BACT000049 (rplT) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3353
- contig length
- 220068
- start
- 15865
- end
- 16224
- length
- 360
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCTGCGCGGC GCAACGGCAG TTCATGATTC CGATCTGAAC TCCGTCCGCG CGATGCTGCC GTTCGCGTAA CCCCTCAACT GATACTCTAA GGAGCGAAAC ATGCCTCGAG TCAAACGTGG GGTAACCGCA CGGGCCCGTC ACAAGAAGAT CATCAACCTG GCCAAGGGTT ATCGCGGCCG TCGCAATAAC GTCTACCGCA TCGCCAAGCA GGCGGTGATG CGCGCTGGCC AGTACGCGTA CCGCGATCGC CGCAACAAGA AACGTGTGTT CCGCGCACTG TGGATCACGC GTATCAACGC GGCAGTTCGC CAGCACGACA TGACCTACAG CGTGTTCATC AACGGCCTGA AGAAGGCGTC GATCGAACTC GACCGTAAGG TGCTGGCCGA CATGGCGGTG TTCGACAAGG CTGCTTTTGC TGCGATCGTC AAGCAGGTGA AAGCCGCCGT TGCAGCCTAA TTGCGAAATT AGCACTGCGT GGTTAGTTGC AGCGATGTTC CGGTAGTTTC GGCCGCTGCA GCGAAAACGG GGCTCTTCCG AGCCCCTTTT TTGTTTGGCG
Translation
P A R R N G S S * F R S E L R P R D A A V R V T P Q L I L * G A K H F1
L R G A T A V H D S D L N S V R A M L P F A * P L N * Y S K E R N F2
C A A Q R Q F M I P I * T P S A R C C R S R N P S T D T L R S E T F3
1 CCTGCGCGGCGCAACGGCAGTTCATGATTCCGATCTGAACTCCGTCCGCGCGATGCTGCCGTTCGCGTAACCCCTCAACTGATACTCTAAGGAGCGAAAC 100
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A S S Q T W G N R T G P S Q E D H Q P G Q G L S R P S Q * R L P H F1
M P R V K R G V T A R A R H K K I I N L A K G Y R G R R N N V Y R I F2
C L E S N V G * P H G P V T R R S S T W P R V I A A V A I T S T A F3
101 ATGCCTCGAGTCAAACGTGGGGTAACCGCACGGGCCCGTCACAAGAAGATCATCAACCTGGCCAAGGGTTATCGCGGCCGTCGCAATAACGTCTACCGCA 200
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R Q A G G D A R W P V R V P R S P Q Q E T C V P R T V D H A Y Q R F1
A K Q A V M R A G Q Y A Y R D R R N K K R V F R A L W I T R I N A F2
S P S R R * C A L A S T R T A I A A T R N V C S A H C G S R V S T R F3
201 TCGCCAAGCAGGCGGTGATGCGCGCTGGCCAGTACGCGTACCGCGATCGCCGCAACAAGAAACGTGTGTTCCGCGCACTGTGGATCACGCGTATCAACGC 300
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G S S P A R H D L Q R V H Q R P E E G V D R T R P * G A G R H G G V F1
A V R Q H D M T Y S V F I N G L K K A S I E L D R K V L A D M A V F2
Q F A S T T * P T A C S S T A * R R R R S N S T V R C W P T W R C F3
301 GGCAGTTCGCCAGCACGACATGACCTACAGCGTGTTCATCAACGGCCTGAAGAAGGCGTCGATCGAACTCGACCGTAAGGTGCTGGCCGACATGGCGGTG 400
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R Q G C F C C D R Q A G E S R R C S L I A K L A L R G * L Q R C S F1
F D K A A F A A I V K Q V K A A V A A * L R N * H C V V S C S D V P F2
S T R L L L L R S S S R * K P P L Q P N C E I S T A W L V A A M F F3
401 TTCGACAAGGCTGCTTTTGCTGCGATCGTCAAGCAGGTGAAAGCCGCCGTTGCAGCCTAATTGCGAAATTAGCACTGCGTGGTTAGTTGCAGCGATGTTC 500
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G S F G R C S E N G A L P S P F F V W R F1
V V S A A A A K T G L F R A P F L F G X F2
R * F R P L Q R K R G S S E P L F C L A F3
501 CGGTAGTTTCGGCCGCTGCAGCGAAAACGGGGCTCTTCCGAGCCCCTTTTTTGTTTGGCG 560
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