BACT000045 (rplP) allele sequence: id-72

Contig position

sequence bin id
3332
contig length
61718
start
37363
end
37779
length
417
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

GTCCGCGCCG TGACGGCGAA GGCGGCGCTC CGGGTGCTCG TCGTGGCGCA CCGCGCCGCG GCGCCGGCAA GCCGGAAGAC GGCAAGACTG GAGAATAACG ATGCTGCAAC CGAAACGCAG GAAGTATCGC AAAGAGCAGA AGGGTCGTAA CACCGGCAAG GCGACGCGCG GCAACGCGGT GTCGTTCGGT GAATTCGGCC TGAAGGCGAT CGGTCGCGGC CGTTTGACCG CGCGTCAAAT TGAAGCAGCG CGTCGTGCAA TGACGCGTCA CATCAAGCGT GGCGGCCGCA TCTGGATCCG GATCTTCCCG GACAAGCCGA TCTCGCAAAA GCCGGCCGAA GTGCGTATGG GTAACGGTAA GGGTAACCCG GAGTACTACG TCGCCGAGAT CCAGCCGGGC AAGATGCTCT ATGAAATGGA CGGCGTAACC GAAGAACTGG CACGCGAAGC GTTCCGTCTG GCTGCAGCGA AGCTGCCGCT GAAGACGGCG TTCATCGTGC GCCAGCTCGG CGCCTAAGGA GAAAACATGA AGGCTTCCGA ACTTCTCCAG AAAGACCAGG CCGCGCTCAA CAAGGAGCTG GCGGACCTGC TGAAGGCGCA ATTCGGCCTG CGCATGC

Translation


          V  R  A  V  T  A  K  A  A  L  R  V  L  V  V  A  H  R  A  A  A  P  A  S  R  K  T  A  R  L  E  N  N  D   F1
           S  A  P  *  R  R  R  R  R  S  G  C  S  S  W  R  T  A  P  R  R  R  Q  A  G  R  R  Q  D  W  R  I  T     F2
            P  R  R  D  G  E  G  G  A  P  G  A  R  R  G  A  P  R  R  G  A  G  K  P  E  D  G  K  T  G  E  *  R    F3
        1 GTCCGCGCCGTGACGGCGAAGGCGGCGCTCCGGGTGCTCGTCGTGGCGCACCGCGCCGCGGCGCCGGCAAGCCGGAAGACGGCAAGACTGGAGAATAACG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  A  T  E  T  Q  E  V  S  Q  R  A  E  G  S  *  H  R  Q  G  D  A  R  Q  R  G  V  V  R  *  I  R  P    F1
          M  L  Q  P  K  R  R  K  Y  R  K  E  Q  K  G  R  N  T  G  K  A  T  R  G  N  A  V  S  F  G  E  F  G  L   F2
           C  C  N  R  N  A  G  S  I  A  K  S  R  R  V  V  T  P  A  R  R  R  A  A  T  R  C  R  S  V  N  S  A     F3
      101 ATGCTGCAACCGAAACGCAGGAAGTATCGCAAAGAGCAGAAGGGTCGTAACACCGGCAAGGCGACGCGCGGCAACGCGGTGTCGTTCGGTGAATTCGGCC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           E  G  D  R  S  R  P  F  D  R  A  S  N  *  S  S  A  S  C  N  D  A  S  H  Q  A  W  R  P  H  L  D  P     F1
            K  A  I  G  R  G  R  L  T  A  R  Q  I  E  A  A  R  R  A  M  T  R  H  I  K  R  G  G  R  I  W  I  R    F2
          *  R  R  S  V  A  A  V  *  P  R  V  K  L  K  Q  R  V  V  Q  *  R  V  T  S  S  V  A  A  A  S  G  S  G   F3
      201 TGAAGGCGATCGGTCGCGGCCGTTTGACCGCGCGTCAAATTGAAGCAGCGCGTCGTGCAATGACGCGTCACATCAAGCGTGGCGGCCGCATCTGGATCCG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          D  L  P  G  Q  A  D  L  A  K  A  G  R  S  A  Y  G  *  R  *  G  *  P  G  V  L  R  R  R  D  P  A  G  Q   F1
           I  F  P  D  K  P  I  S  Q  K  P  A  E  V  R  M  G  N  G  K  G  N  P  E  Y  Y  V  A  E  I  Q  P  G     F2
            S  S  R  T  S  R  S  R  K  S  R  P  K  C  V  W  V  T  V  R  V  T  R  S  T  T  S  P  R  S  S  R  A    F3
      301 GATCTTCCCGGACAAGCCGATCTCGCAAAAGCCGGCCGAAGTGCGTATGGGTAACGGTAAGGGTAACCCGGAGTACTACGTCGCCGAGATCCAGCCGGGC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  A  L  *  N  G  R  R  N  R  R  T  G  T  R  S  V  P  S  G  C  S  E  A  A  A  E  D  G  V  H  R  A    F1
          K  M  L  Y  E  M  D  G  V  T  E  E  L  A  R  E  A  F  R  L  A  A  A  K  L  P  L  K  T  A  F  I  V  R   F2
           R  C  S  M  K  W  T  A  *  P  K  N  W  H  A  K  R  S  V  W  L  Q  R  S  C  R  *  R  R  R  S  S  C     F3
      401 AAGATGCTCTATGAAATGGACGGCGTAACCGAAGAACTGGCACGCGAAGCGTTCCGTCTGGCTGCAGCGAAGCTGCCGCTGAAGACGGCGTTCATCGTGC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           P  A  R  R  L  R  R  K  H  E  G  F  R  T  S  P  E  R  P  G  R  A  Q  Q  G  A  G  G  P  A  E  G  A     F1
            Q  L  G  A  *  G  E  N  M  K  A  S  E  L  L  Q  K  D  Q  A  A  L  N  K  E  L  A  D  L  L  K  A  Q    F2
          A  S  S  A  P  K  E  K  T  *  R  L  P  N  F  S  R  K  T  R  P  R  S  T  R  S  W  R  T  C  *  R  R  N   F3
      501 GCCAGCTCGGCGCCTAAGGAGAAAACATGAAGGCTTCCGAACTTCTCCAGAAAGACCAGGCCGCGCTCAACAAGGAGCTGGCGGACCTGCTGAAGGCGCA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          I  R  P  A  H  A                                                                                       F1
           F  G  L  R  M  X                                                                                      F2
            S  A  C  A  C                                                                                        F3
      601 ATTCGGCCTGCGCATGC 617
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