BACT000056 (rpmA) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3356
- contig length
- 316436
- start
- 43686
- end
- 43949
- length
- 264
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGGAAGCAC TACCAAAAGC ACGGCGGCCA CCGCCAGAAC TACACTGAGC TGCGCATCGA CGCGATCAAC GCGTAAGCGC CTCGGTAAAG GAGCAATCAG ATGGCACACA AAAAGGCAGG CGGCTCTTCC CGGAACGGCC GCGACTCCGA GTCGAAACGT CTCGGCGTGA AAGTGTACGG CGGCCAGGCG ATCAACGCCG GCGGCATCAT CGTGCGTCAG CGCGGTACGC GCATGCACGC TGGCGAGAAC GTCGGCATGG GCAAGGATCA CACCCTGTTC GCGCTGGTCG ACGGTCACGT CAAGTTCGCG ACCAAGGGCG CGGACAAGAA GCACTTGGTC ATCGTTGTCC CGGCGGTTGC CTAAGTCAAG GCACCACGGG CTTCGTAGCC GAAAGGCCCC GCAGTCTTCG CGGGGCCTTT TTTTATTTGG CCGCCGCGCG CAGGTGCGCG CCGGCGGCTG TCGC
Translation
P E A L P K A R R P P P E L H * A A H R R D Q R V S A S V K E Q S D F1
R K H Y Q K H G G H R Q N Y T E L R I D A I N A * A P R * R S N Q F2
G S T T K S T A A T A R T T L S C A S T R S T R K R L G K G A I R F3
1 CCGGAAGCACTACCAAAAGCACGGCGGCCACCGCCAGAACTACACTGAGCTGCGCATCGACGCGATCAACGCGTAAGCGCCTCGGTAAAGGAGCAATCAG 100
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G T Q K G R R L F P E R P R L R V E T S R R E S V R R P G D Q R R F1
M A H K K A G G S S R N G R D S E S K R L G V K V Y G G Q A I N A G F2
W H T K R Q A A L P G T A A T P S R N V S A * K C T A A R R S T P F3
101 ATGGCACACAAAAAGGCAGGCGGCTCTTCCCGGAACGGCCGCGACTCCGAGTCGAAACGTCTCGGCGTGAAAGTGTACGGCGGCCAGGCGATCAACGCCG 200
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R H H R A S A R Y A H A R W R E R R H G Q G S H P V R A G R R S R F1
G I I V R Q R G T R M H A G E N V G M G K D H T L F A L V D G H V F2
A A S S C V S A V R A C T L A R T S A W A R I T P C S R W S T V T S F3
201 GCGGCATCATCGTGCGTCAGCGCGGTACGCGCATGCACGCTGGCGAGAACGTCGGCATGGGCAAGGATCACACCCTGTTCGCGCTGGTCGACGGTCACGT 300
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Q V R D Q G R G Q E A L G H R C P G G C L S Q G T T G F V A E R P R F1
K F A T K G A D K K H L V I V V P A V A * V K A P R A S * P K G P F2
S S R P R A R T R S T W S S L S R R L P K S R H H G L R S R K A P F3
301 CAAGTTCGCGACCAAGGGCGCGGACAAGAAGCACTTGGTCATCGTTGTCCCGGCGGTTGCCTAAGTCAAGGCACCACGGGCTTCGTAGCCGAAAGGCCCC 400
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S L R G A F F Y L A A A R R C A P A A V A F1
A V F A G P F F I W P P R A G A R R R L S X F2
Q S S R G L F L F G R R A Q V R A G G C R F3
401 GCAGTCTTCGCGGGGCCTTTTTTTATTTGGCCGCCGCGCGCAGGTGCGCGCCGGCGGCTGTCGC 464
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