BACT000057 (rpmB) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3380
- contig length
- 57823
- start
- 28507
- end
- 28740
- length
- 234
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GGGCTTCGGC GTTCTGAGTG CAGCCATGGA TCACGTGGCG GTGCGATGAG AACCTTCACC GGCGATCGAA CCCCGAATTT AGCGTATTAG GAGTGCTCTC ATGGCACGCG TATGCCAAGT AACTGGGAAA GCGCCGATGA GCGGCAACAA CGTTTCCCAC GCCAACAACA AGACGAAGCG CCGCTTCCTG CCGAACCTGC AAAACCGCCG GTTCTGGGTA GAGAGCGAAA ACCGCTGGGT GCGCCTGCGC GTTTCGAACG CCGGCCTGCG CCTGATCGAC AAGAACGGCA TCGATTCCGT GCTCGCTGAC CTGCGCGCAC GCGGCGAAGC CTAAGCCCAA GGAGCACAAT CATGGCAAAA GGCGCACGCG ACAAGATCAA GCTCGAGTCG ACCGCTGGTA CGGGTCATTT CTACACGACC ACGAAGAACA AGCG
Translation
G L R R S E C S H G S R G G A M R T F T G D R T P N L A Y * E C S H F1
G F G V L S A A M D H V A V R * E P S P A I E P R I * R I R S A L F2
A S A F * V Q P W I T W R C D E N L H R R S N P E F S V L G V L S F3
1 GGGCTTCGGCGTTCTGAGTGCAGCCATGGATCACGTGGCGGTGCGATGAGAACCTTCACCGGCGATCGAACCCCGAATTTAGCGTATTAGGAGTGCTCTC 100
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G T R M P S N W E S A D E R Q Q R F P R Q Q Q D E A P L P A E P A F1
M A R V C Q V T G K A P M S G N N V S H A N N K T K R R F L P N L Q F2
W H A Y A K * L G K R R * A A T T F P T P T T R R S A A S C R T C F3
101 ATGGCACGCGTATGCCAAGTAACTGGGAAAGCGCCGATGAGCGGCAACAACGTTTCCCACGCCAACAACAAGACGAAGCGCCGCTTCCTGCCGAACCTGC 200
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K P P V L G R E R K P L G A P A R F E R R P A P D R Q E R H R F R F1
N R R F W V E S E N R W V R L R V S N A G L R L I D K N G I D S V F2
K T A G S G * R A K T A G C A C A F R T P A C A * S T R T A S I P C F3
201 AAAACCGCCGGTTCTGGGTAGAGAGCGAAAACCGCTGGGTGCGCCTGCGCGTTTCGAACGCCGGCCTGCGCCTGATCGACAAGAACGGCATCGATTCCGT 300
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A R * P A R T R R S L S P R S T I M A K G A R D K I K L E S T A G T F1
L A D L R A R G E A * A Q G A Q S W Q K A H A T R S S S S R P L V F2
S L T C A H A A K P K P K E H N H G K R R T R Q D Q A R V D R W Y F3
301 GCTCGCTGACCTGCGCGCACGCGGCGAAGCCTAAGCCCAAGGAGCACAATCATGGCAAAAGGCGCACGCGACAAGATCAAGCTCGAGTCGACCGCTGGTA 400
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G H F Y T T T K N K R F1
R V I S T R P R R T S X F2
G S F L H D H E E Q A F3
401 CGGGTCATTTCTACACGACCACGAAGAACAAGCG 434
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