BACT000059 (rpmD) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 32956
- end
- 33138
- length
- 183
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CACGCTGGAC GGTCTGCGCA AGCAGTCGAC CCCGGCAGAC ATCGCGGCGA AGCGCGGCAA GTCCGTCGAA GATATTTTGG GCTAAGCCCG GGTGGTCACC ATGTCTGAAA AAACTGTCAA GGTTCAGCTC GTGAAGAGCC TGATCGGGAC CCGCGAATCG CACCGTGCGA CCGTGCGTGG CCTGGGCCTG CGCCGACTCA ACTCGGTTAG CGAGCTGCAG GATACGCCGG CGGTCCGCGG CATGATCAAC AAGGTCTCGT ACCTCGTTAA GGTCATCGCG TAAGCGGCCC TACGGATCAA GGAGTTGATA TGGAATTGAA TAACCTGAAG CCGGCCGCTG GTGCAAAGCA CGCCAAGCGT CGCGTCGGCC GCGGCATCGG TTC
Translation
H A G R S A Q A V D P G R H R G E A R Q V R R R Y F G L S P G G H H F1
T L D G L R K Q S T P A D I A A K R G K S V E D I L G * A R V V T F2
R W T V C A S S R P R Q T S R R S A A S P S K I F W A K P G W S P F3
1 CACGCTGGACGGTCTGCGCAAGCAGTCGACCCCGGCAGACATCGCGGCGAAGCGCGGCAAGTCCGTCGAAGATATTTTGGGCTAAGCCCGGGTGGTCACC 100
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V * K N C Q G S A R E E P D R D P R I A P C D R A W P G P A P T Q F1
M S E K T V K V Q L V K S L I G T R E S H R A T V R G L G L R R L N F2
C L K K L S R F S S * R A * S G P A N R T V R P C V A W A C A D S F3
101 ATGTCTGAAAAAACTGTCAAGGTTCAGCTCGTGAAGAGCCTGATCGGGACCCGCGAATCGCACCGTGCGACCGTGCGTGGCCTGGGCCTGCGCCGACTCA 200
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L G * R A A G Y A G G P R H D Q Q G L V P R * G H R V S G P T D Q F1
S V S E L Q D T P A V R G M I N K V S Y L V K V I A * A A L R I K F2
T R L A S C R I R R R S A A * S T R S R T S L R S S R K R P Y G S R F3
201 ACTCGGTTAGCGAGCTGCAGGATACGCCGGCGGTCCGCGGCATGATCAACAAGGTCTCGTACCTCGTTAAGGTCATCGCGTAAGCGGCCCTACGGATCAA 300
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G V D M E L N N L K P A A G A K H A K R R V G R G I G S F1
E L I W N * I T * S R P L V Q S T P S V A S A A A S V X F2
S * Y G I E * P E A G R W C K A R Q A S R R P R H R F F3
301 GGAGTTGATATGGAATTGAATAACCTGAAGCCGGCCGCTGGTGCAAAGCACGCCAAGCGTCGCGTCGGCCGCGGCATCGGTTC 383
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