BACT000051 (rplV) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 38594
- end
- 38923
- length
- 330
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GGAAAACATG GTCGGCCACA AGCTTGGCGA GTTCGCACTG ACCCGTACGT TCAAGGGTCA CGCAGCCGAC AAGAAGGCCA AGAAATAAGG GGCAATCAAG ATGGAAGTGA AAGCAATTCA TCGCGGTGCC CGCATCTCGG CGCAAAAAAC GCGCCTTGTG GCTGACCAGA TCCGCGGTTT GCCGGTCGAC AAGGCGCTGA ACGTTCTGAC GTTCTCGCCG AAGAAGGCGG CTGGCATCGT GAAGAAGGTT GTGCTGTCGG CAATCGCGAA TGCGGAGCAC AACGAAGGCG CCGATATCGA CGAGCTCAAG ATCAAGAGCA TCTACGTCGA CAAGGCTGCA TCGCTCAAGC GTTTCACCGC GCGCGCCAAG GGCCGCGGTA ACCGCATCGA GAAGCAATCC TGTCACATCA CTGTGACGGT CGGGAATTAA GGAGCCATAC GATGGGACAG AAAATTCATC CGACTGGCTT CCGCCTGGCT GTCAGCCGCA ATTGGGCTTC GCGTTGGTAC GCGAACAACA ACAATTTCGC
Translation
G K H G R P Q A W R V R T D P Y V Q G S R S R Q E G Q E I R G N Q D F1
E N M V G H K L G E F A L T R T F K G H A A D K K A K K * G A I K F2
K T W S A T S L A S S H * P V R S R V T Q P T R R P R N K G Q S R F3
1 GGAAAACATGGTCGGCCACAAGCTTGGCGAGTTCGCACTGACCCGTACGTTCAAGGGTCACGCAGCCGACAAGAAGGCCAAGAAATAAGGGGCAATCAAG 100
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G S E S N S S R C P H L G A K N A P C G * P D P R F A G R Q G A E F1
M E V K A I H R G A R I S A Q K T R L V A D Q I R G L P V D K A L N F2
W K * K Q F I A V P A S R R K K R A L W L T R S A V C R S T R R * F3
101 ATGGAAGTGAAAGCAATTCATCGCGGTGCCCGCATCTCGGCGCAAAAAACGCGCCTTGTGGCTGACCAGATCCGCGGTTTGCCGGTCGACAAGGCGCTGA 200
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R S D V L A E E G G W H R E E G C A V G N R E C G A Q R R R R Y R F1
V L T F S P K K A A G I V K K V V L S A I A N A E H N E G A D I D F2
T F * R S R R R R R L A S * R R L C C R Q S R M R S T T K A P I S T F3
201 ACGTTCTGACGTTCTCGCCGAAGAAGGCGGCTGGCATCGTGAAGAAGGTTGTGCTGTCGGCAATCGCGAATGCGGAGCACAACGAAGGCGCCGATATCGA 300
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R A Q D Q E H L R R Q G C I A Q A F H R A R Q G P R * P H R E A I L F1
E L K I K S I Y V D K A A S L K R F T A R A K G R G N R I E K Q S F2
S S R S R A S T S T R L H R S S V S P R A P R A A V T A S R S N P F3
301 CGAGCTCAAGATCAAGAGCATCTACGTCGACAAGGCTGCATCGCTCAAGCGTTTCACCGCGCGCGCCAAGGGCCGCGGTAACCGCATCGAGAAGCAATCC 400
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S H H C D G R E L R S H T M G Q K I H P T G F R L A V S R N W A S F1
C H I T V T V G N * G A I R W D R K F I R L A S A W L S A A I G L R F2
V T S L * R S G I K E P Y D G T E N S S D W L P P G C Q P Q L G F F3
401 TGTCACATCACTGTGACGGTCGGGAATTAAGGAGCCATACGATGGGACAGAAAATTCATCCGACTGGCTTCCGCCTGGCTGTCAGCCGCAATTGGGCTTC 500
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R W Y A N N N N F A F1
V G T R T T T I S X F2
A L V R E Q Q Q F R F3
501 GCGTTGGTACGCGAACAACAACAATTTCGC 530
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