BACT000050 (rplU) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3356
- contig length
- 316436
- start
- 43350
- end
- 43661
- length
- 312
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CAATCGTGGA TCGGCTTTGA CTCGGCCGCT AACCCCATGT ATAATCACGT GTTTTCCGCG CGTGGTGTGC GGAAAAATTG GATCCAGAGT GAGGTTCTCA ATGTACGCGG TCATAAAAAC CGGCGGCAAG CAGTACAAGG TTGCCGTTGG CGAAAAACTC AAAGTAGAAC AGATACCGGC TGACATTGAC GCTGAAATCA CGCTCGACCA GGTTCTCGCA GTGGGCGAAG GCGAATCGAT TAAGTTCGGT ACGCCGCTGG TCAGTGGGGC TTCCGTCAAG GCCACCGTCG TGTCGCACGG TCGTCATGCC AAGGTCACCA TCTTCAAGAT GCGTCGCCGG AAGCACTACC AAAAGCACGG CGGCCACCGC CAGAACTACA CTGAGCTGCG CATCGACGCG ATCAACGCGT AAGCGCCTCG GTAAAGGAGC AATCAGATGG CACACAAAAA GGCAGGCGGC TCTTCCCGGA ACGGCCGCGA CTCCGAGTCG AAACGTCTCG GCGTGAAAGT GT
Translation
Q S W I G F D S A A N P M Y N H V F S A R G V R K N W I Q S E V L N F1
N R G S A L T R P L T P C I I T C F P R V V C G K I G S R V R F S F2
I V D R L * L G R * P H V * S R V F R A W C A E K L D P E * G S Q F3
1 CAATCGTGGATCGGCTTTGACTCGGCCGCTAACCCCATGTATAATCACGTGTTTTCCGCGCGTGGTGTGCGGAAAAATTGGATCCAGAGTGAGGTTCTCA 100
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V R G H K N R R Q A V Q G C R W R K T Q S R T D T G * H * R * N H F1
M Y A V I K T G G K Q Y K V A V G E K L K V E Q I P A D I D A E I T F2
C T R S * K P A A S S T R L P L A K N S K * N R Y R L T L T L K S F3
101 ATGTACGCGGTCATAAAAACCGGCGGCAAGCAGTACAAGGTTGCCGTTGGCGAAAAACTCAAAGTAGAACAGATACCGGCTGACATTGACGCTGAAATCA 200
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A R P G S R S G R R R I D * V R Y A A G Q W G F R Q G H R R V A R F1
L D Q V L A V G E G E S I K F G T P L V S G A S V K A T V V S H G F2
R S T R F S Q W A K A N R L S S V R R W S V G L P S R P P S C R T V F3
201 CGCTCGACCAGGTTCTCGCAGTGGGCGAAGGCGAATCGATTAAGTTCGGTACGCCGCTGGTCAGTGGGGCTTCCGTCAAGGCCACCGTCGTGTCGCACGG 300
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S S C Q G H H L Q D A S P E A L P K A R R P P P E L H * A A H R R D F1
R H A K V T I F K M R R R K H Y Q K H G G H R Q N Y T E L R I D A F2
V M P R S P S S R C V A G S T T K S T A A T A R T T L S C A S T R F3
301 TCGTCATGCCAAGGTCACCATCTTCAAGATGCGTCGCCGGAAGCACTACCAAAAGCACGGCGGCCACCGCCAGAACTACACTGAGCTGCGCATCGACGCG 400
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Q R V S A S V K E Q S D G T Q K G R R L F P E R P R L R V E T S R F1
I N A * A P R * R S N Q M A H K K A G G S S R N G R D S E S K R L G F2
S T R K R L G K G A I R W H T K R Q A A L P G T A A T P S R N V S F3
401 ATCAACGCGTAAGCGCCTCGGTAAAGGAGCAATCAGATGGCACACAAAAAGGCAGGCGGCTCTTCCCGGAACGGCCGCGACTCCGAGTCGAAACGTCTCG 500
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R E S V F1
V K V X F2
A * K C F3
501 GCGTGAAAGTGT 512
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