig length
- 227887
- start
- 112352
- end
- 112615
- length
- 264
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AAGTGGCTCG CGCCGGGCTT GACGGCGGCC GAATCGCACG AATGCGTGCG GTCCGGTACG GCAAGCGGCG GGTTGGCTAC CGCTCTCACC AAGGAACATC ATGAAACCTG GCATTCACCC GGACTACCGC GAAGTCGTCT TCCAAGACAT GTCGAACGGC TTCAAGTTCA TCACGCGCTC GACGATCCAG ACGCGTGAAA CCATCGACCA CGAAGGCAAG ACCTACCCGC TCGCCAAGAT CGAAGTGTCG TCGGAATCGC ACTCGTTCTA CACCGGCCAG CAGAAGATCA TGGACACGGC AGGCCGTGTC GAGAAGTTCA AGAACAAGTT CGGCGCACGC GCCAGCGGCA AGGTCGCGAA GTAAGCTTCG CACCGATCCG GTGGTTGCAA CGCACCGGTA CCGCACAAAA GGGCAGCCCA GGCTGCCCTT TTTTGTCGCC GCTCGCCGGG ACAGCACACG CGCC
Translation
K W L A P G L T A A E S H E C V R S G T A S G G L A T A L T K E H H F1
S G S R R A * R R P N R T N A C G P V R Q A A G W L P L S P R N I F2
V A R A G L D G G R I A R M R A V R Y G K R R V G Y R S H Q G T S F3
1 AAGTGGCTCGCGCCGGGCTTGACGGCGGCCGAATCGCACGAATGCGTGCGGTCCGGTACGGCAAGCGGCGGGTTGGCTACCGCTCTCACCAAGGAACATC 100
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E T W H S P G L P R S R L P R H V E R L Q V H H A L D D P D A * N F1
M K P G I H P D Y R E V V F Q D M S N G F K F I T R S T I Q T R E T F2
* N L A F T R T T A K S S S K T C R T A S S S S R A R R S R R V K F3
101 ATGAAACCTGGCATTCACCCGGACTACCGCGAAGTCGTCTTCCAAGACATGTCGAACGGCTTCAAGTTCATCACGCGCTCGACGATCCAGACGCGTGAAA 200
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H R P R R Q D L P A R Q D R S V V G I A L V L H R P A E D H G H G F1
I D H E G K T Y P L A K I E V S S E S H S F Y T G Q Q K I M D T A F2
P S T T K A R P T R S P R S K C R R N R T R S T P A S R R S W T R Q F3
201 CCATCGACCACGAAGGCAAGACCTACCCGCTCGCCAAGATCGAAGTGTCGTCGGAATCGCACTCGTTCTACACCGGCCAGCAGAAGATCATGGACACGGC 300
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R P C R E V Q E Q V R R T R Q R Q G R E V S F A P I R W L Q R T G T F1
G R V E K F K N K F G A R A S G K V A K * A S H R S G G C N A P V F2
A V S R S S R T S S A H A P A A R S R S K L R T D P V V A T H R Y F3
301 AGGCCGTGTCGAGAAGTTCAAGAACAAGTTCGGCGCACGCGCCAGCGGCAAGGTCGCGAAGTAAGCTTCGCACCGATCCGGTGGTTGCAACGCACCGGTA 400
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A Q K G S P G C P F L S P L A G T A H A P F1
P H K R A A Q A A L F C R R S P G Q H T R X F2
R T K G Q P R L P F F V A A R R D S T R A F3
401 CCGCACAAAAGGGCAGCCCAGGCTGCCCTTTTTTGTCGCCGCTCGCCGGGACAGCACACGCGCC 464
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