BACT000044 (rplO) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 32495
- end
- 32929
- length
- 435
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCGAGCTGCA GGATACGCCG GCGGTCCGCG GCATGATCAA CAAGGTCTCG TACCTCGTTA AGGTCATCGC GTAAGCGGCC CTACGGATCA AGGAGTTGAT ATGGAATTGA ATAACCTGAA GCCGGCCGCT GGTGCAAAGC ACGCCAAGCG TCGCGTCGGC CGCGGCATCG GTTCGGGCCT CGGCAAGACG GCTGGCCGTG GTCACAAGGG TCAGAAATCG CGTTCGGGCG GCTTCCACAA AGTCGGTTTC GAAGGCGGTC AGATGCCGCT GCAACGTCGT CTGCCGAAGC GCGGCTTCAC GTCGCTGACG AAGGAATTCG TCGGTGAAGT TCGCCTGGGC GACCTCGAGA AGCTGCCGGT CGATGAAATC GATCTGCTCG CACTGAAGCA AGCCGGCCTG GTCGGCGAGC TGACGAAGAG CGCAAAGATC ATCGCGACGG GCGAACTGAA GCGCAAGATC GTCGTGAAGG GTCTGGGCGC CACCAAGGGT GCGCGCGCTG CGATCGAAGC GGCTGGCGGT TCGTTCGCCG AGTGACACGC GTAGCGCGTC GTTACTTGCA TTCATCGGAG AAGGTACTTG GCTAACAGCC CGAGTCTTGC AAAACCCGGT CGAAGCACGG CGAAATTCGG CGATC
Translation
A S C R I R R R S A A * S T R S R T S L R S S R K R P Y G S R S * Y F1
R A A G Y A G G P R H D Q Q G L V P R * G H R V S G P T D Q G V D F2
E L Q D T P A V R G M I N K V S Y L V K V I A * A A L R I K E L I F3
1 GCGAGCTGCAGGATACGCCGGCGGTCCGCGGCATGATCAACAAGGTCTCGTACCTCGTTAAGGTCATCGCGTAAGCGGCCCTACGGATCAAGGAGTTGAT 100
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G I E * P E A G R W C K A R Q A S R R P R H R F G P R Q D G W P W F1
M E L N N L K P A A G A K H A K R R V G R G I G S G L G K T A G R G F2
W N * I T * S R P L V Q S T P S V A S A A A S V R A S A R R L A V F3
101 ATGGAATTGAATAACCTGAAGCCGGCCGCTGGTGCAAAGCACGCCAAGCGTCGCGTCGGCCGCGGCATCGGTTCGGGCCTCGGCAAGACGGCTGGCCGTG 200
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S Q G S E I A F G R L P Q S R F R R R S D A A A T S S A E A R L H F1
H K G Q K S R S G G F H K V G F E G G Q M P L Q R R L P K R G F T F2
V T R V R N R V R A A S T K S V S K A V R C R C N V V C R S A A S R F3
201 GTCACAAGGGTCAGAAATCGCGTTCGGGCGGCTTCCACAAAGTCGGTTTCGAAGGCGGTCAGATGCCGCTGCAACGTCGTCTGCCGAAGCGCGGCTTCAC 300
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V A D E G I R R * S S P G R P R E A A G R * N R S A R T E A S R P G F1
S L T K E F V G E V R L G D L E K L P V D E I D L L A L K Q A G L F2
R * R R N S S V K F A W A T S R S C R S M K S I C S H * S K P A W F3
301 GTCGCTGACGAAGGAATTCGTCGGTGAAGTTCGCCTGGGCGACCTCGAGAAGCTGCCGGTCGATGAAATCGATCTGCTCGCACTGAAGCAAGCCGGCCTG 400
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R R A D E E R K D H R D G R T E A Q D R R E G S G R H Q G C A R C F1
V G E L T K S A K I I A T G E L K R K I V V K G L G A T K G A R A A F2
S A S * R R A Q R S S R R A N * S A R S S * R V W A P P R V R A L F3
401 GTCGGCGAGCTGACGAAGAGCGCAAAGATCATCGCGACGGGCGAACTGAAGCGCAAGATCGTCGTGAAGGGTCTGGGCGCCACCAAGGGTGCGCGCGCTG 500
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D R S G W R F V R R V T R V A R R Y L H S S E K V L G * Q P E S C F1
I E A A G G S F A E * H A * R V V T C I H R R R Y L A N S P S L A F2
R S K R L A V R S P S D T R S A S L L A F I G E G T W L T A R V L Q F3
501 CGATCGAAGCGGCTGGCGGTTCGTTCGCCGAGTGACACGCGTAGCGCGTCGTTACTTGCATTCATCGGAGAAGGTACTTGGCTAACAGCCCGAGTCTTGC 600
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K T R S K H G E I R R S F1
K P G R S T A K F G D X F2
N P V E A R R N S A I F3
601 AAAACCCGGTCGAAGCACGGCGAAATTCGGCGATC 635
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