BACT000047 (rplR) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 33688
- end
- 34053
- length
- 366
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGGTTACCGT CCGCCGGAGC CCTACAAGGG CAAGGGCGTG CGCTATTCCG ACGAGGTTGT GATCCTCAAA GAAACGAAGA AGAAGTAAGG GTGCGCAATC ATGGATAAGA CTCAATCTCG CCTGCGCCGC GCTCGCCAGA CGCGTATCAA GATCGCTGAG CTGCAGGTCG CGCGTCTCGC CGTGCATCGC ACGAACACGC ACATCTACGC TCAAGTGTTC TCGCCCTGCG GCACCAAGGT GCTCGCCAGC GCGTCGACGC TCGAAGCAGA AGTGCGCGCC GAACTGGCCG ACAAGTCGGG CAAGGGCGGC AACGTTAATG CCGCGACGCT GATCGGCAAG CGTATTGCCG AAAAGGCAAA GGCTGCCGGC ATCGAATCCG TCGCCTTCGA CCGCTCGGGC TTCCGCTACC ACGGCCGCGT CAAGGCGCTG GCTGAGGCAG CTCGCGAAGC TGGGCTCAAG TTCTAAGGGA AGGAATTCGT CATGGCAAAG ATGCAAGCGA AAGTTCAGGC TGACGAACGC GACGACGGCC TTCGCGAAAA GATGATTTCG GTCAATCGCG TGACCA
Translation
R L P S A G A L Q G Q G R A L F R R G C D P Q R N E E E V R V R N H F1
G Y R P P E P Y K G K G V R Y S D E V V I L K E T K K K * G C A I F2
V T V R R S P T R A R A C A I P T R L * S S K K R R R S K G A Q S F3
1 CGGTTACCGTCCGCCGGAGCCCTACAAGGGCAAGGGCGTGCGCTATTCCGACGAGGTTGTGATCCTCAAAGAAACGAAGAAGAAGTAAGGGTGCGCAATC 100
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G * D S I S P A P R S P D A Y Q D R * A A G R A S R R A S H E H A F1
M D K T Q S R L R R A R Q T R I K I A E L Q V A R L A V H R T N T H F2
W I R L N L A C A A L A R R V S R S L S C R S R V S P C I A R T R F3
101 ATGGATAAGACTCAATCTCGCCTGCGCCGCGCTCGCCAGACGCGTATCAAGATCGCTGAGCTGCAGGTCGCGCGTCTCGCCGTGCATCGCACGAACACGC 200
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H L R S S V L A L R H Q G A R Q R V D A R S R S A R R T G R Q V G F1
I Y A Q V F S P C G T K V L A S A S T L E A E V R A E L A D K S G F2
T S T L K C S R P A A P R C S P A R R R S K Q K C A P N W P T S R A F3
201 ACATCTACGCTCAAGTGTTCTCGCCCTGCGGCACCAAGGTGCTCGCCAGCGCGTCGACGCTCGAAGCAGAAGTGCGCGCCGAACTGGCCGACAAGTCGGG 300
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Q G R Q R * C R D A D R Q A Y C R K G K G C R H R I R R L R P L G L F1
K G G N V N A A T L I G K R I A E K A K A A G I E S V A F D R S G F2
R A A T L M P R R * S A S V L P K R Q R L P A S N P S P S T A R A F3
301 CAAGGGCGGCAACGTTAATGCCGCGACGCTGATCGGCAAGCGTATTGCCGAAAAGGCAAAGGCTGCCGGCATCGAATCCGTCGCCTTCGACCGCTCGGGC 400
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P L P R P R Q G A G * G S S R S W A Q V L R E G I R H G K D A S E F1
F R Y H G R V K A L A E A A R E A G L K F * G K E F V M A K M Q A K F2
S A T T A A S R R W L R Q L A K L G S S S K G R N S S W Q R C K R F3
401 TTCCGCTACCACGGCCGCGTCAAGGCGCTGGCTGAGGCAGCTCGCGAAGCTGGGCTCAAGTTCTAAGGGAAGGAATTCGTCATGGCAAAGATGCAAGCGA 500
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S S G * R T R R R P S R K D D F G Q S R D X F1
V Q A D E R D D G L R E K M I S V N R V T X F2
K F R L T N A T T A F A K R * F R S I A * P F3
501 AAGTTCAGGCTGACGAACGCGACGACGGCCTTCGCGAAAAGATGATTTCGGTCAATCGCGTGACCA 566
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