BACT000053 (rplX) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 35894
- end
- 36202
- length
- 309
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GATCGGCACC CGCATTTTCG GGCCGGTGAC GCGTGAGCTG CGTAGCGAAC GATTCATGAA GATCGTTTCG CTGGCGCCGG AAGTGCTGTA AGGAGTCGCG ATGAACAAGA TTCGCAAAGG TGACGAAGTG ATCGTCGTCA CTGGCAAGGA CAAGGGCAAG CGCGGCGTCG TGCTGGCTGT CGGTGCTGAA CATGTGACGG TTGAGGGTAT CAACCTCGTC AAGAAGCATG TGAAGCCGAA CCCGATGAAG GGTACGACGG GCGGCGTGGA AGCGAAGACG ATGCCCCTGC ATATTTCGAA CGTCGCACTG GTCGACGCGA ATGGCAAGGC GTCGCGTGTT GGCATCAAGG TCGAGGAAGG CAAGAAGGTT CGCTTCCTGA AGACGACCGG TGCCGTACTG AGCGCCTGAC GCAGCGGAGT AAAAAATGGC TCGTTTTCAA GAGTTTTACA AAGAAAAGGT TGTGCCCGGC CTGATCGAGA AGTTCGGTTA CAAGTCGGTC ATGGAAGTG
Translation
D R H P H F R A G D A * A A * R T I H E D R F A G A G S A V R S R D F1
I G T R I F G P V T R E L R S E R F M K I V S L A P E V L * G V A F2
S A P A F S G R * R V S C V A N D S * R S F R W R R K C C K E S R F3
1 GATCGGCACCCGCATTTTCGGGCCGGTGACGCGTGAGCTGCGTAGCGAACGATTCATGAAGATCGTTTCGCTGGCGCCGGAAGTGCTGTAAGGAGTCGCG 100
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E Q D S Q R * R S D R R H W Q G Q G Q A R R R A G C R C * T C D G F1
M N K I R K G D E V I V V T G K D K G K R G V V L A V G A E H V T V F2
* T R F A K V T K * S S S L A R T R A S A A S C W L S V L N M * R F3
101 ATGAACAAGATTCGCAAAGGTGACGAAGTGATCGTCGTCACTGGCAAGGACAAGGGCAAGCGCGGCGTCGTGCTGGCTGTCGGTGCTGAACATGTGACGG 200
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* G Y Q P R Q E A C E A E P D E G Y D G R R G S E D D A P A Y F E F1
E G I N L V K K H V K P N P M K G T T G G V E A K T M P L H I S N F2
L R V S T S S R S M * S R T R * R V R R A A W K R R R C P C I F R T F3
201 TTGAGGGTATCAACCTCGTCAAGAAGCATGTGAAGCCGAACCCGATGAAGGGTACGACGGGCGGCGTGGAAGCGAAGACGATGCCCCTGCATATTTCGAA 300
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R R T G R R E W Q G V A C W H Q G R G R Q E G S L P E D D R C R T E F1
V A L V D A N G K A S R V G I K V E E G K K V R F L K T T G A V L F2
S H W S T R M A R R R V L A S R S R K A R R F A S * R R P V P Y * F3
301 CGTCGCACTGGTCGACGCGAATGGCAAGGCGTCGCGTGTTGGCATCAAGGTCGAGGAAGGCAAGAAGGTTCGCTTCCTGAAGACGACCGGTGCCGTACTG 400
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R L T Q R S K K W L V F K S F T K K R L C P A * S R S S V T S R S F1
S A * R S G V K N G S F S R V L Q R K G C A R P D R E V R L Q V G H F2
A P D A A E * K M A R F Q E F Y K E K V V P G L I E K F G Y K S V F3
401 AGCGCCTGACGCAGCGGAGTAAAAAATGGCTCGTTTTCAAGAGTTTTACAAAGAAAAGGTTGTGCCCGGCCTGATCGAGAAGTTCGGTTACAAGTCGGTC 500
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W K X F1
G S X F2
M E V F3
501 ATGGAAGTG 509
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