BACT000046 (rplQ) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 27479
- end
- 27874
- length
- 396
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCCTTTAAAA TCCGCATCTT GCCTTTTTCG TTACCGGCCC GTGCACCCGT CGAGGTGCGA TAGAAGAGCT GGATCAAAAC TTTGAATCAA GGAAACTGAA ATGCGCCATC GTCATGGTCT GCGGAAACTG AACCGCACGA GCAGCCACCG TCTGGCTATG CTCCGTAACA TGTCCAACTC GCTGATCGAG CACGAAGTCA TCAAGACGAC GCTGCCGAAG GCGAAGGAAC TCCGTAAAGT CGTCGAGCCG CTGATCACGC TCGGCAAGAA GCCGTCGCTG GCAAACCGTC GCCTGGCATT CAACCGCCTG CGCGATCGTG ACTCGGTCGC GAAGCTGTTC GACGTCCTCG GTCCGCGTTT CGCGAACCGT CCGGGCGGCT ACCTGCGCGT GCTGAAGTTC GGCTTCCGCG TCGGCGACAA CGCACCGATG GCACTGGTCG AGCTGCTCGA TCGTCCGGAA GTCGATGAAA CGGAGAACGT GCAAGAAGCT GAATAAGCTT CGGTACGTAG CAGTATCCGA AAGGGCCGAG CAATTGCTTG GCCCTTTTTG CTTTTTGGCG GCGCCGCGTC GCGATCGATT TTCAGAGGCC GCTGCC
Translation
S F K I R I L P F S L P A R A P V E V R * K S W I K T L N Q G N * N F1
P L K S A S C L F R Y R P V H P S R C D R R A G S K L * I K E T E F2
L * N P H L A F F V T G P C T R R G A I E E L D Q N F E S R K L K F3
1 TCCTTTAAAATCCGCATCTTGCCTTTTTCGTTACCGGCCCGTGCACCCGTCGAGGTGCGATAGAAGAGCTGGATCAAAACTTTGAATCAAGGAAACTGAA 100
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A P S S W S A E T E P H E Q P P S G Y A P * H V Q L A D R A R S H F1
M R H R H G L R K L N R T S S H R L A M L R N M S N S L I E H E V I F2
C A I V M V C G N * T A R A A T V W L C S V T C P T R * S S T K S F3
101 ATGCGCCATCGTCATGGTCTGCGGAAACTGAACCGCACGAGCAGCCACCGTCTGGCTATGCTCCGTAACATGTCCAACTCGCTGATCGAGCACGAAGTCA 200
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Q D D A A E G E G T P * S R R A A D H A R Q E A V A G K P S P G I F1
K T T L P K A K E L R K V V E P L I T L G K K P S L A N R R L A F F2
S R R R C R R R R N S V K S S S R * S R S A R S R R W Q T V A W H S F3
201 TCAAGACGACGCTGCCGAAGGCGAAGGAACTCCGTAAAGTCGTCGAGCCGCTGATCACGCTCGGCAAGAAGCCGTCGCTGGCAAACCGTCGCCTGGCATT 300
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Q P P A R S * L G R E A V R R P R S A F R E P S G R L P A R A E V R F1
N R L R D R D S V A K L F D V L G P R F A N R P G G Y L R V L K F F2
T A C A I V T R S R S C S T S S V R V S R T V R A A T C A C * S S F3
301 CAACCGCCTGCGCGATCGTGACTCGGTCGCGAAGCTGTTCGACGTCCTCGGTCCGCGTTTCGCGAACCGTCCGGGCGGCTACCTGCGCGTGCTGAAGTTC 400
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L P R R R Q R T D G T G R A A R S S G S R * N G E R A R S * I S F F1
G F R V G D N A P M A L V E L L D R P E V D E T E N V Q E A E * A S F2
A S A S A T T H R W H W S S C S I V R K S M K R R T C K K L N K L F3
401 GGCTTCCGCGTCGGCGACAACGCACCGATGGCACTGGTCGAGCTGCTCGATCGTCCGGAAGTCGATGAAACGGAGAACGTGCAAGAAGCTGAATAAGCTT 500
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G T * Q Y P K G P S N C L A L F A F W R R R V A I D F Q R P L P F1
V R S S I R K G R A I A W P F L L F G G A A S R S I F R G R C X F2
R Y V A V S E R A E Q L L G P F C F L A A P R R D R F S E A A A F3
501 CGGTACGTAGCAGTATCCGAAAGGGCCGAGCAATTGCTTGGCCCTTTTTGCTTTTTGGCGGCGCCGCGTCGCGATCGATTTTCAGAGGCCGCTGCC 596
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