BACT000052 (rplW) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 40052
- end
- 40366
- length
- 315
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGATTGTCGA GCCGCGCTAC GCTGACCCGC TGTCGCTGAT CTACTTCAAG AAAGTGCTGG TCACGAAGGC TGCGGTCGCC CAGATCGAGG AGTTGCTGTC ATGAGCGAGA TTCGCAAGAA CGATCATCGT TTGATGCAGG TCCTGCTCGC ACCGGTGATT TCCGAAAAGG CGACGCTGGT TGCCGACAAG AACGAGCAGG TCGTGTTCGA AGTCGCACCG GATGCCACGA AGCAGGAAGT GAAGGCGGCT GTCGAGCTGC TGTTCAAGGT TGAGGTTGAT TCGGTCAACG TGCTGGTTCA GAAGGGCAAG CAAAAGCGCT TCGGCCGTTC GATGGGCCGT CGCAAGGACG TGAAGAAGGC GTACGTTTGC CTGAAGCCCG GCCAGGAAAT CAACTTTGAA GCGGAGGCCA AGTAATCATG GCAATCGTGA AAGTTAAACC GACTTCGCCG GGTCGCCGCG CGATGGTCAA GGTGGTCAAC AAGGATCTGC ACCAGGGCAA GCCGCACGCG GCACT
Translation
R L S S R A T L T R C R * S T S R K C W S R R L R S P R S R S C C H F1
D C R A A L R * P A V A D L L Q E S A G H E G C G R P D R G V A V F2
I V E P R Y A D P L S L I Y F K K V L V T K A A V A Q I E E L L S F3
1 CGATTGTCGAGCCGCGCTACGCTGACCCGCTGTCGCTGATCTACTTCAAGAAAGTGCTGGTCACGAAGGCTGCGGTCGCCCAGATCGAGGAGTTGCTGTC 100
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E R D S Q E R S S F D A G P A R T G D F R K G D A G C R Q E R A G F1
M S E I R K N D H R L M Q V L L A P V I S E K A T L V A D K N E Q V F2
* A R F A R T I I V * C R S C S H R * F P K R R R W L P T R T S R F3
101 ATGAGCGAGATTCGCAAGAACGATCATCGTTTGATGCAGGTCCTGCTCGCACCGGTGATTTCCGAAAAGGCGACGCTGGTTGCCGACAAGAACGAGCAGG 200
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R V R S R T G C H E A G S E G G C R A A V Q G * G * F G Q R A G S F1
V F E V A P D A T K Q E V K A A V E L L F K V E V D S V N V L V Q F2
S C S K S H R M P R S R K * R R L S S C C S R L R L I R S T C W F R F3
201 TCGTGTTCGAAGTCGCACCGGATGCCACGAAGCAGGAAGTGAAGGCGGCTGTCGAGCTGCTGTTCAAGGTTGAGGTTGATTCGGTCAACGTGCTGGTTCA 300
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E G Q A K A L R P F D G P S Q G R E E G V R L P E A R P G N Q L * S F1
K G K Q K R F G R S M G R R K D V K K A Y V C L K P G Q E I N F E F2
R A S K S A S A V R W A V A R T * R R R T F A * S P A R K S T L K F3
301 GAAGGGCAAGCAAAAGCGCTTCGGCCGTTCGATGGGCCGTCGCAAGGACGTGAAGAAGGCGTACGTTTGCCTGAAGCCCGGCCAGGAAATCAACTTTGAA 400
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G G Q V I M A I V K V K P T S P G R R A M V K V V N K D L H Q G K F1
A E A K * S W Q S * K L N R L R R V A A R W S R W S T R I C T R A S F2
R R P S N H G N R E S * T D F A G S P R D G Q G G Q Q G S A P G Q F3
401 GCGGAGGCCAAGTAATCATGGCAATCGTGAAAGTTAAACCGACTTCGCCGGGTCGCCGCGCGATGGTCAAGGTGGTCAACAAGGATCTGCACCAGGGCAA 500
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P H A A L F1
R T R H X F2
A A R G T F3
501 GCCGCACGCGGCACT 515
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