BACT000048 (rplS) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3327
- contig length
- 292274
- start
- 179888
- end
- 180280
- length
- 393
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCATGCGTGC GCGGCGCCAG ATGTGAATCC ATCCTCTATC GGGGCCAGGC CTGGAAGCAG GCGGGCGCAA ACGCCGACAA GATGGCTTTA GGAGTCAGTG ATGAATCTGA TTGCAAAACT TGAGCAGGAA GAGATCGAGC GCGCGCTCGC CGGCAAGACG ATCCCCGAAT TCGCCCCGGG CGATACGGTG ATCGTGAACG TGAACGTGGT TGAAGGTAAC CGCAAGCGCG TTCAGGCTTA CGAAGGCGTC GTGATCGCGA TTCGCAACCG CGGCCTGAAC TCGAACTTCA TCGTCCGCAA GATCTCGTCG GGCGAAGGCG TCGAGCGTAC GTTCCAGACC TACTCGCCGC TGCTGGCGAG CATCGTCGTG AAGCGTCGCG GTGACGTGCG TCGTGCGAAG CTGTACTACC TGCGCGAGCG TTCGGGCAAG TCGGCTCGAA TCAAGGAAAA GCTGGTGTCG AAGGATCGCA CGGCAGCCGC TTCCCAAGAG TAAGAGCTGT AAGGAAAAAG CACCCAACCG GGTGCTTTTT TCATTCTGGC GCGACAATAT GCTCGATACG ACACGCGAAC CCGAGAGTCC CATTGAATCG CCG
Translation
A C V R G A R C E S I L Y R G Q A W K Q A G A N A D K M A L G V S D F1
H A C A A P D V N P S S I G A R P G S R R A Q T P T R W L * E S V F2
M R A R R Q M * I H P L S G P G L E A G G R K R R Q D G F R S Q * F3
1 GCATGCGTGCGCGGCGCCAGATGTGAATCCATCCTCTATCGGGGCCAGGCCTGGAAGCAGGCGGGCGCAAACGCCGACAAGATGGCTTTAGGAGTCAGTG 100
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E S D C K T * A G R D R A R A R R Q D D P R I R P G R Y G D R E R F1
M N L I A K L E Q E E I E R A L A G K T I P E F A P G D T V I V N V F2
* I * L Q N L S R K R S S A R S P A R R S P N S P R A I R * S * T F3
101 ATGAATCTGATTGCAAAACTTGAGCAGGAAGAGATCGAGCGCGCGCTCGCCGGCAAGACGATCCCCGAATTCGCCCCGGGCGATACGGTGATCGTGAACG 200
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E R G * R * P Q A R S G L R R R R D R D S Q P R P E L E L H R P Q F1
N V V E G N R K R V Q A Y E G V V I A I R N R G L N S N F I V R K F2
* T W L K V T A S A F R L T K A S * S R F A T A A * T R T S S S A R F3
201 TGAACGTGGTTGAAGGTAACCGCAAGCGCGTTCAGGCTTACGAAGGCGTCGTGATCGCGATTCGCAACCGCGGCCTGAACTCGAACTTCATCGTCCGCAA 300
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D L V G R R R R A Y V P D L L A A A G E H R R E A S R * R A S C E A F1
I S S G E G V E R T F Q T Y S P L L A S I V V K R R G D V R R A K F2
S R R A K A S S V R S R P T R R C W R A S S * S V A V T C V V R S F3
301 GATCTCGTCGGGCGAAGGCGTCGAGCGTACGTTCCAGACCTACTCGCCGCTGCTGGCGAGCATCGTCGTGAAGCGTCGCGGTGACGTGCGTCGTGCGAAG 400
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V L P A R A F G Q V G S N Q G K A G V E G S H G S R F P R V R A V F1
L Y Y L R E R S G K S A R I K E K L V S K D R T A A A S Q E * E L * F2
C T T C A S V R A S R L E S R K S W C R R I A R Q P L P K S K S C F3
401 CTGTACTACCTGCGCGAGCGTTCGGGCAAGTCGGCTCGAATCAAGGAAAAGCTGGTGTCGAAGGATCGCACGGCAGCCGCTTCCCAAGAGTAAGAGCTGT 500
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R K K H P T G C F F H S G A T I C S I R H A N P R V P L N R R F1
G K S T Q P G A F F I L A R Q Y A R Y D T R T R E S H * I A X F2
K E K A P N R V L F S F W R D N M L D T T R E P E S P I E S P F3
501 AAGGAAAAAGCACCCAACCGGGTGCTTTTTTCATTCTGGCGCGACAATATGCTCGATACGACACGCGAACCCGAGAGTCCCATTGAATCGCCG 593
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